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2011 Fiscal Year Annual Research Report

テナガザル類の多様性と系統生物地理学

Research Project

Project/Area Number 20405016
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

平井 啓久  京都大学, 霊長類研究所, 教授 (10128308)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 香田 啓貴  京都大学, 霊長類研究所, 助教 (70418763)
宮部 貴子  京都大学, 霊長類研究所, 助教 (10437288)
遠藤 秀紀  東京大学, 総合研究博物館, 教授 (30249908)
Keywordsテナガザル / シアマン / シロマユテナガザル / ホオジロテナガザル / アルファサテライトDNA / レトロトランスポゾン
Research Abstract

(1)シアマンのヘテロクロマチンの主成分を明らかにする実験を行った。シアマンのゲノムから、端部の大規模ヘテロクロマチンに存在する反復配列を確認した。塩基配列を解読した結果、アルファサテライトDNAであることが判明した。アルファサテライトDNAは、霊長類のセントロメアの主成分となっている反復配列であり、171bpの単位が連続している。セントロメアに存在する主成分がシアマンではテロメアのヘテロクロマチンを形成している。
(2)テナガザルにおいて従来とは異なるトランスポゾンの特性を発見した。SVA因子とよばれるレトロトランスポゾンは、ヒト上科の共通祖先で生じたと考えられている複合型因子である。3つの領域からなり、右端(SINE)と左端(Alu)は、それぞれが単独のトランスポゾンに由来する。内部(VNTR)は30-50bpの単位が縦列に連なった反復配列である。シロマユテナガザルでも同様の因子が存在するが、これに加えて長大なVNTRが多数存在する。染色体上のセントロメア領域のヘテロクロマチンを形成していると考えられる、すなわち今回の発見は、トランスポゾンが新規のヘテロクロマチンを大量に供給する現象である。
(3)ヒトのゲノムの約45%を占めるトランスポゾンのうち,動いているトランスポゾンとして4種類が知られている。SVAはその一つであり,遺伝子に転移して様々な病気を引き起こす例が知られている.ホオジロテナガザルのゲノムにおいて,SVAに関連する配列を発見した.この配列はSVAのSINEの部分がプロスタグランジン還元酵素2様(PTGR2-like)遺伝子の一部に置き換えられた構造をしており,我々はこれをSr-SVAと名付け、現在この配列の発生機序を解析中である。
今回発見した配列は、テナガザル4属の染色体を判別する場合に有効であることも明らかになった。また、分子集団遺伝学的に解析するための、シロマユテナガザルの糞収集をバングラデシュでおこなった。

  • Research Products

    (15 results)

All 2012 2011

All Journal Article (15 results) (of which Peer Reviewed: 15 results)

  • [Journal Article] Evaluation of the predictive performance of a pharmacokinetic model for propofol in Japanese macaques (Macaca fuscata fuscata)2012

    • Author(s)
      Miyabe-Nishiwaki T, K Masui, A Kaneko, K Nishiwaki, T Nishio, H.Kanazawa
    • Journal Title

      Journal of Veterinary Pharmacology and Therapeutics

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Streptococcus troglodytae sp.nov., from the Chimpanzee Oral Cavity2012

    • Author(s)
      Okamoto M, Imai S, Miyanohara M, Saito W, Momoi Y, Abo T, Nomura Y, Ikawa T, Ogawa T, Miyabe-Nishiwaki T, Kaneko A, Watanabe A, Watanabe S, Hayashi M, Tomonaga M, Hanada N
    • Journal Title

      Int J Syst Evol Microbiol

      Volume: Mar 23

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Urological screening of wild Japanese macaques : investigating trends in nutrition and health2012

    • Author(s)
      MacIntosh AJJ, Huffman MA, Nishiwaki K, Miyabe-Nishiwaki T
    • Journal Title

      International Journal of Primatology

      Volume: 33 Pages: 460-478

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evolution and biological meaning of genomic wastelands (RCRO) : proposal of hypothesis2012

    • Author(s)
      Hirai, H
    • Journal Title

      In Post-Genome Biology of Primates

      Pages: 227-240

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular characterization of glycogen synthese 1 and its tissue expression profile with type II hexikinase and muscle-type phosphofructokinase in horses2011

