食道がん化における初期のゲノム異常の解明-多発ヨード不染の網羅的ゲノム解析-

2021 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 20H03660
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: 横山 顕礼 京都大学, 医学研究科, 助教 (20515514)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 玉置 将司 京都大学, 医学研究科, 特定助教 (00796948) ; 小川 誠司 京都大学, 医学研究科, 教授 (60292900) ; 垣内 伸之 京都大学, 医学研究科, 助教 (90839721)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: がんの起源 / 食道扁平上皮がん / 上皮内腫瘍 / ヨード不染色 / 飲酒 / 喫煙

Outline of Annual Research Achievements

本研究は、内視鏡所見から視認できる食道がんの起源となるヨード不染の病理学的所見とゲノム異常を対比することで、上皮内腫瘍発生までに獲得される食道がん化初期のゲノム異常を解明するとともに、早期がんや進行がんと比較することで、非腫瘍部のなかでもヨード不染のphenotypeをもつ状態、そして、病理学的に前がん病変である上皮内腫瘍、そして、早期がん、進行がんと、食道がん化におけるゲノム異常の全貌を明らかにすることを目的としている。内視鏡生検内の1つのヨード不染色から1つずつ微小サンプルを採取する「Solitaryサンプリング」、内視鏡生検の1つのヨード不染から多数の近接した直径0.5mmの微小サンプルを採取する「High-density サンプリング」を組み合わせて行うことで、ゲノム異常の頻度比較のみならず、クローン進化やシグニチャー解析の観点での比較することを目指している研究課題である。現時点では、「Solitaryサンプリング」は、メインのターゲットであるヨード不染の非腫瘍部66サンプル、低異型度上皮内腫瘍21サンプル、そして、対比目的に、Tis以深の21サンプルと濃染部30サンプルの計149サンプルの全エクソン解析を行っている。さらに、「High-density サンプリング」はメインターゲットであるヨード不染の非腫瘍部5カ所、低異型度上皮内腫瘍5カ所と対比目的にTis以深を10カ所の計20カ所から、計113サンプルの全エクソン解析を行っている。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

前述した通り、現時点では、「Solitaryサンプリング」は、メインのターゲットであるヨード不染の非腫瘍部66サンプル、低異型度上皮内腫瘍21サンプル、そして、対比目的に、Tis以深の21サンプルと濃染部30サンプルの計149サンプルの全エクソン解析を行っている。さらに、「High-density サンプリング」はメインターゲットであるヨード不染の非腫瘍部5カ所、低異型度上皮内腫瘍5カ所と対比目的にTis以深を10カ所の計20カ所から、計113サンプルの全エクソン解析を行っており、計262サンプルの全エクソン解析を行っている。順調なリクルート状況であるため。

Strategy for Future Research Activity

「Solitaryサンプリング」と「High-density サンプリング」に関しては、予定されたリクルート数の確保は終了している。ヨード散布後の「単一細胞培養」に関しては、ヨード液の刺激性で細胞培養に支障をきたし、度重なる条件検討も不能であったため、本研究では、中止課題となる。
以上から、「Solitaryサンプリング」と「High-density サンプリング」の全エクソン解析から食道ヨード不染の遺伝子異常の解析を進めるとともに、コピー数異常や変異シグニチャー解析も進め、網羅的ゲノム解析の結果としてまとめて、論文投稿の準備を進める。