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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Dissemination mechanisms of colistin-resistant bacteria in communities of developping countries

Research Project

Project/Area Number 20H00561
Research InstitutionGifu University

Principal Investigator

山本 容正  岐阜大学, 大学院連合創薬医療情報研究科, 招へい教員 (20010100)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 河原 隆二  地方独立行政法人 大阪健康安全基盤研究所, 微生物部, 主幹研究員 (10332454)
田中 香お里  岐阜大学, 糖鎖生命コア研究所, 教授 (20242729)
林 将大  岐阜大学, 糖鎖生命コア研究所, 助教 (20646385)
山本 眞由美  岐阜大学, 保健管理センター, 教授 (40313879)
山口 貴弘  地方独立行政法人 大阪健康安全基盤研究所, 微生物部, 主任研究員 (80553635)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywordsコリスチン耐性菌 / 途上国 / 食品 / 住民
Outline of Annual Research Achievements

コリスチンは多剤耐性菌治療の切札とされている。この抗菌剤に対する耐性菌が途上国コミュニテイで蔓延し、その世界的拡散が大きな脅威となっている。申請者らの最近の研究から、途上国コミュニテイではコリスチン耐性菌が蔓延の段階からさらなるステージである慢性化へと進展悪化していることが示唆されたが詳細は不明である。そこで、本研究では、耐性菌蔓延とその慢性化に寄与する耐性遺伝子リザーバーであるヒトならびに家畜腸内細菌叢に焦点をあて、①コリスチン耐性遺伝子の細菌叢構成細菌種間分布と②染色体性耐性遺伝子解析を行い、蔓延の慢性化機構解明を行う。また、コミュニテイにおける薬剤耐性対策に必須である耐性菌動向調査・監視に用いる③耐性菌簡易迅速測定法の開発を行い、今後予測される脅威への効果的対応に資する科学的基盤成績取得と耐性菌モニタリング技術の提供を目指した。
研究2年目となる本年度では、研究初年度と同様、コリスチン耐性菌蔓延地域よりコリスチン耐性株の分離収集と分離株のゲノム解析を予定したが、新型コロナ感染拡大が前年度に引き続き起きていたため、海外への渡航制限とそれによる検体収集ができなかった。しかし既に収集した分離株を用いたゲノム解析の実施とコリスチン耐性菌の簡易迅速測定法の開発とそれを用いた実検体による実証研究を行い研究計画全体としてその進捗を確保した。これらにより得られた成績は4本の原著論文として国際誌で発表した。耐性菌蔓延コミュニテイ住民ならびに比較として本邦住民から分離された嫌気性菌のゲノム解析により、耐性遺伝子プロフィール比較解析による相違を明らかにした。また、食品汚染耐性菌の簡易迅速検出法としてrealtime PCR法を開発し、検体収集から結果判定までを2時間で完結することを可能とした。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初計画とは実施事項が新型コロナ感染の拡大継続により若干前後したが、研究全体としての進捗はおおむね達成でき、結果、原著論文を国際誌に4本発表できた。

Strategy for Future Research Activity

引き続き当初研究計画に沿って研究を進める。

  • Research Products

    (5 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results)

  • [Int'l Joint Research] タイビン医科薬科大学(ベトナム)

    • Country Name
      VIET NAM
    • Counterpart Institution
      タイビン医科薬科大学
  • [Journal Article] Complete Genome Sequences of Three Phocaeicola vulgatus Strains Isolated from a Healthy Japanese Individual2022

    • Author(s)
      Vu Hanh、Muto Yoshinori、Hayashi Masahiro、Noguchi Hideki、Tanaka Kaori、Yamamoto Yoshimasa
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 11 Pages: e01124-21

    • DOI

      10.1128/mra.01124-21

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Quantitative Analysis of Colistin-Resistant Escherichia coli in Retail Meat from Local Vietnamese Markets2021

    • Author(s)
      Nguyen Thang N.、Khong Diep T.、Le Ha V.、Tran Hoa T.、Phan Quang N.、Le Huong T. T.、Kawahara Ryuji、Yamamoto Yoshimasa
    • Journal Title

      BioMed Research International

      Volume: 2021 Pages: 1~6

    • DOI

      10.1155/2021/6678901

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] "Rapid and Practical Screening Method for the Detection of Colistin-Resistant Bacteria in Food"2021

    • Author(s)
      Yamamoto Yoshimasa
    • Journal Title

      Biomedical Journal of Scientific & Technical Research

      Volume: 40 Pages: 31798~31802

    • DOI

      10.26717/BJSTR.2021.40.006381

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Comparison of Phenotypic and Genotypic Patterns of Antimicrobial-Resistant Bacteroides fragilis Group Isolated from Healthy Individuals in Vietnam and Japan2021

    • Author(s)
      Vu Hanh、Hayashi Masahiro、Nguyen Thang Nam、Khong Diep Thi、Tran Hoa Thi、Yamamoto Yoshimasa、Tanaka Kaori
    • Journal Title

      Infection and Drug Resistance

      Volume: Volume 14 Pages: 5313~5323

    • DOI

      10.2147/IDR.S341571

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2023-12-25  

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