2022 Fiscal Year Research-status Report
クルマエビの初期発生段階・雌雄別発現解析による性決定機構の解明
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19K06243
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| Research Institution | Fisheries Research and Education Agency |
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Principal Investigator |
伏屋 玲子 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産技術研究所(長崎), 主任研究員 (40373469)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
坂本 崇 東京海洋大学, 学術研究院, 教授 (40313390)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | クルマエビ / 性連鎖SNPマーカー / 性決定 / GRAS-Di解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
クルマエビの新規ロングリード・ゲノムデータが公開され，そのリファレンスデータを用いて１家系のGRAS-Di解析データだけでなく，複数家系について再解析を行った。それぞれにおいて異なる性連鎖SNPが得られため，これらのSNPマーカーについてプライマーを設計した。また，2021年に海外で性連鎖SNPマーカーが報告されたため，そのマーカーのプライマーも用いて，天然のクルマエビおよび本課題で作成したクルマエビ家系について，PCRおよび電気泳動を行い，シーケンスデータから多型を調べ，解析からこれからの性連鎖SNPマーカーの位置関係についても解析をしている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
コロナ禍で分担研究機関(東京海洋大学)で実験，解析が実施しにくい期間があり，またDNAで複数家系を使用した詳細な解析を行ったため，RNA-seq（外注）の実施ができなかった。
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| Strategy for Future Research Activity |
本課題で得られた性連鎖SNPマーカーを用いて，幼生のDNAによる雌雄判別を行い，RNA-seq解析を実施する。発生段階初期に雌雄差のある遺伝子をリストアップすることにより，性連鎖マーカーと連鎖する候補遺伝子の探索を行う。
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| Causes of Carryover |
コロナ禍での分担機関での実験，解析が困難であった時期があったことから，研究期間の再延長を行ったため，次年度使用額が生じた。コロナが明けたことから，次年度繰越により，実験，解析を進めることで，全額使用が見込まれる。
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Research Products
(2 results)
