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2022 Fiscal Year Research-status Report

ヘリコバクター・シネディの特定のクローンに存在する新規のゲノム修飾の役割解明

Research Project

Project/Area Number 19K07074
Research InstitutionNational Institute of Infectious Diseases

Principal Investigator

林原 絵美子  国立感染症研究所, 細菌第二部, 室長 (20349822)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2024-03-31
KeywordsPhosphorothioate化修飾 / Helicobacter cinaedi / DNA修飾 / メチル化 / Helicobacter / Dnd遺伝子
Outline of Annual Research Achievements

DNAのPhosphorothioate(PT)化修飾は最近近年明らかになった新規のDNA修飾であり,メチル化修飾では塩基がメチル化されるのに対し,PT化修飾ではデオキシリボースを繋ぐリン酸基の酸素が硫黄に置換される.メチル化修飾は外来DNAから自己のDNAを守るRestriction-Modification(RM)システムの一環であるだけでなく,遺伝子の発現調節を介して病原性や環境適応に寄与している.一方,PT化修飾の役割には不明な点が多い.そこで,本研究ではH. cinaediのPT化修飾が,病原性や環境適応においてどのような役割を果たしているのかに着目する.
今年度はCaco-2感染実験での評価とマウス感染実験での評価系を構築を行った。またSMRT法により同定したPT化の標的モチーフ(PT化されているのは一部のモチーフのみ)とトランスクリプトーム解析で発現変動のあった遺伝子について位置関係の解析を行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

評価系構築に時間を要したため。

Strategy for Future Research Activity

病原性への影響の評価の結果を取りまとめ、Helicobacter属菌で初めてPT化標的部位を同定し、その役割について検討した報告として論文化する予定である。

Causes of Carryover

年度末納品等にかかる支払いが令和5年4月1日以降となったため、当該支出分については次年度の実支出額に計上予定。令和4年度分についてはほぼ使用済みである。

  • Research Products

    (5 results)

All 2023 2022

All Journal Article (3 results) (of which Open Access: 2 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] ヒトに感染するHelicobacter属菌について2023

    • Author(s)
      林原 絵美子
    • Journal Title

      日本臨床微生物学会雑誌

      Volume: 33 Pages: 1-11

  • [Journal Article] Characterization of HcaA, a novel autotransporter protein in Helicobacter cinaedi, and its role in host cell adhesion2022

    • Author(s)
      Aoki Sae、Mori Shigetarou、Matsui Hidenori、Shibayama Keigo、Kenri Tsuyoshi、Rimbara Emiko
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: - Pages: 517170

    • DOI

      10.1101/2022.11.18.517170

    • Open Access
  • [Journal Article] Determining Infected Aortic Aneurysm Treatment Using Focused Detection of Helicobacter cinaedi2022

    • Author(s)
      Jien Saito、Emiko Rimbara、Shingo Inaguma、Chihiro Hasegawa、Shinji Kamiya、Akihiro Mizuno、Yoshiaki Sone、Tatsuhito Ogawa、Yukihide Numata、Satoru Takahashi、Miki Asano
    • Journal Title

      Emerging Infectious Diseases

      Volume: 28 Pages: 1494~1498

    • DOI

      10.3201/eid2807.212505

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Characterization of novel autotransporter protein HcaA in Helicobacter cinaedi2022

    • Author(s)
      Sae Aoki, Shigetarou Mori, Hidenori Matsui, Keigo Shibayama, Tsuyoshi Kenri, Emiko Rimbara
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
  • [Presentation] Isolation and characterization of non-Helicobacter pylori Helicobacter species infecting human stomach2022

    • Author(s)
      Emiko Rimbara
    • Organizer
      The 21th International Workshop on Campylobacter, Helicobacter and Related Organisms
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2023-12-25  

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