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2022 Fiscal Year Annual Research Report

エレノアの液滴形成による転写活性化と乳がん再発における役割解明

Research Project

Project/Area Number 20H03520
Research InstitutionJapanese Foundation for Cancer Research

Principal Investigator

斉藤 典子  公益財団法人がん研究会, がん研究所 がん生物部, 部長 (40398235)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
KeywordsノンコーディングRNA / 液滴 / 液-液相分離 / 乳がん / エストロゲン受容体
Outline of Annual Research Achievements

細胞核内には生体膜に囲まれない凝集体が多数存在し、これらはRNAとRNA結合タンパク質を中心に、液-液相分離が引き起こされて形成される「液滴」であると示唆されている。液相分離で形成される液滴は、タンパク質の中の、特定の立体構造をもたない「天然変性タンパク質領域」とRNAがアフィニティーは低いが多点で相互作用して形成されるとされる。高い密度と流動性をもつといった、今までに知られている分子間相互作用のみでは説明不可能な「状態変化」を表すものである。
乳がんの70%はエストロゲン受容体(ER)を発現するER陽性型で、エストロゲンを枯渇する内分泌療法が効果的である。しかし、長期治療後に高い頻度で再発することが問題である。再発ER陽性乳がん細胞においては、タンパク質をコードしない長鎖ノンコーディングRNAエレノアが高発現し、核内でエレノアクラウドと称する凝集体を形成して、がんの増殖に関わる遺伝子群を活性化する。エレノアクラウドは、エレノアRNAとそれに相互作用するタンパク質が液-液相分離という物理現象をおこした結果の「液滴構造」であると示唆され、近年はがんにおける機能が指摘され始めている。本研究では、エレノアクラウドの機能を解析し、「液滴形成を介した効率的な転写活性化」の分子メカニズムを乳がんにおける役割を明らかにすることを目的とした。エレノアクラウドが液相分離の阻害剤で離散し、それとともに近隣遺伝子のmRNA転写が抑制されることを見出した。液滴であることが、転写活性化に重要であることがわかった。またエレノアに結合するタンパク質候補に液相分離を促進するドメインがあることや、転写活性化に関わるものであることを見出した。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (29 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 4 results) Presentation (18 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 15 results) Book (2 results) Remarks (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Kansas(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of Kansas
  • [Journal Article] POLR1A variants underlie phenotypic heterogeneity in neural, craniofacial, and cardiac anomalies2023

    • Author(s)
      Smallwood, K., Saitoh, N., Weaver, K. N., et al.
    • Journal Title

      The American Journal of Human Genetics

      Volume: 110, 1_17, Pages: 110, 1_17,

    • DOI

      10.1016/j.ajhg.2023.03.014

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Methylated histones on mitotic chromosomes promote Topoisomerase IIα function for high-fidelity chromosome segregation2023

    • Author(s)
      Sundararajan, S., Park, H., Kawano, S., Johansson, M., Lama, B., Saito-Fujita, T., Saitoh, N., Arnaoutov, A., Dasso, M., Wang, Z., Keifenheim, D., Clarke D.J., Azuma, Y.
    • Journal Title

      iScience

      Volume: in press Pages: in press

    • DOI

      10.1016/j.isci.2023.106743

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Mathematical model of structural changes in nuclear speckle.2023

    • Author(s)
      Wakao, S., Saitoh, N., Awazu, A.
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: in press Pages: in press

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v20.0020

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The ELEANOR non-coding RNA expression contributes to cancer dormancy and predicts late recurrence of ER-positive breast cancer2022

    • Author(s)
      Fukuoka, M., Ichikawa, Y., Osako, T., Fujita, T., Baba, S., Takeuchi, K., Tsunoda, N., Ebata, T., Ueno, T., Ohno, S., *Saitoh, N.
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 113, 2336-235 Pages: -

    • DOI

      10.1111/cas.15373

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The 3′ Pol II pausing at replication-dependent histone genes is regulated by Mediator through Cajal bodies’ association with histone locus bodies.2022

    • Author(s)
      Suzuki, H., Abe, R., Shimada, M., Hirose, T., Hirose, H., Noguchi, K., Ike, Y., Yasui, N., Furugori, K., Yamaguchi, Y., Toyoda, A., Suzuki, Y., Yamamoto, T., Saitoh, N., Sato, S., Tomomori-Sato, C., Conaway, R., Conaway, J., Takahashi, H.
    • Journal Title

      Nature Commun

      Volume: 3(1):2905 Pages: 3(1):2905

    • DOI

      10.1038/s41467-022-30632-w.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Chromatin Associating Long Non-coding RNAs in Late Recurrence of Breast Cancer.2023

