Elucidation of pathogenesis by the gene expression

2020 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19K17805
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 53050:Dermatology-related
• Research Institution: University of the Ryukyus
• Principal Investigator: HAYASHI KENTARO 琉球大学, 病院, 助教 (50631991)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2021-03-31
• Keywords: ハンセン病 / らい菌 / 多菌型ハンセン病 / 少菌型ハンセン病 / トランスクリプトーム解析

Outline of Final Research Achievements

In this study, we attempted to extract transcriptome data from patients diagnosed with Hansen’s disease at the Department of Dermatology, University of the Ryukyus. We were able to extract data from 7 out of 63 samples (4 with Multibacillary type and 3 with Paucibacillary type). The mean mapped read count for the genome of Mycobacterium leprae was 2396.5 for the four samples of the Multibacillary type group and 8.7 for the three samples of the Paucibacillary type group. This result supported the correctness of the classification of Multibacillary and Paucibacillary types. We compared the gene expression between the two groups. As a result, about 166 genes (p<0.01, highly expressed in the Multibacillary type group: 117 genes, highly expressed in the Paucibacillary type group: 49 genes) were found to be differentially expressed between the two groups and were extracted as candidate genes.

Free Research Field

皮膚感染症

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

今回の解析により得られた候補遺伝子により、これまで説明できなかった、宿主により多菌型、少菌型と極めて異なる臨床像を呈するハンセン病の特殊性を解明する糸口になると期待できる。ハンセン病の発症機序の解明は、皮膚結核やブルリ潰瘍などの抗酸菌感染症と、それらに対する生体の反応を理解するきっかけになると考えられる。現在は、ハンセン病の新規発症は日本では年間数例程度であるが、世界では年間20万人の新規発症があり、ほとんどが途上国、貧困層を中心に流行している。顧みられない熱帯病の一つとして位置付けられ、WHOを中心に診断、治療、啓蒙活動が行われている。かつてハンセン病が多発した沖縄で行うべき研究課題である。