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2020 Fiscal Year Annual Research Report

脂肪酸代謝ネットワークによる生体制御およびその制御破綻による疾患メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 20H00495
Research InstitutionKeio University

Principal Investigator

有田 誠  慶應義塾大学, 薬学部(芝共立), 教授 (80292952)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Keywords脂質 / リピドミクス / 生理活性 / 生体分子
Outline of Annual Research Achievements

これまでに、好酸球がマウス急性腹膜炎の適切な収束に寄与すること、この機能が脂肪酸代謝酵素である12/15-リポキシゲナーゼ(12/15-LOX)依存的であることを報告してきた。今回、12/15-LOX欠損マウスにおいて角膜上皮組織の創傷治癒が遅延すること、この機能が好酸球に発現する12/15-LOX依存的であることを明らかにした。さらに、好酸球が生成する12/15-LOX由来代謝物の中から、点眼により角膜の創傷治癒を促進する機能性代謝物17-HDoHEを同定した。また、生体内の脂質多様性を網羅的に捉えるための解析アルゴリズムを構築し、約8,000種の脂質多様性をノンバイアスに捉えるノンターゲットリピドミクス解析システムの構築に成功した。この新技術を用いて、血管内皮細胞がlaminar shear stressに晒されることで中鎖脂肪酸含有エーテル脂質の生合成が誘導され、この細胞内代謝応答が血管内皮ホメオスタシスにおいて重要な役割を果たすことを解明した。また、腸内細菌叢の脂質多様性を解明するためのノンターゲットリピドミクス解析を行い、Acyl alpha-hydroxy fatty acid (AAHFA)をはじめ、腸内細菌が生成するユニークな脂質分子の新規同定を実践した。また、赤痢アメーバ脂質のノンターゲット解析から、栄養体期からシスト期に移行する際に特徴的に誘導される超長鎖アシル基含有セラミド分子種を特定し、これが膜透過性の制御および生存・寄生適応に必須であることを明らかにした。さらに、グラム陰性菌由来Lipid Aの構造多様性を包括的に計測できるリピドミクス解析技術を開発し、単一菌株内にLipid Aの脂肪酸鎖長に多様性があること, さらにその鎖長分布が菌種と相関することが明らかになった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

未知分子探索型のノンターゲットリピドミクス解析技術の開発に成功したことにより、炎症・代謝疾患など様々な疾患の背後に潜むリスク要因としての脂肪酸代謝ネットワークの変化を高網羅的に可視化することが可能になり、病態メカニズムの解明に加えてこれまでに知られていない脂質の生体調節機能や生理活性分子の同定につながる状況になった。これにより、創薬標的となる機能作用点の特定、および新しい治療法の開発に向けた基盤研究が飛躍的に進むことが期待される。これら基盤技術を活用することで、血管内皮細胞がずり応力に適応するための細胞内エーテル含有脂質の代謝変動分子メカニズムとして細胞内脂質代謝リモデリングの解明や腸内細菌叢が生成するユニークな脂質分子の新規同定につながった。また、脂肪酸代謝バランスの変化による疾患制御の分子メカニズム解析として、角膜上皮組織の創傷治癒において好酸球の役割を解明し、そこから生成する脂肪酸代謝物の中から、点眼により角膜の創傷治癒を促進する機能性代謝物17-HDoHEの同定に成功した。いずれも当初の計画以上に進展し、今後の発展性が大いに期待される。

Strategy for Future Research Activity

引き続き最先端のリピドミクス解析システムや脂肪酸代謝酵素の遺伝子改変動物を用いることで、多彩な脂肪酸代謝ネットワークによる生体制御およびその制御破綻による疾患メカニズムについて、その因果関係を分子レベルで明らかにする。とくに、リピドミクス計測で得られたマススペクトル情報から代謝物の同定を行うmolecular spectrum networkingを構築し、さらに得られた脂質分子の定量結果を代謝マップに投影するシステムを整備することで、疾患やバイオロジーと相関を示す代謝経路の解析を加速させる。また、ω3脂肪酸の機能性発現に関わる生体内の代謝酵素の遺伝子改変マウスの解析を引き続き行い、炎症・代謝疾患における個体レベルでのω3脂肪酸代謝系の生理的意義に迫る研究を展開する。また、生体膜を構成する脂肪酸分子種の多様性や不均一な分布について、とくに分子集合体として「場」の制御に関わる脂質の機能を理解する上で、特定の組織や細胞で特徴的な脂肪酸環境を可視化するために質量分析イメージング手法を適用し、特定の脂質場の形成・維持に関わる分子機構の解析を進める。

  • Research Products

    (22 results)