    • Author(s)
      Saitoh, N., Tachiwana, H.
    • Organizer
      International Symposium On Chromatin Architecture: Structure And Function (ERATO)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Chromatin associating long non-coding RNAs involved in dormancy for late recurrence of breast cancer.2022

    • Author(s)
      Saitoh, N., Yamamoto, T., Ichikawa, Y., Fukuoka, M., Tachiwana, H.
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting, Epigenetics & Chromatin
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Non-coding RNAs in the molecular condensate contribute to chromatin regulation and tumor dormancy in late recurrence of breast cancer.2022

    • Author(s)
      Saitoh, N., Ichikawa, Y., Fukuoka, M.
    • Organizer
      The FASEB Meeting, The Nuclear Bodies Conference: Hubs of Genomic Activity
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ELEANOR non-coding RNAs activate the chromatin domain, balancing cell death and proliferation in the breast cancer dormancy.2022

    • Author(s)
      Saitoh, N.
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会3AW-08
    • Invited
  • [Presentation] 乳がんの休眠に寄与するクロマチン制御ノンコーディングRNA.2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会 2AW-16
    • Invited
  • [Presentation] 乳がんの晩期再発におけるノンコーディングRNAのゲノム調節.2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 機能性RNAが制御するゲノムDNAとがん2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      第467回つくば分子生命科学セミナー.
    • Invited
  • [Presentation] クロマチン構造 エピジェネティクスとノンコーディングRNA 再発乳がんの診断と治療応用の可能性2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      福島県立医科大学医学部2年 基礎特別講義
    • Invited
  • [Presentation] 乳がんにおけるノンコーディングRNAによる染色体の構造と機能の制御.2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      染色体学会第73回年会
    • Invited
  • [Presentation] ELEANOR non-coding RNAs associate with chromatin, and contribute to the 3D genome structure in breast cancer.2022

    • Author(s)
      Yamamoto, T., Ichikawa, Y., Palihati, M., Saitoh, N.
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 非コードRNAが駆動するがんの悪性化とその分子基盤.2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会モーニングレクチャー
    • Invited
  • [Presentation] 乳がんにおけるエピジェネティクス-再発乳がんに関わるノンコーディングRNAエレノアの解析2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      Breast Cancer Symposium 2022特別講演II
    • Invited
  • [Presentation] ノンコーディングRNA が制御する高次生命現象とがん進展.2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      第30回日本乳癌学会学術総会.
    • Invited
  • [Presentation] 再発乳がんにおけるゲノム3次元構造と核内ノンコーディング RNA.2022

    • Author(s)
      斉藤 典子、 市川 雄一、福岡恵.
    • Organizer
      第74回日本細胞生物学会大会. シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 長鎖ノンコーディングRNAによる再発乳がんのエピジェネティクス制御.2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      第23回ホルモンと癌研究会 教育講演
    • Invited
  • [Presentation] Approaches to identify and characterize the roles of the ELEANOR non-coding RNA in breast cancer.2022

    • Author(s)
      マルダン・パルハット
    • Organizer
      2022年度新学術領域学術研究支援基盤先端モデル動物支援プラットフォーム
  • [Presentation] Approaches to characterize the roles of the ELEANOR non-coding RNA in brast cancer.2022

    • Author(s)
      Maierdan, P.
    • Organizer
      新学術領域・学術変革領域A合同「若手の会2022」
  • [Presentation] 組織切片からエピゲノム情報を取得する手法の開発.2022

    • Author(s)
      松戸亮太
    • Organizer
      新学術領域・学術変革領域A合同「若手の会2022」
  • [Book] 「実験医学」増刊 第40巻2022

    • Author(s)
      斉藤典子、立和名博昭、松戸亮太
    • Total Pages
      -
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      978-4-7581-0404-3
  • [Book] 「病理と臨床」2022年臨時増刊号40巻2022

    • Author(s)
      立和名博昭、斉藤典子
    • Total Pages
      -
    • Publisher
      文光堂
    • ISBN
      978-4-7581-0404-3
  • [Remarks] がん研究所がん生物部

    • URL

      http://202.242.5.28/laboratory/department/cancer_biology/www/index.html

  • [Remarks] がん研究所

    • URL

      https://www.jfcr.or.jp/laboratory/department/cancer_biology/index.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] ER陽性乳がんの晩期再発を検査する方法、及び治療薬のスクリーニング方法2022

    • Inventor(s)
      福岡 恵、斉藤 典子、他
    • Industrial Property Rights Holder
      福岡 恵、斉藤 典子、他
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2022-65345

URL: 

Published: 2023-12-25  

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