Investigation of host factors which regulate HBV replication using single cell RNA-sequencing

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19K17488
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 53010:Gastroenterology-related
• Research Institution: Osaka International Cancer Institute (2020-2022); Osaka University (2019)
• Principal Investigator: Nakabori Tasuku 地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪国際がんセンター(研究所), その他部局等, 肝胆膵内科副部長 (60795160)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: B型肝炎 / アミノ酸代謝

Outline of Final Research Achievements

HBsAg-positive and -negative cells are heterogeneously distributed in the liver of hepatitis B patients. PgRNA, cccDNA, and BCAT2 (branched chain amino-acid transaminase 2) were significantly higher in the region where HBsAg-positive cells are clustered than in the region where HBsAg-negative cells are clustered.
It was possible to isolate single cells from non-cirrhotic liver with a high viability of about 80% using the liberase perfusion method. On the other hand, the viability of single cells isolated from cirrhotic liver was only about 30%. It was suggested that the viability of cells isolated from the liver may depend on background liver inflammation or fibrosis.

Free Research Field

B型肝炎

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

癌細胞では、近年代謝リプログラミングとして、アミノ酸代謝が癌細胞の生存や分裂増殖、転移などに必要なエネルギーやタンパク質・核酸などの供給に関与していることが報告された（Hattori A, et al. Nature. 2017）が、B型肝炎ウイルス複製においても分岐鎖アミノ酸代謝が関与している可能性が示唆された。
リベラ―ゼ灌流法では、非硬変肝からは高い生細胞率にて単一細胞を分離することができたが、硬変肝から単一分離した細胞では高い生細胞率を維持することはできなかった。線維化や炎症の程度が強い肝臓からの単一細胞分離の手法について改善や見直しが必要があると考えられた。