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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Regulatory mechanism of biological phase separation

Research Project

Project/Area Number 20H03199
Research InstitutionNara Medical University

Principal Investigator

森 英一朗  奈良県立医科大学, 医学部, 准教授 (70803659)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 吉澤 拓也  立命館大学, 生命科学部, 講師 (50779056)
齋尾 智英  徳島大学, 先端酵素学研究所, 教授 (80740802)
菊池 壮太郎  奈良県立医科大学, 医学部, 助教 (90866386)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords生物学的相分離 / cross-βポリマー / 天然変性タンパク質 / LCドメイン / アミロイド線維 / 相分離破綻 / 相分離駆動 / 相分離制御
Outline of Annual Research Achievements

本研究課題では、細胞内でのタンパク質の状態を、構造・動態の解析技術を集約することで、生物学的相分離におけるタンパク質の制御機構を理解することを目指している。細胞の中では、タンパク質を含む多くの分子が非常に濃度の高い夾雑環境に存在している。このような条件を試験管内で再現し、その条件での分子の挙動を計測し、相分離制御の機序を明らかにすることを本課題では目指してきている。具体的には、LCドメインによるcross-ポリマーの形成を、ヒドロゲル結合法や液滴形成による濁度計測法に加え、等温滴定型熱量測定法(ITC)、高速原子間力顕微鏡(HS-AFM)、分析用超遠心法(AUC)、核磁気共鳴法(NMR:固体・溶液)、X線小角散乱法(SAXS)、中性子小角散乱法(SANS)等に、適切な同位体ラベル法やインテイン反応、分子動態計算法(MD)を組合せて分子動態の解析に取り組んだ。また、相分離抑制シャペロン(相分離制御因子)や相分離破綻ペプチド(相分離破綻因子)を組合せることで、制御と破綻の関連性についても検討を進めた。その成果の一部は「相分離制御破綻」という病態モデルとして発表した[Nanaura et al. Nat Commun 2021]。また、細胞骨格や機械的なストレス応答に関する異常が生じる病態発症機序についても明らかにした[Shiota et al. Front Cell Dev Biol 2022]。さらには、相分離破綻因子・毒性ポリペプチドによるオートファジーの誘導の機序解明についても、検討を進めた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

「Nanaura et al. Nat Commun 2021」と「Shiota et al. Front Cell Dev Biol 2022」などの論文を発表するなど、研究を推進した。

Strategy for Future Research Activity

最終年度となる次年度は、これまでの2年間での成果を基盤として、論文等での成果発表に加え、発展的研究課題の探索にも取り組む。

  • Research Products

    (9 results)

All 2022 2021

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Journal Article] C9orf72-Derived Proline:Arginine Poly-Dipeptides Modulate Cytoskeleton and Mechanical Stress Response2022

    • Author(s)
      Shiota Tomo、Nagata Riko、Kikuchi Sotaro、Nanaura Hitoki、Matsubayashi Masaya、Nakanishi Mari、Kobashigawa Shinko、Isozumi Noriyoshi、Kiriyama Takao、Nagayama Kazuaki、Sugie Kazuma、Yamashiro Yoshito、Mori Eiichiro
    • Journal Title

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      Volume: 10 Pages: 750829

    • DOI

      10.3389/fcell.2022.750829

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] C9orf72-derived arginine-rich poly-dipeptides impede phase modifiers2021

    • Author(s)
      Nanaura Hitoki, et al.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Pages: 5301

    • DOI

      10.1038/s41467-021-25560-0

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Gene Expression Profiles of Human Cerebral Organoids Identify PPAR Pathway and PKM2 as Key Markers for Oxygen-Glucose Deprivation and Reoxygenation2021

    • Author(s)
      Iwasa Naoki, et al.
    • Journal Title

      Frontiers in Cellular Neuroscience

      Volume: 15 Pages: 605030

    • DOI

      10.3389/fncel.2021.605030

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Ras-like Gem GTPase induced by Npas4 promotes activity-dependent neuronal tolerance for ischemic stroke2021

    • Author(s)
      Takahashi Hiroo、Asahina Ryo、Fujioka Masayuki、Matsui Takeshi K.、Kato Shigeki、Mori Eiichiro、Hioki Hiroyuki、Yamamoto Tohru、Kobayashi Kazuto、Tsuboi Akio
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 118 Pages: e2018850118

    • DOI

      10.1073/pnas.2018850118

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Olig2-astrocytes express neutral amino acid transporter SLC7A10 (Asc-1) in the adult brain2021

    • Author(s)
      Tatsumi Kouko、Kinugawa Kaoru、Isonishi Ayami、Kitabatake Masahiro、Okuda Hiroaki、Takemura Shoko、Tanaka Tatsuhide、Mori Eiichiro、Wanaka Akio
    • Journal Title

      Molecular Brain

      Volume: 14 Pages: 163

    • DOI

      10.1186/s13041-021-00874-8

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] low-complexityドメインの破綻がALS-FTDをきたす2021

    • Author(s)
      森 英一朗, 杉江 和馬
    • Organizer
      62nd Annual Meeting of the Japanese Society of Neurology
    • Invited
  • [Presentation] Biological phase separation in neurological disorders2021

    • Author(s)
      Eiichiro Mori, Hitoki Nanaura, Tomo Shiota, Naohiko Iguchi, Kazuma Sugie
    • Organizer
      62nd Annual Meeting of the Japanese Society of Neurology
  • [Presentation] 相分離生物学:分子集合状態と分子シャペロンによる制御2021

    • Author(s)
      森 英一朗
    • Organizer
      日本ハイパーサーミア学会38回大会
    • Invited
  • [Presentation] タンパク質の老い:相分離とアミロイド形成2021

    • Author(s)
      森 英一朗
    • Organizer
      第94回日本生化学大会
    • Invited

URL: 

Published: 2022-12-28  

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