Does SVLF in diatoms act as a maintenance system for diatom populations?

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20H03327
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 45040:Ecology and environment-related
• Research Institution: Saga University
• Principal Investigator: Kimura Kei 佐賀大学, 農学部, 准教授 (30612676)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 長里 千香子 北海道大学, 北方生物圏フィールド科学センター, 教授 (00374710) ; 和田 啓 宮崎大学, 医学部, 教授 (80379304)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 珪藻 / ウイルス / 弱毒化因子 / 感染生理学 / ウイルスゲノム

Outline of Final Research Achievements

This study investigates the genome structure and function of a factor that supresses the infectivity of DNA viruses infecting diatoms (satellite virus-like factor = SVLF). The genome of SVLF infecting the diatom Chaetoceros tenuissimus was analysed and it was found that the capsid protein was highly conserved in the SVLF genome, that the non-genetic region was variable and that it may be involved via a common sequence with the virus (HV). They also found that SVLF suppresses HV replication and virus-induced diatom death, strongly suggesting that SVLF may be a novel satellite virus.

Free Research Field

藻類ウイルス学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

『珪藻』は「海の牧草」とも称され、海洋資源生物として重要である。ウイルスはこの珪藻の減耗要因であるが、天然環境ではウイルスが存在しても珪藻は死滅せず大量に存在する。本研究対象であるSVLFは、ウイルス複製を抑制し、珪藻のウイルス感染死も減少させていると考えられる。つまり、SVLFは、珪藻個体群のウイルス感染による死滅を回避する生態システムとして機能していると考えられ、SVLFの生態学的意義は非常に大きい可能性がある。