2020 Fiscal Year Final Research Report
Development of rapid diagnostic tools for respiratory infections in children by using portable sequencer with direct RNA sequencing
Project/Area Number |
19K17935
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Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Basic Section 54030:Infectious disease medicine-related
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Research Institution | Saitama Medical University |
Principal Investigator |
Kazuo Imai 埼玉医科大学, 医学部, 非常勤講師 (10816606)
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Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2021-03-31
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Keywords | 次世代シーケンサー / 呼吸器感染症 / ウイルス / メタゲノム解析 |
Outline of Final Research Achievements |
In this study, we aimed to develop a technology for detecting viruses which cause respiratory infections in children and adults by Flongle nanopore sequencer with metagenomics sequencing. Computer analysis of the obtained sequence reads allows to diagnosis with viruses in clinical specimens taken by the patients. The assembly analysis showed almost complete genome of viruses in clinical specimens., This study will contribute to provide the comprehensive diagnostic tools for detecting viruses in various clinical specimens by Flongle nanopore sequencer.
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Free Research Field |
感染症学
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Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本研究の成果は、呼吸器ウイルスの診断とウイルスゲノム解析に活用できる検査法に留まらず、様々なウイルス感染症診断に展開できるウイルス同定技術へと発展できる可能性がある。この成果により、これまで診断が困難であったウイルス感染症を安価かつ簡便に同定することができ、診断および実際の治療に役立つ可能性があることに加え、病態に関連する可能性のあるウイルスゲノム解析を行えるツールとなり得ることに意義がある。併せて、新興感染症としてパンデミックを起こした新型コロナウイルス感染症の新たな診断法としても、国内の感染症対策に寄与する可能性がある。
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