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2020 Fiscal Year Annual Research Report

神経線維腫症2型における腫瘍微小環境免疫ゲノム解析による腫瘍増大の分子基盤の解明

Research Project

Project/Area Number 19K24023
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

寺西 裕  東京大学, 医学部附属病院, 助教 (50844635)

Project Period (FY) 2019-08-30 – 2021-03-31
Keywords神経線維腫症2型(NF2) / 腫瘍微小環境 / RNAシークエンス / 免疫染色
Outline of Annual Research Achievements

神経線維腫症2型(NF2)は脳腫瘍が多発する予後不良な遺伝性疾患で、現在でも根治治療法が存在していない。NF2遺伝子の生殖細胞変異により細胞増殖カスケードが抑制機能を失うことが原因とされている。このカスケードを標的にした既知の分子標的治療薬は根治的ではなく、よってNF2腫瘍増大の分子基盤を解明や、新しい分子標的の探索が急務である。我々はこれまでに本邦で初めてNF2に関する網羅的遺伝子解析を行い、非腫瘍細胞のNF2変異、すなわち腫瘍微小環境がNF2関連腫瘍の増大に強く影響している可能性を発見した。本研究の目的はNF2関連腫瘍の腫瘍免疫に関する免疫ゲノム解析・マルチオミクス解析から、腫瘍内の細胞分画や微小環境の評価を通じ、NF2関連腫瘍増大の分子メカニズムを解明することである。
(A)腫瘍凍結検体RNA抽出及びRNA-seq. (2019年度中):2019年度中にNF2患者、NF2モザイク患者、非NF2患者の聴神経腫瘍凍結検体をそれぞれ10検体ずつからRNAを抽出する。またRNAシークエンスは外注する>RNAシークエンス32検体が終了している。
(B)RNA-seq.data解析(t-SNE法, CIBERSORT, xCell)による腫瘍内細胞分画評価(2019-20年度中):2019年途中からRNA-seqデータが得られ次第、それぞれの解析ツールを用いて腫瘍内細胞分画を評価する。2020年度中には解析を終了する。>解析データから予定通り、tSNE, PCA, GSEA, hearmap, CIBERSORT, xCell, ESTIMATE, ssGSEAにて腫瘍微小環境を解析した。また得られた解析結果を32検体に対する免疫染色を行った。
臨床データおよびgermlin NF2 mutation status, 腫瘍のmRNAデータ、免疫染色の結果を用いて現在論文を作成中である。

  • Research Products

    (6 results)

All 2020

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Targeted deep sequencing of DNA from multiple tissue types improves the diagnostic rate and reveals a highly diverse phenotype of mosaic neurofibromatosis type 22020

    • Author(s)
      Teranishi Yu、Miyawaki Satoru、Hongo Hiroki、Dofuku Shogo、Okano Atsushi、Takayanagi Shunsaku、Ota Takahiro、Yoshimura Jun、Qu Wei、Mitsui Jun、Nakatomi Hirofumi、Morishita Shinichi、Tsuji Shoji、Saito Nobuhito
    • Journal Title

      Journal of Medical Genetics

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1136/jmedgenet-2020-106973

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Characteristics of Mosaic Neurofibromatosis type 2 Revealed by Deep Sequence for Multiple Tissue DNA2020

    • Author(s)
      Yu Teranishi, Satoru Miyawaki, Hiroki Hongo, Shogo Dofuku, Atsushi Okano, Shunsaku Takayanagi, Takahiro Ota, Jun Yoshimura, Wei Qu, Jun Mitsui, Hirofumi Nakatomi, Shinichi Morishita, Shoji Tsuji, Nobuhito Saito
    • Organizer
      2020 Europiean NF Meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 網羅的遺伝子解析によって明らかになった神経線維腫症2型(NF2)の多様な臨床的・遺伝的背景2020

    • Author(s)
      寺西裕、宮脇哲、小原健太、本郷博貴、堂福翔吾、高柳俊作、中冨浩文、齊藤延人
    • Organizer
      遺伝子性腫瘍学会
  • [Presentation] 神経線維腫症2型(NF2)の遺伝子解析によって明らかになった多様な臨床的・遺伝的背景2020

    • Author(s)
      寺西裕、宮脇哲、石神大一郎、小原健太、本郷博貴、堂福翔吾、高柳俊作、中冨浩文、齊藤延人
    • Organizer
      脳神経外科学会総会
  • [Presentation] 複数組織DNAに対するtarget deep sequenceによって明らかになった神経線維腫症2型(NF2)の多様な臨床的・遺伝的背景2020

    • Author(s)
      寺西裕、宮脇哲、石神大一郎、小原健太、本郷博貴、堂福翔吾、高柳俊作、中冨浩文、齊藤延人
    • Organizer
      聴神経腫瘍研究会
  • [Presentation] 神経線維腫症2型(NF2)の遺伝子解析によって明らかになった多様な臨床的・遺伝的背景2020

    • Author(s)
      寺西裕、宮脇哲、石神大一郎、小原健太、本郷博貴、堂福翔吾、高柳俊作、中冨浩文、齊藤延人
    • Organizer
      脳腫瘍の外科学会

URL: 

Published: 2021-12-27  

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