Association between tumor microbiota and genomic instability-mediated anti-tumor immunity in MSI-high gastric cancer

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20H03668
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 53010:Gastroenterology-related
• Research Institution: Yamanashi Prefectural Hospital Organization
• Principal Investigator: Hirotsu Yosuke 地方独立行政法人山梨県立病院機構山梨県立中央病院(がんセンター局ゲノム解析センター), ゲノム解析センター, チーフ研究員 (10793838)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: マイクロサテライト / ミスマッチ修復 / 免疫チェックポイント阻害剤

Outline of Final Research Achievements

After comparing MSI-PCR and IHC in 319 samples, the concordance rate between IHC and MSI-PCR tests was 98.1% (313/319). In cases of discordance, laser capture microdissection (LCM) and MSI-NGS were performed to investigate the reasons for the discrepancies, which were attributed to the ambiguity of MSI-PCR results and the heterogeneity of MSI status within the tumor. Some gastric cancer cases exhibited a "mosaic" pattern, indicating both insufficient and sufficient MMR expression in different areas. The "mosaic" pattern was also observed in an additional 1082 samples. The heterogeneous expression pattern of MMR may be associated with the response to immune checkpoint inhibitor therapy. We established a 16S rRNA analysis method to investigate the tumor microbiota from FFPE tissue.

Free Research Field

腫瘍学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究は、免疫チェックポイント阻害剤の適応症例を決定する上で重要な腫瘍におけるミスマッチ修復（MMR）およびMSIの状態の評価をするため、複数の測定法による詳細なデータを提示した。結果より、腫瘍がMMRを十分に発現している部分と欠損している部分の両方を有する腫瘍内不均一性があることが明らかになった。このことは、正確なMMR評価のためには、腫瘍の不均一性を捉える必要性を強調している。この研究は、特にMSI-HまたはMMR欠損固形がん患者における診断、個別化治療の臨床的意思決定に影響を与える可能性がある。