2020 Fiscal Year Research-status Report
骨髄増殖性腫瘍とその二次性白血病におけるinitiating変異の同定と機能解析
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19K08835
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Research Institution | Nagoya University |
Principal Investigator |
牛島 洋子 名古屋大学, 医学部附属病院, 病院助教 (60755552)
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Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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Keywords | 骨髄増殖性腫瘍 / 急性骨髄性白血病 |
Outline of Annual Research Achievements |
骨髄増殖性腫瘍(MPN)から転化した二次性急性骨髄性白血病(sAML)における経時的遺伝子変異解析から、MPNとsAMLとが共通して有するinitiating変異の候補とした、3つの遺伝子、すなわち、転写活性化因子ZNF143、クロマチンリモデリング複合体のサブユニットSMARCC2、ユビキチンリガーゼUBR4、および、MPNにおけるドライバー変異であるJAK2、CALR、および、MPLについて、次世代シーケンシング(NGS)によるDNA変異解析系を2019年度に確立した。2020年度、臨床検体の集積においては新たなMPN-sAML3症例ペア検体を集積し、確立したNGSでの解析を臨床検体さらに進めた。また、新たに集積されたMPN-sAML症例においては、骨髄系腫瘍に関与する59遺伝子の変異についても解析を行った。前年度および今年度に集積した計82例の臨床検体において、本研究の端緒となったMPN-sAML症例において認められたZNF143、SMARCC2、UBR4における変異は他症例検体からは検出されなかった。なお、MPNドライバー変異については、症例によりアリル比に相違があり、また、上記の代表的3遺伝子に変異の認められない症例も認められた。MPN-sAML 3症例においては、2例はMPNドライバー変異陽性sAML(JAK2、MPL各1例)、1例はMPNドライバー変異陰性sAMLであり、骨髄系腫瘍に関与する遺伝子変異についての解析結果も合わせ、変異アリル比の変化から、MPNからsAMLへのクローン進展経路を推測し得た。 変異解析が施行された複数のMPN症例において、ZNF143、SMARCC2、UBR4 mRNAの発現が確認され、半定量的解析では症例間に大きな相違は認められなかった。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
臨床検体の集積、および、多数の臨床検体における遺伝子変異の検討はほぼ計画通り進行している。変異遺伝子の機能解析については、臨床検体に おける蛋白発現の評価、変異遺伝子発現細胞株の作製およびその特性解析、移植マウスモデルの作製について計画よりも遅れがみられている。
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Strategy for Future Research Activity |
対象としたZNF143、SMARCC2、UBR4における遺伝子変異は、現在までの80例超のMPNおよびsAML検体からは検出されていない。端緒となった症例における上記変異蛋白発現の有無については解析の意義があると考えるが、変異機能解析については目標変更を検討している。一方で、新たなMPN-sAML症例においても骨髄系腫瘍関連遺伝子の変異解析を行うことでクローン進展がたどれる結果が得られており、臨床検体の集積と遺伝子変異解析についてはさらに進める方針である。
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Causes of Carryover |
変異遺伝子機能解析において、計画内容のうち未施行の事項があり、それに伴い購入を予定していた物品の購入が一部行われなかった。次年度、解析予定を再検討し、変異遺伝子機能解析、または、遺伝子変異解析に要する物品を購入予定である。
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