Analysis of functional RNA structures in the influenza A virus ribonucleoprotein complex

2021 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19K07598
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 49060:Virology-related
• Research Institution: Microbial Chemistry Research Foundation
• Principal Investigator: Takizawa Naoki 公益財団法人微生物化学研究会, 微生物化学研究所, 研究員 (50448502)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2022-03-31
• Keywords: インフルエンザウイルス / RNA二次構造 / RNA高次構造

Outline of Final Research Achievements

The influenza A virus genome is segmented into eight viral RNAs (vRNA). Secondary structures on vRNA are thought to be involved in the viral proliferation process. However, the functional RNA structure on vRNA is not well known. The secondary structure of vRNA in virion is partially unwound by binding viral non-specific RNA binding proteins, NP, in a sequence-independent manner (viral ribonucleoprotein; vRNP). Here, we establish the global map of the vRNA secondary structure in virion. We identified comprehensive secondary structures on vRNP, and mutations within a detected structure affect the replication efficiency of the mutated segment. Furthermore, we showed a more precise structure which is previously predicted to form a pseudoknot structure.

Free Research Field

ウイルス学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

インフルエンザウイルスのvRNP上に形成されるRNA構造について、多くの新規構造を同定した。また、vRNP上に形成されるRNA構造について詳細に検討した結果、これまで構造予想から形成されると考えられていた構造ではなく、異なる構造が形成されていることを明らかとした。今回同定した構造の一部はウイルスRNA合成に関与することを明らかとし、RNA構造-機能の関係について一部解明した。本研究でインフルエンザウイルスゲノム一本鎖RNA領域が明らかとなり、将来的に効率の良いアンチセンス核酸のターゲット部位の決定やRNA構造を標的とした低分子開発に役立てる事ができる。