2010 Fiscal Year Annual Research Report
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20227009
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| Research Institution | Yokohama City University |
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Principal Investigator |
西村 善文 横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 教授 (70107390)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
明石 知子 横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 准教授 (10280728)
長土居 有隆 横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 助教 (50336591)
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| Keywords | NMR / 転写因子 / クロマチン / 動的構造 / 天然変性状態 |
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| Research Abstract |
1.ヒストンの大腸菌発現系を用いてヒストンH2A/H2BおよびH3/H4の各複合体を調製した。H2A/H2BおよびH3/H4の各複合体について、MSで分子イオンを観測するのに適した試料調製法やMSの測定条件の最適化を行った。ピストンH2A/H2BおよびH3/H4の各複合体のPAD4による、シトルリン化についてMSを用いて解析した。H2Aのシトルリン化部位はヘテロ2量体ではN末のフレキシブルな領域であった。またシトルリン化によりヘテロ2量体は安定化することが判った。
2.15N,13C,2Hでラベルしたヒストンを調製しH2A/H2B複合体のTROSY-NMRの測定を行った。H2Aラベル体とH2B非ラベル体の組み合わせとH2A非ラベル体とH2Bラベル体の組み合わせでNMRのシグナルの帰属を試みた。
3.基本転写因子のTFIIEとTFIIHの相互作用に関してはTFIIEのαサブユニットのC末酸性ドメインとTFIIHのp62サブユニットが相互作用する。TFIIEの全長でのTFIIEのαサブユニットのC末酸性ドメイン部分の構造解析を試みた。
4.TRF2の全体構造の解析や2量体形成ドメインをシステインのSS結合でモデル化したN末の塩基性ドメイン2量体でテロメアDNAとの相互作用を解析した。2量体塩基性ドメインは3‘が突出した1本鎖DNA部位と2本鎖DNA部位のジャンクション部位で結合している事が示唆された。
5.転写抑制因子RESTのC末の転写抑制ドメイン(RD2)はZnフィンガーを含んでいて、DNAと相互作用することを見出した。その複合体のNMR測定を行った。
6.HP1のクロモドメインのN末のリン酸化によりヒストンH3K9me化体との結合が強くなることが報告されているが、リン酸化体と非リン酸化体のNMRを測定し構造解析を行った。クロモドメイン部分の構造は同じであることを確認した。
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Research Products
(21 results)
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[Presentation] NMR studies on the Six domain of Six32010
Author(s)
H.Shimojo, H.Okamura, A.Nagadoi, K.Ikeda, K.Kawakami, Y.Nishimura
Organizer
XXIVth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
Place of Presentation
ケアンズコンベンションセンター(オーストラリア)
Year and Date
20100822-20100827
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[Patent(Industrial Property Rights)] 神経選択的転写抑制因子NRSFに特異的に結合するmSin3Bに結合する化合物の利用2011
Inventor(s)
西村善文, 長土居有隆, 平尾優佳, 五嶋良郎, 山下直也, 植田弘師, 宮田直樹, 鈴木孝禎, 平石龍大
Industrial Property Rights Holder
公立大学法人横浜市立大学, 公立大学法人名古屋市立大学, 国立大学法人長崎大学
Industrial Property Number
PCT/JP2011/52710
Filing Date
2011-02-09
Overseas