All 2021 2020 Other

All Journal Article (14 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 14 results,  Open Access: 14 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 4 results) Book (1 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Analyses of Lipid A Diversity in Gram-Negative Intestinal Bacteria Using Liquid Chromatography?Quadrupole Time-of-Flight Mass Spectrometry2021

    • Author(s)
      Okahashi Nobuyuki、Ueda Masahiro、Matsuda Fumio、Arita Makoto
    • Journal Title

      Metabolites

      Volume: 11 Pages: 197~197

    • DOI

      10.3390/metabo11040197

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Filopodium-derived vesicles produced by MIM enhance the migration of recipient cells2021

    • Author(s)
      Nishimura T、Oyama T、Hu HT、Fujioka T、Hanawa-Suetsugu K、Ikeda K、Yamada S、Kawana H、Saigusa D、Ikeda H、Kurata R、Oono-Yakura K、Kitamata M、Kida K、Hikita T、Mizutani K、Yasuhara K、Mimori-Kiyosue Y、Oneyama C、Kurimoto K、Hosokawa Y、Aoki J、Takai Y、Arita M、Suetsugu S
    • Journal Title

      Developmental Cell

      Volume: 56 Pages: 842~859.e8

    • DOI

      10.1016/j.devcel.2021.02.029

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Stage-Specific De Novo Synthesis of Very-Long-Chain Dihydroceramides Confers Dormancy to Entamoeba Parasites2021

    • Author(s)
      Mi-ichi Fumika、Ikeda Kazutaka、Tsugawa Hiroshi、Deloer Sharmina、Yoshida Hiroki、Arita Makoto
    • Journal Title

      mSphere

      Volume: 6 Pages: e00174-21

    • DOI

      10.1128/mSphere.00174-21

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Deletion of Alox15 improves kidney dysfunction and inhibits fibrosis by increased PGD2 in the kidney2021

    • Author(s)
      Takahashi Naohiro、Kikuchi Hiroaki、Usui Ayaka、Furusho Taisuke、Fujimaru Takuya、Fujiki Tamami、Yanagi Tomoki、Matsuura Yoshiaki、Asano Kenichi、Yamamoto Kouhei、Ando Fumiaki、Susa Koichiro、Mandai Shintaro、Mori Takayasu、Rai Tatemitsu、Uchida Shinichi、Arita Makoto、Sohara Eisei
    • Journal Title

      Clinical and Experimental Nephrology

      Volume: 25 Pages: 445~455

    • DOI

      10.1007/s10157-021-02021-y

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Functional lipidomics of vascular endothelial cells in response to laminar shear stress2021

    • Author(s)
      Hirata Tsuyoshi、Yamamoto Kimiko、Ikeda Kazutaka、Arita Makoto
    • Journal Title

      The FASEB Journal

      Volume: 35 Pages: e21301

    • DOI

      10.1096/fj.202002144R

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Senolysis by glutaminolysis inhibition ameliorates various age-associated disorders2021

    • Author(s)
      Johmura Y、Yamanaka T、Omori S、Wang T、Sugiura Y、Matsumoto M、Suzuki N、Kumamoto S、Yamaguchi K、Hatakeyama S、Takami T、Yamaguchi R、Shimizu E、Ikeda K、Okahashi N、Mikawa R、Suematsu M、Arita M、Sugimoto M、Nakayama K.、Furukawa Y、Imoto S、Nakanishi M
    • Journal Title

      Science

      Volume: 371 Pages: 265~270

    • DOI

      10.1126/science.abb5916

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Lipidomics links oxidized phosphatidylcholines and coronary arteritis in Kawasaki disease2021

    • Author(s)
      Nakashima Y、Sakai Y、Mizuno Y、Furuno K、Hirono K、Takatsuki S、Suzuki H、Onouchi Y、Kobayashi T、Tanabe K、Hamase K、Miyamoto T、Aoyagi R、Arita M、Yamamura K、Tanaka T、Nishio H、Takada H、Ohga S、Hara T
    • Journal Title

      Cardiovascular Research

      Volume: 117 Pages: 96~108

    • DOI

      10.1093/cvr/cvz305

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Helicobacter pylori metabolites exacerbate gastritis through C-type lectin receptors2020

    • Author(s)
      Nagata M、Toyonaga K、Ishikawa E、Haji S、Okahashi N、Takahashi M、Izumi Y、Imamura A、Takato K、Ishida H、Nagai S、Illarionov P、Stocker BL、Timmer M、Smith D、Williams S、Bamba T、Miyamoto T、Arita M、Appelmelk B、Yamasaki S
    • Journal Title

      Journal of Experimental Medicine

      Volume: 218 Pages: e20200815

    • DOI

      10.1084/jem.20200815

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Elucidation of Gut Microbiota-Associated Lipids Using LC-MS/MS and 16S rRNA Sequence Analyses2020

