2019 Fiscal Year Research-status Report
シングルセルRNA解析による間葉系幹細胞のGVHD制御機構とバイオマーカーの探索
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19K16605
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
横山 和明 東京大学, 医科学研究所, 助教 (00647498)
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2019-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 造血幹細胞移植 / 急性移植片対宿主病 / 間葉系幹細胞 / １細胞RNAシーケンス |
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| Outline of Annual Research Achievements |
造血幹細胞移植 (移植)において、合併症である急性移植片対宿主病 (aGVHD)克服は課題である。特に１次治療のステロイド治療への抵抗例は予後不良であり、その克服法の確立は急務である。近年、ステロイド抵抗性aGVHD例に間葉系幹細胞(MSC)療法が高い奏功率を示す事が報告され注目されている。一方、MSC療法には、1)生体内での作用機序が不明、2)治療反応バイオマーカーが存在しない、という致命的な問題がある。そこで本研究では、MSC療法を受けたaGVHD患者を対象とした、治療前後の末梢血免疫細胞の１細胞RNAシーケンス解析(scRNAseq)を行うことで、MSCが誘導していると考えられる、未知のaGVHD制御に関わる免疫細胞集団を同定する事を主な目的としている。この目的の為、2019年度は予定通り、患者末梢血単核球(PBMNC)検体をMSC治療の前後で、臨床研究に登録のあった４名分の検体を保存し、検体収集を行なった。さらに2019年度2Qには10x genomics社のChromium シングルセル キット v3 を購入した。2019年度4Qでは、取集した検体のうち、MSC奏功例(n=2, unique patient number (UPN)-1, 3)、非奏功例(n=1, UPN2)においてMSC投与前３検体、最終投与後の凍結PBMNC 5検体を対象としたscRNAseqを予備検討として行なった。現在8検体のinformatics解析を行っているところであるが、投与前後で免疫細胞集団のprofileの変化、さらにこれらに関与する未知の細胞集団と思われる細胞クラスターの同定に成功するなど有望な結果が得られている。2020年度はさらに８検体の追加解析を行う予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本研究では、MSC療法を受けたaGVHD患者を対象とした、治療前後の末梢血免疫細胞の１細胞RNAシーケンス解析(scRNAseq)を行うことで、MSCが誘導していると考えられる、未知のaGVHD制御に関わる免疫細胞集団を同定する事を主な目的としている。この目的の為、2019年度は予定通り、患者末梢血単核球(PBMNC)検体をMSC治療の前後で、臨床研究に登録のあった４名分の検体を保存し、検体収集を行なった。さらに2019年度2Qには10x genomics社のChromium シングルセル キット v3 を購入した。2019年度4Qでは、取集した検体のうち、MSC奏功例(n=2)、非奏功例(n=1)においてMSC投与前３検体、最終投与後の凍結PBMNC 5検体を対象としたscRNAseqを予備検討として行なった。現在8検体のinformatics解析を行い、データ解析を行っているところであるが、投与前後での免疫細胞集団のprofileの変化、さらにこれらに関与する未知の細胞集団と思われる細胞クラスターの同定に成功するなど有望な結果が得られている。2020年度はさらに８検体の追加解析を行う予定である。
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| Strategy for Future Research Activity |
本年度は引き続き、前述のscRNAseqデータの解析を行う。さらに臨床研究に登録のあった追加２名分(UPN-5, U P N－６)の4検体、さらに前回解析できなかったUPN1,3の測定タイムポイントを増やした解析を行う予定である。
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Research Products
(12 results)
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[Journal Article] Successful clinical sequencing by molecular tumor board in an elderly patient with refractory Sezary syndrome2020
Author(s)
Hijikata K, Yokoyama K (co-1st and co-corresponding author), Yokoyama N, Matsubara Y, Shimizu E, Nakashima M, Yamagishi M, Ota Y, Lim L, Yamaguchi R, Ito M, Tanaka Y, Denda T, Tani K, Yotsuyanagi H, Imoto S, Miyano S, Uchimaru K, Tojo A.
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Journal Title
JCO Precis Oncol
Volume: 4
Pages: 534-560
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] An Unusually Short Latent Period of Therapy-Related Myeloid Neoplasm Harboring a Rare MLL-EP300 Rearrangement: Case Report and Literature Review2019
Author(s)
Takeda R, Yokoyama K (corresponding author), Kobayashi S, Kawamata T, S Nakamura, Tomofusa F, Ito M, Yusa N, Shimizu E, Ohno N, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S, Uchimaru K, and Tojo A.
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Journal Title
Case Rep Hematol
Volume: epub
Pages: 4532434
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Prognostic impact of circulating tumor DNA status post-allogeneic hematopoietic stem cell transplantation in AML and MDS.2019
Author(s)
Nakamura S, Yokoyama K (co-1st and co-corresponding author), Shimizu E, Yusa N, Kondoh K, Ogawa M, Takei T, Kobayashi A, Ito M, Isobe M, Konuma T, Kato S, Kasajima R, Wada Y, Inoue-Nagamura T, Yamaguchi R, Takahashi S, Imoto S, Miyano S, and Tojo A.
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Journal Title
Blood
Volume: 133
Pages: 2682-2695
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] The first case of elderly TCF3-HLF-positive B-cell acute lymphoblastic leukemia.2019
Author(s)
Takeda R, Yokoyama K (corresponding author), Ogawa M, Kawamata T, Tomofusa F, Kondoh K, Tomomi T, Nakamura S, Ito M, Yusa N, Shimizu E, Ohno N, Uchimaru K, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S, and Tojo A.
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Journal Title
Leuk lymphoma.
Volume: 60
Pages: 2821-2824
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Presentation] 治療関連骨髄系腫瘍15例のゲノム解析と液体生検によるファウンダークローンの後方視的追跡2019
Author(s)
近藤 幹也, 横山 和明, 遊佐 希, 伊藤 美香, 清水 英悟, 中村 聡介, 小川 弥穂, 武井 智美, 小林 麻子, 笠島 理加, 和田 結花, 山口 類, 井元 清哉, 長村 登紀子, 内丸 薫, 宮野 悟, 東條 有伸
Organizer
第81回日本血液学会学術集会
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[Presentation] 臨床シークエンスにて確定診断に至った慢性好中球性白血病の２例2019
Author(s)
小川 弥穂, 横山 和明, 塚田 信弘, 余語 孝夫3, 近藤 幹也, 武井 智美, 中村 聡介, 伊藤 美香, 小林 麻子, 遊佐 希, 山本 茉子, 笠島 理加, 清水 英悟, 山口 類, 井元 清哉, 宮野 悟, 東條 有伸
Organizer
第81回日本血液学会学術集会 Presidential シンポジウム
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[Presentation] The utility of exome sequence of circulating tumor DNA in drug-resistant and/or advanced phase chronic myeloid leukemia2019
Author(s)
omomi Takei, Kazuaki Yokoyama, Sousuke Nakamura, Miho Ogawa, Kanya Kondoh, Eigo Shimizu, Rika Kasajima, Rui Yamaguchi, Seiya Imoto, Satoru Miyano, Arinobu Tojo
Organizer
The 78th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
Int'l Joint Research
