Detection of tumor-specific antigen of highly prevalent angiosarcoma in Okinawa by comprehensive transcriptome analysis

2019 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19K21277
• Project/Area Number (Other): 18H06168 (2018)
• Research Category: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• Allocation Type: Multi-year Fund (2019); Single-year Grants (2018)
• Review Section: 0901:Oncology and related fields
• Research Institution: University of the Ryukyus
• Principal Investigator: UTSUMI DAISUKE 琉球大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (40551958)
• Project Period (FY): 2018-08-24 – 2020-03-31
• Keywords: 血管肉腫 / バイオインフォマティクス / 次世代シーケンサ / 免疫チェックポイント阻害剤 / SIRPα / CD47

Outline of Final Research Achievements

We performed differential gene expression analysis between angiosarcoma tumor samples obtained from 5 long-term survivors (> 3 years) and 4 short survivors (< 1 year) based on the transcriptome data. RNA extracted from FFPE samples were used for the transcriptome analysis as we discovered the high correlation between gene expression profile of frozen and FFPE samples. Among genes associated with immune checkpoint, SIRPα,which inhibits macrophage phagocytic activity, was significantly lowly expressed in long-term survivors.

Free Research Field

皮膚科学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

血管肉腫は高齢者に好発する疾患であり、高齢化社会の進展と共に本邦でも患者数が増加している。一方で全悪性腫瘍の0.01%程の希少な悪性腫瘍であるため、大規模な臨床試験が行われておらず、エビデンスレベルの高い治療方法は限られているのが現状である。今回の研究により、短期および長期生存患者腫瘍の群間に、免疫チェックポイントに関連する遺伝子群のうちSIRPα発現に統計学的に優位な差があることを見出した。血管肉腫の病態におけるSIRPαの役割を更に検討することで、今後増加が予測される頭部血管肉腫に対する免疫チェックポイント阻害剤などの分子標的薬を含む新たな治療法導入の足がかりとなる可能性がある。