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2011 Fiscal Year Annual Research Report

タンパク質の集合・リモデリングの分子機構とその制御

Research Project

Project/Area Number 20227004
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

荒木 弘之  国立遺伝学研究所, 細胞遺伝研究系, 教授 (20151160)

Keywordsリモデリング / DNA複製 / DNAヘリカーゼ / 酵母 / 染色体
Research Abstract

染色体DNAの複製において、複製タンパク質は複製開始領域に集合し、何らかの変化を起こし、DNA合成反応を始める。これをリモデリングと捉え、出芽酵母(Saccharomyces cerevisiae)を用いて解析を進めている。今期は、精製タンパク質からの再構成による単位反応の解析に加えて、出芽酵母粗抽出液によるin vitro複製系を用いた解析も始めた。粗抽出液を用いた系では、複製に関与するヘリカーゼ(Cdc45-MCM-GINS複合体)構成因子の複製開始領域への結合を指標として調べたところ、細胞内で観察される順番で結合する条件を見いだした。この構成因子の1つGINSは、DNAポリメラーゼε(Polε)との結合を介してpre-Loading complex(pre-LC)を形成し、複製開始領域へ結合する。Polεはリーディング鎖の合成を行うポリメラーゼであり、Pol2,Dpb2,Dpb3,Dpb4の4つのサブユニットから成る。Pol2が触媒サブユニットであるが、このサブユニットのN末に位置するポリメラーゼドメインを欠失することが可能である。しかし、このサブユニットのC末領域は必須である。このC末領域はDpb2,Dpb3,Dpb4サブユニットと結合する領域である。実際に、Dpb2の量が減少している変異ポリメラーゼやPol2サブユニットのN末を欠くPolεを精製しGINSとの結合を調べたところ、GINSとPolεの結合がDpb2サブユニットに依存し、Pol2のN末領域には依存しないことが分かった。一方、複製因子Sld3はSld7と結合し2量体を形成する。この構造が複製開始領域から両方向に複製を開始する上で重要であると考え、解析を進めている。現在までのところ、実際にSld3が2量体構造を敢っていること、Sld7のN末領域がSld3のN末領域に結合することが分かった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

リモデリングに関わる因子の解析が順調に進んでいるので、総合的な理解も間もなく可能になることが期待される。

Strategy for Future Research Activity

酵母粗抽出液を用いた系と精製タンパク質を用いた単位反応解析を今後も続けて行く。即ち、複製に働くヘリカーゼであるCMG複合体の形成過程の詳細な解析とその際のDNAポリメラーゼεの役割、Sld3-Sld7複合体の構造的視点に立った機能解析、である。これらの解析のため、in vitro複製系の改良を同時に進めて行く。

  • Research Products

    (18 results)

All 2011 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (13 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Origin association of Sld3, Sld7, and Cdc45 proteins is a key step for determination of origin-firing timing2011

    • Author(s)
      Tanaka, S., Nakano, R., Katou, Y., Shirahige, K. and Araki, H.
    • Journal Title

      Curr. Biol

      Volume: 21 Pages: 2055-2063

    • DOI

      10.1016/j.cub.2011.11.038

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sld7, an Sld3-associated protein required for efficient chromosomal DNA replication in budding yeast2011

    • Author(s)
      Tanaka, T., Umemori, T., Endo, S., Muramatsu, S., Kanemaki, M., Kamimura, Y., Obuse, C. and Araki, H
    • Journal Title

      EMBO J

      Volume: 30 Pages: 2019-2030

    • DOI

      10.1038/emboj.2011.115

  • [Journal Article] Initiation of chromosomal DNA replication in eukaryotic cells ; contribution of yeast genetics to the elucidation2011

    • Author(s)
      Hiroyuki Araki
    • Journal Title

      Genes Genet.Syst.

      Volume: 86 Pages: 141-149

    • DOI

      10.1266/ggs.86.141

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Multiple regulatory mechanisms to inhibit untimely initiation of DNA replication are important for stable genome maintenance2011

    • Author(s)
      Tanaka, S., Araki, H.
    • Journal Title

      PLoS Genet.

