ヘリコバクター・シネディの特定のクローンに存在する新規のゲノム修飾の役割解明

2021 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 19K07074
• Research Institution: National Institute of Infectious Diseases
• Principal Investigator: 林原 絵美子 国立感染症研究所, 細菌第二部, 室長 (20349822)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: Phosphorothioate化修飾 / Helicobacter cinaedi / DNA修飾 / メチル化 / Helicobacter / Dnd遺伝子

Outline of Annual Research Achievements

DNAのPhosphorothioate（PT）化修飾は最近近年明らかになった新規のDNA修飾であり，メチル化修飾では塩基がメチル化されるのに対し，PT化修飾ではデオキシリボースを繋ぐリ
ン酸基の酸素が硫黄に置換される．メチル化修飾は外来DNAから自己のDNAを守るRestriction-Modification（RM）システムの一環であるだけでなく，遺伝子の発
現調節を介して病原性や環境適応に寄与している．一方，PT化修飾の役割には不明な点が多い．そこで，本研究ではH. cinaediのPT化修飾が，病原性や環境適応
においてどのような役割を果たしているのかに着目する．
昨年度dnd遺伝子の欠損により優位な発現変動のあった遺伝子Xについて，ノックアウト株を作製し，トランスクリプトーム解析を行ったことから，今年度はdnd遺伝子による発現変動とX遺伝子による発現変動の関連について，詳細な比較解析をおこなった．またトランスクリプトーム解析で発現変動のあった遺伝子について，リアルタイムPCRで発現差を確認した．

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

本年度行う予定であったin vivoおよびin vitroでの評価については来年度行うこととした．

Strategy for Future Research Activity

PT化修飾が病原性に与える影響を評価するため，dnd遺伝子および遺伝子xをノックアウトした株を用いたin vivoおよびin vitro感染実験を進める．

Causes of Carryover

年度末納品等にかかる支払いが令和3年4月1日以降となったため、当該支出分については次年度の実支出額に計上予定。また，本年度行う予定であった実験の一部を翌年度に行うこととした．

Research Products

• [Journal Article] 2 Establishment of a reference panel of Helicobacter pylori strains for antimicrobial susceptibility testing. (2022)
  • Author(s): Kenji Yokota, Takako Osaki, Shunji Hayashi, Shin-Ichi Yokota, Hiroaki Takeuchi, Emiko Rimbara, Hinako Ojima, Toyotaka Sato, Hideo Yonezawa, Keigo Shibayama, Kengo Tokunaga, Shigeru Kamiya, Kazunari Murakami, Mototsugu Kato, Toshiro Sugiyama
  • Journal Title: Helicobacter Volume: Jun;27(3) Pages: e12874
  • DOI: 10.1111/hel.12874
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Non-Helicobacter pylori Helicobacter (NHPH) positive gastric cancer (2022)
  • Author(s): Tomohiko Yasuda, Hyun Seok Lee, Su Youn Nam, Hiroto Katoh, Yuko Ishibashi, Somay Yamagata Murayama, Hidenori Matsui, Hiroki Masuda, Emiko Rimbara, Nobuyuki Sakurazawa, Hideyuki Suzuki, Hiroshi Yoshida, Yasuyuki Seto, Shumpei Ishikawa, Seong Woo Jeon, Masahiko Nakamura, Sachiyo Nomura
  • Journal Title: Sci Rep. Volume: Mar 21;12(1) Pages: 4811
  • DOI: 10.1038/s41598-022-08962-y.
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Presentation] Characterization Of Helicobacter Suis Isolated From Human Stomach (2022)
  • Author(s): Rimbara E, Suzuki M, H. Matsui, M. Nakamura, M. Morimoto, C. Sasakawa, H. Masuda, S. Nomura, T. Osaki, N. Nagata, K. Shibayama, K. Tokunaga
  • Organizer: World Microbe Forum
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] ヒト胃に感染するヘリコバクター・スイスについて (2022)
  • Author(s): 林原絵美子
  • Organizer: 第91回日本感染症学会西日本地方会学術集会、第64回日本感染症学会中日本地方会学術集会
  • Invited
• [Presentation] 3.イヌおよびネコの胃生検組織から分離された2つの新種Helicobacter属菌 (2022)
  • Author(s): 青木 沙恵、鈴木 仁人，森 茂太郎，柴山 恵吾，大野 耕一，見理 剛，林原 絵美子
  • Organizer: 第104回日本細菌学会関東支部総会
• [Presentation] Bacterial and genomic characteristics of non-Helicobacter pylori Helicobacter species, including Helicobacter suis (2022)
  • Author(s): Rimbara E, Suzuki M, Tokunaga K, Mabe K, Nanjo S, Aoki S, Matsui H, Ohno K, Shibayama K, Kenri T.
  • Organizer: 第27回日本ヘリコバクター学会学術集会
  • Invited