Elucidation of the system constructing skeletal muscle tissue by whole-cell omics.

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20H00456
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Review Section: Medium-sized Section 43:Biology at molecular to cellular levels, and related fields
• Research Institution: Kyushu University
• Principal Investigator: Ohkawa Yasuyuki 九州大学, 生体防御医学研究所, 教授 (80448430)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: 骨格筋分化 / クロマチン構造 / 単一細胞解析 / 空間オミクス

Outline of Final Research Achievements

The unique ChILSeq method facilitated single-cell level epigenome data acquisition. An innovative multi-omics analysis integrated ChILSeq with a novel immunostaining method and a spatial transcriptome technique, PIC. This application in tissues allows intra-tissue epigenomic changes analysis. RNA was reverse-transcribed into dsDNA, amplified via in vitro transcription for single-cell RNA detection. Specific antibodies labeled with erasable fluorescence were used to analyze a wide variety of antibodies within the same specimen. The ongoing comprehensive data analysis aims to identify cell populations in skeletal muscle regeneration, with paper submission and patent application in progress.

Free Research Field

トランスクリプトミクス

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究は、骨格筋再生過程における細胞集団の詳細な同定を可能にし、それにより筋肉損傷や筋萎縮症などの筋肉疾患の治療法開発に対する重要なデータとなるであろう。単一細胞レベルでのトランスクリプトーム、プロテオーム、エピゲノムデータの取得は、患者の病態理解とパーソナライズド医療の進展に資する。また、この独自のマルチオミクス解析法は生体組織のエピゲノム変化を詳細に解析可能で、がんなど他の疾患の研究にも応用可能な可能性がある。論文の公開と特許申請により、これら技術は更なる研究と開発の基盤となることが期待できる。