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2021 Fiscal Year Research-status Report

Quantitative evaluation of cell-substrate interactions

Research Project

Project/Area Number 19K22967
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

出口 真次  大阪大学, 基礎工学研究科, 教授 (30379713)

Project Period (FY) 2019-06-28 – 2023-03-31
Keywords干渉反射顕微鏡法 / 共焦点顕微鏡法 / 細胞工学 / 細胞膜
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、細胞-基質間動的相互作用の絶対計測法として、干渉反射顕微鏡法(反射干渉顕微鏡法:RICM, reflection interference contrast microscopy)の改良を行う。これまでに三つの異なるレーザー波長を用いて球体ポリスチレンビーズの反射干渉像を取得した。本年度は特に光学に基づく理論解析に大幅な改良を行い、様々な誤差要因をそれぞれ定量的に検証できるようにした。この3波長RICM法では、三波長それぞれの強度の比について唯一解の得られる条件に基づき、ポリスチレンビーズ(本方法の妥当性を検証するためのマイクロメートルサイズの人工微小物体)の絶対位置の評価を行うものであるが、その3次元形状をナノメートル精度で評価できることを確認した。本内容についてデータをまとめ、投稿論文として準備中である。前年度に作製したピエゾアクチュエーター駆動ステージは、その微細制御自体が誤差要因になりうる可能性が挙げられたために、やむを得ずそのさらなる利用は断念することにした。すなわち、これまでに開発した光学理論に実用的な補正を加えることで誤差を最小化することに取り組んだ。さらに生きた細胞の底面についても測定を行い、形状の概形を把握できることまでは確認したが、測定対象の一定の高さ以上の部分においては誤差の多くなること、また、低い高さ領域においても確実に絶対計測を実現できていることまでは断言しきれなかった。現在はさらに個々の誤差発生要因を特定し、その定量的検証と条件出し実験を並行して行っている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

微小人工物の幾何形状の絶対測定は概ね実現することができた。一方、細胞の形状計測はさらなる検証を重ねている。

Strategy for Future Research Activity

まずは微小人工物の幾何形状の絶対測定データをまとめ、投稿論文として国際専門誌に発表を行う。細胞の形状計測は人工物との反射率の違い等の諸要素を検討し、これまでに開発した理論に実用的な補正を付加して検証を続ける。

Causes of Carryover

コロナウイルスへの対応のために実験計画や成果発表計画に遅れが生じた。翌年度はこれらを適宜終了させて、計画を完遂する。

  • Research Products

    (15 results)

All 2022 2021 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 8 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Analysis of senescence-responsive stress fiber proteome reveals reorganization of stress fibers mediated by elongation factor eEF2 in HFF-1 cells2022

    • Author(s)
      Liu, S., Matsui, T.S., Kang, N., Deguchi, S.
    • Journal Title

      Molecular Biology of the Cell

      Volume: 33 Pages: ar10, 1-11

    • DOI

      10.1091/mbc.E21-05-0229

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ARHGAP4-SEPT2-SEPT9 complex enables both up- and down-modulation of integrin-mediated focal adhesions, cell migration, and invasion2021

    • Author(s)
      Kang, N., Matsui, T.S., Liu, S., Deguchi, S.
    • Journal Title

      Molecular Biology of the Cell

      Volume: 32 Pages: ar28, 1-12

    • DOI

      10.1091/mbc.E21-01-0010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Determining the domain-level reaction-diffusion properties of an actin-binding protein transgelin-2 within cells2021

    • Author(s)
      Saito, T., Matsunaga, D., Matsui, T.S., Noi, K., Deguchi, S.
    • Journal Title

      Experimental Cell Research

      Volume: 404 Pages: 112619

    • DOI

      10.1016/j.yexcr.2021.112619

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mechanosensitive myosin II but not cofilin primarily contributes to cyclic cell stretch-induced selective disassembly of actin stress fibers2021

    • Author(s)
      Huang, W., Matsui, T.S., Saito, T., Kuragano, M., Takahashi, M., Kawahara, T., Sato, M., Deguchi, S.
    • Journal Title

      American Journal of Physiology Cell Physiology

      Volume: 320 Pages: C1153-C1163

    • DOI

      10.1152/ajpcell.00225.2020

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Statistical profiling reveals correlations between the cell response to and structural sequence of Rho-GAPs2021

    • Author(s)
      Kang, N., Matsui, T.S., Deguchi, S.
    • Journal Title

      Cytoskeleton

      Volume: 78 Pages: 67-76

    • DOI

      10.1002/cm.21659

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Machine learning-based detection of cellular forces and its application to drug screening2021

    • Author(s)
      Shinji Deguchi
    • Organizer
      International Conference on Future Healthcare and Economic Development
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Cellular adaptation to mechanical environment2021

    • Author(s)
      Shinji Deguchi
    • Organizer
      MEI-Center Summer School 2021
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Wrinkle force microscopy: a machine learning-based approach to evaluate cellular forces2021

    • Author(s)
      Shinji Deguchi
    • Organizer
      DevMech Webinar
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 細胞の力のホメオスタシス、細胞の力のアッセイ2021

    • Author(s)
      出口真次
    • Organizer
      京大ウイルス再生研生体材料学分野・セミナー
    • Invited
  • [Presentation] ストレスファイバーの熱力学2021

    • Author(s)
      出口真次
    • Organizer
      第33回バイオエンジニアリング講演会
    • Invited
  • [Presentation] 細胞による力学環境への適応のメカニズム2021

    • Author(s)
      出口真次
    • Organizer
      MMDS・AIMap研究会
    • Invited
  • [Presentation] シグナル伝達, 数理モデルに基づく細胞計測2021

    • Author(s)
      出口真次
    • Organizer
      生物物理学会サブグループ・メカノバイオロジー研究会
    • Invited
  • [Presentation] バイオメカニクスの最前線ー細胞の恒常性を理解するー2021

    • Author(s)
      出口真次
    • Organizer
      次世代医療システム産業化フォーラム
    • Invited
  • [Book] 筋細胞を用いた筋機能の定量的評価: 創薬や身体トレーニングの開発への応用2021

    • Author(s)
      眞鍋康子,濱口裕貴,出口真次,松井翼
    • Total Pages
      6
    • Publisher
      実験医学
    • ISBN
      9784758104005
  • [Remarks] 大阪大学大学院基礎工学研究科・出口研究室

    • URL

      http://mbm.me.es.osaka-u.ac.jp

URL: 

Published: 2022-12-28  

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