2021 Fiscal Year Research-status Report
思春期若年成人白血病のクロモスリプシスによる悪性化機構解明とゲノム医療への応用
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19K08310
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| Research Institution | Research Institute for Clinical Oncology Saitama Cancer Center |
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Principal Investigator |
川村 眞智子 地方独立行政法人埼玉県立病院機構埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 病院 臨床検査科, 科長 (80450592)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
金子 安比古 地方独立行政法人埼玉県立病院機構埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 臨床腫瘍研究所, その他 (50373387)
小林 泰文 地方独立行政法人埼玉県立病院機構埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 病院 血液内科, 副病院長 (50455375)
春田 雅之 地方独立行政法人埼玉県立病院機構埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 臨床腫瘍研究所, 研究員 (80392190)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | クロモスリプシス / SNP アレイ / double minutes |
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| Outline of Annual Research Achievements |
背景：クロモスリプシス（染色体破砕；chromothripsis）は近年、次世代シークエンスNGSの発展によって発見された、1～数本の染色体に粉砕と再編成が一度に起きるという新たな発がん機構である。クロモスリプシスが関わるがんは難治で、未だ不明な点が多い。
目的：クロモスリプシス関連白血病の細胞形態、染色体、遺伝子レベルでの特徴を明らかにし、NGSによらない同白血病のスクリーニング法を開発する。
方法：SNPアレイで、クロモスリプシス様白血病を抽出する。NGS、FISH、Peptidenucleicacid (PNA)-FISHを行い、ゲノム損傷修復遺伝子、細胞分裂時の染色体分配に関わる遺伝子異常を中心に網羅的解析を行い、関連を明らかにする。またクロモスリプシス関連白血病の診断法を開発する。
結果：77例の白血病に関してSNParrayを行い、クロモスリプシス様パターンを呈した例について、Oncomine Research Assay、RNA-シークエンス、全ゲノムシークエンスを行った。4例は、核型分析でdouble minutes(DMs)をもち、SNParrayでMYCを含む8q24.13-8q24.21の増幅があり、全例でDMsにMYC遺伝子の増幅が見られた。その中の3例はTP53遺伝子変異と17p欠失があった。AYA世代の2例には、二次性AMLで、新規NUP98-SETBP1融合遺伝子があり、TP53遺伝子変異と17p染色体異常とを持ち、複雑型染色体を持つT-ALLには、新規BCL11B-EVX1融合遺伝子が検出され、T細胞分化に重要なBCL11Bが関わっていた。また検鏡ではそれぞれ微小核を確認できた。
結論：AYA世代白血病にもクロモスリプシスの関与のあるものがあり、いずれも難治性で、これらの症例は、的確に診断し、分子病態を研究し、治療戦略をたてる必要があると考えられた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
論文投稿が遅れているが、これまでの研究内容を投稿準備中である。
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| Strategy for Future Research Activity |
これまでの結果をまとめ現在論文投稿準備中である。また新たに発見された融合遺伝子について、研究を発展させる計画である。複雑型染色体に対象を広げ、クロモスリプシス関連白血病について検査室でより的確に検査できる方法を引き続き検討していく予定である。
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| Causes of Carryover |
学会発表（国際・国内）に計上していた旅費・宿泊費は、オンラインで参加したため、必要なかった。また論文の英文校閲に計上していた予算は、投稿準備中で使用できていないため、次年度に延長手続きを行った。
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Research Products
(8 results)
