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2021 Fiscal Year Annual Research Report

食道癌における包括的ゲノム情報と画像情報の融合:Radiogenomicsの実践

Research Project

Project/Area Number 19K17130
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

横田 元  千葉大学, 大学院医学研究院, 講師 (20649280)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Keywords食道癌 / 扁平上皮癌 / Radiogenomics / Epigenomics
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、食道癌の強力な予後規定因子でありmicroRNA-1246をCT画像から予測することで、TNM分類よりも強い予後規定因子を作り出すことができた。 microRNA-1246はDNAを修飾することによって、遺伝子発現を調節する役割があり、いわゆるepigenome情報といえる。画像とepigenome情報の融合として、 radioepigenomicsの実現に一歩近づくことができた。この成果は、Hoshino I*, Yokota H*, Ishige F, et al. Radiogenomics predicts the expression of microRNA-1246 in the serum of esophageal cancer patients. Sci Rep. nature.com; 2020;10(1):2532. (* equal contribution)として論文発表し、北米放射 線学会や日本医学放射線学会で学会発表を行った。 また、同様の手法を膵癌、大腸癌に応用し、論文発表を行った。
本年度は昨年度に引き続き、様々な臨床情報を統合することで、より精度の高い予後予測が行えるかの研究を遂行した。身体所見、一般的な血液検査から5年後生存を85%程度の精度で予測可能であった。また、臨床情報を非教師的に3郡クラスタリングを行ったところ、どのクラスターに属しているかは、既知の予後規定因子とは独立した因子であることを見い出した。TNM分類による病期が同じでも、どのクラスターに属しているかで予後良好群と不良群に分けることが可能であった。例えばステージ1であっても予後不良であることが日常臨床から得られる臨床データから予測することが可能であることを意味する。現在、この成果について論文作成中である。

  • Research Products

    (3 results)

All 2022 2021

All Journal Article (3 results)

  • [Journal Article] Machine learning with imaging features to predict the expression of ITGAV, which is a poor prognostic factor derived from transcriptome analysis in pancreatic cancer2022

    • Author(s)
      Iwatate Yosuke、Yokota Hajime、Hoshino Isamu、Ishige Fumitaka、Kuwayama Naoki、Itami Makiko、Mori Yasukuni、Chiba Satoshi、Arimitsu Hidehito、Yanagibashi Hiroo、Takayama Wataru、Uno Takashi、Lin Jason、Nakamura Yuki、Tatsumi Yasutoshi、Shimozato Osamu、Nagase Hiroki
    • Journal Title

      International Journal of Oncology

      Volume: 60 Pages: 1~13

    • DOI

      10.3892/ijo.2022.5350

  • [Journal Article] Prediction of the differences in tumor mutation burden between primary and metastatic lesions by radiogenomics2021

    • Author(s)
      Hoshino Isamu、Yokota Hajime、Iwatate Yosuke、Mori Yasukuni、Kuwayama Naoki、Ishige Fumitaka、Itami Makiko、Uno Takashi、Nakamura Yuki、Tatsumi Yasutoshi、Shimozato Osamu、Nagase Hiroki
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 113 Pages: 229~239

    • DOI

      10.1111/cas.15173

  • [Journal Article] Deep learning-based gene selection in comprehensive gene analysis in pancreatic cancer2021

    • Author(s)
      Mori Yasukuni、Yokota Hajime、Hoshino Isamu、Iwatate Yosuke、Wakamatsu Kohei、Uno Takashi、Suyari Hiroki
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Pages: 1~9

    • DOI

      10.1038/s41598-021-95969-6

URL: 

Published: 2022-12-28  

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