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2009 Fiscal Year Final Research Report

Analysis of gene silencing mechanism by bacterial small RNA

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 20770137
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Molecular biology
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

MORITA Teppei  Nagoya University, 薬学部・薬学科, 助手 (10444366)

Project Period (FY) 2008 – 2009
Keywords小分子RNA / mRNA抑制 / 転写後制御 / 大腸菌
Research Abstract

SgrS sRNA acts by baseparing with ptsG mRNA, resulting in translation inhibition and degradation of ptsG mRNA. We showed that the base pairing between SgrS and ptsG mRNA is directly responsible for translational silencing mediated by SgrS. We also identified a minimal base-pairing region of SgrS required for translational repression of ptsG mRNA. These results contribute to understanding the molecular mechanism by which Hfq-dependent sRNA act in bacteria.

  • Research Products

    (15 results)

All 2010 2009 2008

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (12 results)

  • [Journal Article] A minimal base-pairing region of a bacterial small RNA SgrS required for translation repression of ptsG mRNA2010

    • Author(s)
      牧貴美香、森田鉄兵、大鷹弘紀、饗場弘二
    • Journal Title

      Molecular Microbiology

      Pages: 782-792

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RNA, but not proteins, is directly responsible for translational silencing by a bacterial Hfq-binding small RNA2008

    • Author(s)
      牧貴美香、宇野可奈子、森田鉄兵、饗場弘二
    • Journal Title

      Proceeding of National Academy of Sciences of the U.S.A. 105(30)

      Pages: 10332-7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Analyses of mRNA destabilization and translation inhibition mediated by Hfq-binding small RNAs2008

    • Author(s)
      森田鉄兵、牧貴美香、八木美江子、饗場弘二
    • Journal Title

      Methods in Enzymology 447

      Pages: 359-78

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ptsG mRNAの翻訳抑制に重要なSgrS最小領域の同定2009

    • Author(s)
      牧貴美香、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第46回日本細菌学会中部支部会
    • Place of Presentation
      名城大学、名古屋市
    • Year and Date
      2009-10-23
  • [Presentation] 大腸菌RNase E/Hfqの結合領域の同定2009

    • Author(s)
      池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第46回日本細菌学会中部支部会
    • Place of Presentation
      名城大学、名古屋市
    • Year and Date
      2009-10-23
  • [Presentation] 遺伝子発現抑制機能におけるSgrS3'末端領域の役割2009

    • Author(s)
      大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第11回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      朱鷺メッセ、新潟市
    • Year and Date
      2009-07-28
  • [Presentation] 合成RNAによるptsG mRNAの翻訳抑制2009

    • Author(s)
      牧貴美香、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第11回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      朱鷺メッセ、新潟市
    • Year and Date
      2009-07-27
  • [Presentation] sRNAによるポリシストロニックなmRNAの発現抑制の解析2009

    • Author(s)
      石川博一、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第11回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      朱鷺メッセ、新潟市
    • Year and Date
      2009-07-27
  • [Presentation] 大腸菌RNase E/Hfqの結合領域の同定2009

    • Author(s)
      池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第11回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      朱鷺メッセ、新潟市
    • Year and Date
      2009-07-27
  • [Presentation] 遺伝子発現抑制機能におけるSgrS3'末端領域の重要性の解析2009

    • Author(s)
      大鷹弘紀、森田鉄兵、本間道夫、饗場弘二
    • Organizer
      第6回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      KKRホテル熱海、熱海市
    • Year and Date
      2009-06-12
  • [Presentation] sRNAによるポリシストロニックなmRNAの発現抑制の解析2009

    • Author(s)
      石川博一、森田鉄兵、本間道夫、饗場弘二
    • Organizer
      第6回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      KKRホテル熱海、熱海市
    • Year and Date
      2009-06-12
  • [Presentation] Heterogenety of RNA degradosome of Escherichia coli: RNase E forms several distinct complexes with partner proteins.2008

    • Author(s)
      池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      JSPS-DST Asian Academic Seminar
    • Place of Presentation
      Bangalore、India
    • Year and Date
      2008-12-28
  • [Presentation] アミノ酸枯渇時のリボソーム停滞によるmRNAの切断とトランス翻訳2008

    • Author(s)
      李霞、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第10回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター、札幌市
    • Year and Date
      2008-07-25
  • [Presentation] バクテリアにおけるHfq/sRNAによる翻訳阻害はタンパク質ではなくsRNAが直接の要因である2008

    • Author(s)
      牧貴美香、宇野可奈子、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第10回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター、札幌市
    • Year and Date
      2008-07-23
  • [Presentation] 大腸菌small RNAによる標的mRNAの分解機構とその役割2008

    • Author(s)
      池田幸樹、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      RNAフロンティアミーティング2008
    • Place of Presentation
      関西セミナーハウス、京都
    • Year and Date
      2008-06-04

URL: 

Published: 2011-06-18   Modified: 2016-04-21  

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