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2021 Fiscal Year Annual Research Report

「ユビキチンコード」解明へ向けたポリユビキチン化基質の網羅的同定

Research Project

Project/Area Number 19K22408
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

渡部 昌  北海道大学, 医学研究院, 講師 (10632424)

Project Period (FY) 2019-06-28 – 2022-03-31
Keywordsユビキチン
Outline of Annual Research Achievements

①K63ポリユビキチン鎖を特異的に捕獲する新規プローブの作製: K63鎖を特異的に認識する新たなヒト遺伝子由来のドメインを直列に4つ、柔軟性の高いポリグリシンのリンカーで連結した。大腸菌を利用してこのプローブタンパク質を作製することができたため、各鎖との結合特異性をテトラユビキチン鎖(M1, K6, K11, K29, K33, K48, K63鎖)を用いたプルダウン法によって検証を行った。単量体のドメインが認識する、K63鎖との強い結合を認めたものの、予想に反しK48鎖との結合、およびK6鎖との弱い結合を認めた。この結果は、前年に作製した別種のK63鎖を特異的に認識するドメインを用いてプローブを作製した際の結果と類似していた。双方のドメインは別種のファミリーに属するドメインであるが、ポリユビキチン鎖認識の規則性をうかがわせる結果となった。
②K6ポリユビキチン鎖およびK11ポリユビキチン鎖を特異的に捕獲する新規プローブの作製: K6鎖およびK11鎖を特異的に認識する新たなヒト遺伝子由来のドメインを直列に4つ、柔軟性の高いポリグリシンのリンカーで連結した。大腸菌を利用してこのプローブタンパク質を作製することができたため、各鎖との結合特異性をテトラユビキチン鎖(M1, K6, K11, K29, K33, K48, K63鎖)を用いたプルダウン法によって検証を行ったところ、予想に反し、単量体のドメインが認識する、K6鎖およびK11鎖との結合を認めず、K63鎖との強く特異的な結合を認めた。

  • Research Products

    (5 results)

All 2021

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Fluticasone Propionate Suppresses Poly(I:C)-Induced ACE2 in Primary Human Nasal Epithelial Cells2021

    • Author(s)
      Nakazono Akira、Nakamaru Yuji、Ramezanpour Mahnaz、Kondo Takeshi、Watanabe Masashi、Hatakeyama Shigetsugu、Kimura Shogo、Honma Aya、Wormald P. J.、Vreugde Sarah、Suzuki Masanobu、Homma Akihiro
    • Journal Title

      Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

      Volume: 11 Pages: 655666

    • DOI

      10.3389/fcimb.2021.655666

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Loss of FAM83H promotes cell migration and invasion in cutaneous squamous cell carcinoma via impaired keratin distribution2021

    • Author(s)
      Tokuchi Keiko、Kitamura Shinya、Maeda Takuya、Watanabe Masashi、Hatakeyama Shigetsugu、Kano Satoshi、Tanaka Shinya、Ujiie Hideyuki、Yanagi Teruki
    • Journal Title

      Journal of Dermatological Science

      Volume: 104 Pages: 112~121

    • DOI

      10.1016/j.jdermsci.2021.09.007

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] A substrate-trapping strategy to find E3 ubiquitin ligase substrates.2021

    • Author(s)
      Watanabe Masashi
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting on the Ubiquitin Family
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] TRIM28はサイクリンA2のユビキチン化を介しS期への早期進行を抑制する2021

    • Author(s)
      渡部 昌, 畠山鎮次
    • Organizer
      第94回日本生化学会大会
  • [Presentation] 基質トラップ戦略によるユビキチンリガーゼParkin、TRIM28の網羅的な基質同定2021

    • Author(s)
      渡部 昌, 畠山鎮次
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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