    • Author(s)
      Echigoya Y, Okabe H, Itou T, Endo H, Sakai T
    • Journal Title

      Mol.Biol

      Volume: 38 Pages: 461-469

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Collection, Analysis, and Distribution of Three-Dimensional CT Data from Primate and Other Skull Specimens2011

    • Author(s)
      Endo H, Yamamoto Y, Yamamoto H, Sakai T, Itou T, Koie H, Hirai H
    • Journal Title

      Jpn.J.Zoo Wildl.Med

      Volume: 16 Pages: 45-53

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Necropsy case report for an old wild Japanese macaque (Macaca fuscata yakui) from Yakushima Island2011

    • Author(s)
      Hayakawa S, Hernadez A.D, Suzuki M, Sugaya K, koda H, Hasegawa H, Endo H
    • Journal Title

      Primate Res

      Volume: 27 Pages: 3-10

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phylogenetic relationship between Callosciurus caniceps and C.inornatus (Rodentia, Sciuridae) : Implication for zoogeographical isolation by the Mekong River2011

    • Author(s)
      Oshida T, Can Ngoc Dang, Son Truong Nguyen, Nghia, Xuan Nguyen, Hideki Endo, Junpei Kimura, Motoki Sasaki, Akiko Hayashida, Ai Takano, Masatoshi Yasuda, Yoshihiro Hayashi
    • Journal Title

      Italian J.Zool

      Volume: 78 Pages: 328-335

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Coxa morphologically adapted to large egg in aepyornithid species compared with various palaeognaths2011

    • Author(s)
      Endo H, Akishinonomiya F, Yonezawa T, Hasegawa M, Rakotondraparany F, Sasaki M, Taru H, Yoshida A, Yamasaki T, Itou T, Koie H, Sakai T
    • Journal Title

      Anat.Hist.Embryol

      Volume: 41 Pages: 31-40

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Differential prefrontal white matter development in chimpanzees and humans2011

    • Author(s)
      Sakai T, Mikami A, Tomonaga M, Matsui M, Suzuki J, Hamada Y, Tanaka M, Miyabe-Nishiwaki T, Makishima H, Nakatsukasa M, Matsuzawa T
    • Journal Title

      Curr Biol

      Volume: 21 Pages: 1397-1402

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Diversification of bitter taste receptor gene family in western chimpanzees2011

    • Author(s)
      Sugawara T, Go Y, Udono T, Morimura N, Tomonaga M, Hirai H, Imai H
    • Journal Title

      Molecular Biology and Evolution

      Volume: 28 Pages: 921-931

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Positive selection of Toll-like receptor 2 polymorphisms in two closely related old world monkey species, rhesus and Japanese macaques2011

    • Author(s)
      Takaki A, Yamazaki A, Maekawa T, Shibata H, Hirayama K, Kimura A, Hirai H, Yasunami M
    • Journal Title

      Immunogenetics

    • DOI

      10.1007/S00251-011-0556-2

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genomes and geography : genomic insights into the evolution and phylogeography of the genus Schistosoma2011

    • Author(s)
      Lawton SP, Hirai H, Ironside JE, Johnstone DA, Rollinson D
    • Journal Title

      Parasites & Vectors

      Volume: 4 Pages: 131

    • DOI

      10.1186/1756-3305-4-131

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] B chromosomes have a functional effect on femal sex determination in lake Victoria cichlid fishes2011

    • Author(s)
      Yoshida K, Terai Y, Mizoiri S, Aibara M, Nishihara H, Watanabe M, Kuroiwa A, Hirai H, Hirai Y, Matsuda Y, Okada N
    • Journal Title

      PLoS Genetics

      Volume: 7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Activation of the long terminal repeat of human endogenous retrovirus K by melanoma-specific transcription factor MITF-M2011

    • Author(s)
      Katoh I, Mirova A, Kurata s, Murakami Y, Horikawa K, Nakakuki N, Sakai T, Hashimoto K, Maruyama A, Yonaga T, Fukunishi N, Moriishi K, Hirai H
    • Journal Title

      Neoplasia

      Volume: 13 Pages: 1081-1092

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2013-06-26  

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