ゲノム情報で解き明かすジュズカケハゼ種群の多様性と進化プロセス

2022 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 19K06831
• Research Institution: Fisheries Research and Education Agency
• Principal Investigator: 千葉 悟 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産資源研究所(釧路), 主任研究員 (80599431)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 田畑 諒一 滋賀県立琵琶湖博物館, 研究部, 学芸員 (00793308) ; 渋川 浩一 ふじのくに地球環境史ミュージアム, 学芸課, 教授 (30435739) ; 向井 貴彦 岐阜大学, 地域科学部, 教授 (80377697)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: ジュズカケハゼ種群 / 異種間交雑 / 不和合 / 全ゲノムシーケンス

Outline of Annual Research Achievements

本研究は、ジュズカケハゼ種群の分類と進化的重要単位を明らかにして今後の保全措置に役立てること、種群内で生じているミトコンドリアゲノムの遺伝子浸透の適応的意義と、ミトゲノムと核のミトコンドリア関連遺伝子の不和合を解消するための共進化プロセスを明らかにすることを目的とする。
昨年度までに既存の多数サンプルを使用したMIG-Seq方による縮約ゲノム解析によって、これまで形態情報や断片的な遺伝情報では矛盾する情報が存在するため明らかにできなかった種群各種の輪郭を明らかにすることが出来た。
今年度も全ゲノム解析を実施するための高品質なサンプルを入手するための現地調査を計画したが、COVID19の影響によって実施出来なかった。このため、より高品質なサンプルが必要となる新規レファレンスゲノムの構築を諦め、公開されているハゼ科の他種のゲノム情報をレファレンスとして使用することにした。また、既存のサンプルから比較的状態の良いサンプルを選び出して、全ゲノムシーケンス解析を実施した。その結果、本種群の13個体のゲノム情報を入手吸うことに成功した。現在は、ミトゲノムと核のミトコンドリア関連遺伝子の不和合を解消するための共進化プロセスを明らかにするため、全ゲノムデータの解析を進めている。