      Volume: 7 Pages: e1002136(1-16)

    • DOI

      10.1371/jounal.pgen.1002136

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Origin Association of Sld3, Sld7, and Cdc45 Proteins is a Key Step for Determination of Origin-Firing. Timing2011

    • Author(s)
      Seiji Tanaka
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜(招待講演)
    • Year and Date
      2011-12-13
  • [Presentation] Analysis of the interaction between chromatin and the origin recognition complex using atomic force microscopy2011

    • Author(s)
      Kohji Hizume
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2011-12-13
  • [Presentation] IN VITRO STUDY OF THE INITIATION OF DNA REPLICATION IN BUDDING YEAST2011

    • Author(s)
      Masaru Yagura
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2011-12-13
  • [Presentation] Characterization of the Sld3-Sld7 complex, an essential initiation factor for chromosome DNA replication in budding yeast2011

    • Author(s)
      Nishiho Makino
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2011-12-13
  • [Presentation] DDK-dependent recruitment of Sld3, Sld7 and Cdc45 specifies the timing of origin-firing in the budding yeast Saccharomyces cerevisiae2011

    • Author(s)
      田中誠司
    • Organizer
      第21回DNA複製・組換え・ゲノム安定性制御ワークショップ
    • Place of Presentation
      福岡県福津
    • Year and Date
      2011-10-25
  • [Presentation] 原子間力顕微鏡を用いたOrc/クロマチン相互作用の解析2011

    • Author(s)
      日詰光治
    • Organizer
      第21回DNA複製・組換え・ゲノム安定性制御ワークショップ
    • Place of Presentation
      福岡県福津
    • Year and Date
      2011-10-25
  • [Presentation] 酵母染色体DNA複製開始におけるpre-LC複合体の役割2011

    • Author(s)
      荒木弘之
    • Organizer
      日本遺伝学会第83回大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2011-09-20
  • [Presentation] Essential role of DNA polymerase epsilon at the initiation step of chromosomal DNA replication in budding yeast2011

    • Author(s)
      Hiroyuki Araki
    • Organizer
      2011 Cold Sprong Harbor Laboratory Meeting on EUKARYOTIC DNA REPLICATION & GENOME MAINTENANCE
    • Place of Presentation
      Cold Spring Harbor, NY (USA)
    • Year and Date
      2011-09-06
  • [Presentation] DDK-dependent recruitment of Sld3, Sld7 and Cdc45 specifies the timing of origin-firing in budding yeast2011

    • Author(s)
      Seiji Tanaka
    • Organizer
      2011 Cold Sprong Harbor Laboratory Meeting on EUKARYOTIC DNA REPLICATION & GENOME MAINTENANCE
    • Place of Presentation
      Cold Spring Harbor, NY (USA)
    • Year and Date
      2011-09-06
  • [Presentation] IN VITRO STUDY OF THE INITIATION OF DNA REPLICATION IN BUDDING YEAST2011

    • Author(s)
      Masaru Yagura
    • Organizer
      2011 Cold Sprong Harbor Laboratory Meeting on EUKARYOTIC DNA REPLICATION & GENOME MAINTENANCE
    • Place of Presentation
      Cold Spring Harbor, NY (USA)
    • Year and Date
      2011-09-06
  • [Presentation] Molecular mechanism of initiation of chromosomal DNA replication in budding yeast2011

    • Author(s)
      Hiroyuki Araki
    • Organizer
      25th International Conferenc on "Yeast Genetics and Molecular Biology"
    • Place of Presentation
      Kortowo-Olsztyn (Poland)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-07-07
  • [Presentation] How replication proteins associate with origins to initiate chromosomal DNA replication2011

    • Author(s)
      Hiroyuki Araki
    • Organizer
      6th UK-Japan Cell Cycle Workshop
    • Place of Presentation
      Windermere (UK)
    • Year and Date
      2011-04-10
  • [Presentation] Yeast initiation proteins, Sld3, Sld7 and Cdc45, specifies the timing of origin-firing2011

    • Author(s)
      Seiji Tanaka
    • Organizer
      6th UK-Japan Cell Cycle Workshop
    • Place of Presentation
      Windermere (UK)
    • Year and Date
      2011-04-10
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.nig.ac.jp/labs/MicGen/index.html

URL: 

Published: 2013-06-26  

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