    • Author(s)
      Yasuda Shu、Okahashi Nobuyuki、Tsugawa Hiroshi、Ogata Yusuke、Ikeda Kazutaka、Suda Wataru、Arai Hiroyuki、Hattori Masahira、Arita Makoto
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 23 Pages: 101841~101841

    • DOI

      10.1016/j.isci.2020.101841

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Maternal dietary imbalance between omega-6 and omega-3 fatty acids triggers the offspring’s overeating in mice2020

    • Author(s)
      Sakayori Nobuyuki、Katakura Masanori、Hamazaki Kei、Higuchi Oki、Fujii Kazuki、Fukabori Ryoji、Iguchi Yoshio、Setogawa Susumu、Takao Keizo、Miyazawa Teruo、Arita Makoto、Kobayashi Kazuto
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 3 Pages: 473

    • DOI

      10.1038/s42003-020-01209-4

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Eosinophils promote corneal wound healing via the 12/15‐lipoxygenase pathway2020

    • Author(s)
      Ogawa Mamoru、Ishihara Tomoaki、Isobe Yosuke、Kato Taiga、Kuba Keiji、Imai Yumiko、Uchino Yuichi、Tsubota Kazuo、Arita Makoto
    • Journal Title

      The FASEB Journal

      Volume: 34 Pages: 12492~12501

    • DOI

      10.1096/fj.202000483R

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A lipidome atlas in MS-DIAL 42020

    • Author(s)
      Tsugawa Hiroshi、Ikeda Kazutaka、Takahashi Mikiko、Satoh Aya、Mori Yoshifumi、Uchino Haruki、Okahashi Nobuyuki、Yamada Yutaka、Tada Ipputa、Bonini Paolo、Higashi Yasuhiro、Okazaki Yozo、Zhou Zhiwei、Zhu Zheng-Jiang、Koelmel Jeremy、Cajka Tomas、Fiehn Oliver、Saito Kazuki、Arita Masanori、Arita Makoto
    • Journal Title

      Nature Biotechnology

      Volume: 38 Pages: 1159~1163

    • DOI

      10.1038/s41587-020-0531-2

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Antioxidant vitamins and lysophospholipids are critical for inducing mouse spermatogenesis under organ culture conditions2020

    • Author(s)
      Sanjo Hiroyuki、Yao Tatsuma、Katagiri Kumiko、Sato Takuya、Matsumura Takafumi、Komeya Mitsuru、Yamanaka Hiroyuki、Yao Masahiro、Matsuhisa Akio、Asayama Yuta、Ikeda Kazutaka、Kano Kuniyuki、Aoki Junken、Arita Makoto、Ogawa Takehiko
    • Journal Title

      The FASEB Journal

      Volume: 34 Pages: 9480~9497

    • DOI

      10.1096/fj.202000245R

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Dysregulated metabolism of polyunsaturated fatty acids in eosinophilic allergic diseases2020

    • Author(s)
      Miyata Jun、Fukunaga Koichi、Kawashima Yusuke、Ohara Osamu、Kawana Akihiko、Asano Koichiro、Arita Makoto
    • Journal Title

      Prostaglandins & Other Lipid Mediators

      Volume: 150 Pages: 106477~106477

    • DOI

      10.1016/j.prostaglandins.2020.106477

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Biology of LipoQuality: Advanced lipidomics technology and its application in biology2021

    • Author(s)
      Makoto Arita
    • Organizer
      9th International Singapore Lipid Symposium (iSLS9)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Biology of LipoQuality: Advanced lipidomics technology and its application in biology2020

    • Author(s)
      Makoto Arita
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] 最先端リピドミクスから解き明かす病態・バイオロジー研究2020

    • Author(s)
      有田誠
    • Organizer
      第45回日本医用マススペクトル学会年会
    • Invited
  • [Presentation] 脂質代謝ネットワークによる炎症性疾患の制御2020

    • Author(s)
      有田誠
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Book] ヒトマイクロバイオーム研究最前線Vol.22020

    • Author(s)
      有田誠
    • Total Pages
      624
    • Publisher
      (株)エヌ・ティー・エス
  • [Remarks] 理化学研究所生命医科学研究センターメタボローム研究チームHP

    • URL

      https://www.ims.riken.jp/labo/53/index_j.html

  • [Remarks] 横浜市立大学大学院生命医科学研究科代謝エピゲノム科学研究室HP

    • URL

      http://www-mls.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/lab/cme.html

  • [Remarks] 慶應義塾大学薬学部代謝生理化学講座HP

    • URL

      http://keio-pha-pcm.jp/member.html

URL: 

Published: 2022-12-28  

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