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2019 Fiscal Year Research-status Report

必須遺伝子ロスを補う潜在的代替機構の網羅的探索

Research Project

Project/Area Number 19K22383
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

五島 剛太  名古屋大学, 理学研究科, 教授 (20447840)

Project Period (FY) 2019-06-28 – 2022-03-31
Keywords分裂酵母必須遺伝子
Outline of Annual Research Achievements

近年、モデル生物種では生育に必須であると示された遺伝子が、別の種では進化の過程で失われるという例が数多く認められた。これは、生物種によっては、必要不可欠と思われていた遺伝子がなくとも増殖可能であることを意味しており、その生物種には必須遺伝子がなくとも増殖を可能にする未発見の仕組みが存在することを示唆している。本研究では、真核細胞内の必須活動には、よく知られた「主要機構」だけでなく、これまで見逃されてきた「サブ機構」が存在し、特定の細胞種や環境下ではサブ機構が極めて重要な役割を担うという仮説を立てる。そして単細胞真核生物・分裂酵母を用いてこの機構の網羅的同定に挑み、細胞に備わった機構の全貌を解明する基盤の確立を目指す。
19年度は、92の必須遺伝子について、常法に従い相同組換えにより必須遺伝子を1コピー分、2倍体の分裂酵母から取り除いた(薬剤耐性マーカーで置き換える)。得られた酵母を減数分裂させ1倍体胞子を単離し、薬剤含有培地に蒔く。必須遺伝子が破壊されているため酵母は通常増殖することができないが、紫外線を当ててゲノムに任意の変異を導入することで、増殖する酵母株を探索した。その結果、20もの遺伝子について、他の遺伝子を人為的に変異せることで、本来なら増殖不可能な酵母の増殖能を回復させられた。一部のケースにいて酵母ゲノムのDNA配列を解析したところ、未知だった代替機能が亢進した可能性が示唆された。たとえば、ミトコンドリア遺伝子の欠失株の致死性は、タンパク質分解系の遺伝子の変異により消えた(Takeda et al. Cell Struct Funct. 2019)。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究の目標のひとつにしていた重要な研究成果を論文として発表できたため。

Strategy for Future Research Activity

研究は順調に進んでおり、今後も当初の計画に沿って実験を進める。

Causes of Carryover

消耗品にかかる費用や論文出版料を節約できたため未使用額が生じた。消耗品購入に使用予定。

  • Research Products

    (3 results)

All 2019 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] エディバラ大学(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      エディバラ大学
  • [Journal Article] Identification of 15 New Bypassable Essential Genes of Fission Yeast2019

    • Author(s)
      Takeda Aoi、Saitoh Shigeaki、Ohkura Hiroyuki、Sawin Kenneth E.、Goshima Gohta
    • Journal Title

      Cell Structure and Function

      Volume: 44 Pages: 113~119

    • DOI

      10.1247/csf.19025

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Remarks] 五島研究室ホームページ

    • URL

      http://bunshi4.bio.nagoya-u.ac.jp/~tenure2/goshima.html

URL: 

Published: 2021-01-27  

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