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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Study on flavin-dependent epigenome that links nutritional environment to phenotype

Research Project

Project/Area Number 20H04108
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

日野 信次朗  熊本大学, 発生医学研究所, 准教授 (00448523)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywordsリボフラビン / 代謝 / エピゲノム / LSD1
Outline of Annual Research Achievements

表現型(=長期的な体質)形成には、DNAメチル化やヒストン修飾などのエピゲノムを介した遺伝子発現制御が密接に関わる。様々な栄養素がシグナル伝達や代謝物生成を介してエピゲノム形成に直接寄与することに着目し、本研究ではリボフラビン(Rf,ビタミンB2)依存性エピゲノム・転写制御を介した組織形成メカニズムの解明を試みた。
本年度は、Rf依存性ヒストン脱メチル化酵素LSD1が骨格筋の環境ストレス下における組織形成及び恒常性に関わる可能性を検討した。骨格筋特異的にLSD1を欠損するマウスを作製し、様々な環境ストレスを負荷したところ、ストレス応答が増強されていることがわかった。また、LSD1が様々な筋組織制御に関わる転写因子と共役することがわかった。これらのことから、LSD1が遺伝子発現制御を介して筋肉の過度なストレス応答を制限することが示唆された。この成果は、Rf摂取により骨格筋の組織恒常性を高めることができ、健康寿命を延伸できる可能性を示唆している。
また、Rf代謝・消費の場であるミトコンドリアに対するストレス負荷が核内のエピゲノム形成に作用する仕組みを解明したほか、乳酸アシドーシスが遺伝子発現に及ぼす影響を明らかにした。これらの成果は、Rfが細胞内代謝やシグナル伝達を介してエピゲノム制御に作用する仕組みを理解する上で、重要な手掛かりとなる。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (14 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 4 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results) Remarks (3 results)

  • [Int'l Joint Research] ケルン大学(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      ケルン大学
  • [Int'l Joint Research] コーンケン大学(タイ)

    • Country Name
      THAILAND
    • Counterpart Institution
      コーンケン大学
  • [Journal Article] LSD1 defines the fiber type-selective responsiveness to environmental stress in skeletal muscle2023

    • Author(s)
      Araki Hirotaka、Hino Shinjiro、Anan Kotaro、Kuribayashi Kanji、Etoh Kan、Seko Daiki、Takase Ryuta、Kohrogi Kensaku、Hino Yuko、Ono Yusuke、Araki Eiichi、Nakao Mitsuyoshi
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 12 Pages: e84618

    • DOI

      10.7554/eLife.84618

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Lactic acidosis induces metabolic and phenotypic reprogramming in cholangiocarcinoma cells via the upregulation of thrombospondin‐12023

    • Author(s)
      Thamrongwaranggoon Ubonrat、Kuribayashi Kanji、Araki Hirotaka、Hino Yuko、Koga Tomoaki、Seubwai Wunchana、Wongkham Sopit、Nakao Mitsuyoshi、Hino Shinjiro
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 114 Pages: 1541~1555

    • DOI

      10.1111/cas.15699

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq) for Detecting Histone Modifications and Modifiers2023

    • Author(s)
      Hino Shinjiro、Sato Tetsuya、Nakao Mitsuyoshi
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 2577 Pages: 55~64

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2724-2_4

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mitochondrial stress induces AREG expression and epigenomic remodeling through c-JUN and YAP-mediated enhancer activation2022

    • Author(s)
      Hino Yuko、Nagaoka Katsuya、Oki Shinya、Etoh Kan、Hino Shinjiro、Nakao Mitsuyoshi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 50 Pages: 9765~9779

    • DOI

      10.1093/nar/gkac735

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Lactic acidosis promotes aggressive features of cholangiocarcinoma cells via upregulating ALDH1A3 expression through EGFR axis2022

    • Author(s)
      Thamrongwaranggoon Ubonrat、Detarya Marutpong、Seubwai Wunchana、Saengboonmee Charupong、Hino Shinjiro、Koga Tomoaki、Nakao Mitsuyoshi、Wongkham Sopit
    • Journal Title

      Life Sciences

      Volume: 302 Pages: 120648~120648

    • DOI

      10.1016/j.lfs.2022.120648

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Biosynthesis of S-adenosyl-methionine enhances aging-related defects in Drosophila oogenesis2022

    • Author(s)
      Hayashi Yoshiki、Kashio Soshiro、Murotomi Kazutoshi、Hino Shinjiro、Kang Woojin、Miyado Kenji、Nakao Mitsuyoshi、Miura Masayuki、Kobayashi Satoru、Namihira Masakazu
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Pages: 5593

    • DOI

      10.1038/s41598-022-09424-1

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] リボフラビンとフラボタンパク質による細胞制御2022

    • Author(s)
      日野信次朗
    • Journal Title

      実験医学増刊(栄養・代謝物シグナルと食品機能)

      Volume: 40 Pages: 1161-1167

  • [Presentation] 環境因子とエピジェネティクス因子の相互作用による骨格筋の「質」と「量」の調節2022

    • Author(s)
      日野信次朗
    • Organizer
      日本基礎老化学会第43回シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Epigenetic regulation of energy metabolism in health and diseases2022

    • Author(s)
      Shinjiro Hino
    • Organizer
      Center of Translational Medicine Seminar, Khon Kaen University
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 熊本大学発生医学研究所HP

    • URL

      http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp

  • [Remarks] プレスリリース「筋肉の過剰な環境適応を抑える仕組みを解明」

    • URL

      https://www.kumamoto-u.ac.jp/whatsnew/seimei-sentankenkyu/20230209

  • [Remarks] プレスリリース「ミトコンドリアから細胞核への逆行性シグナリングと標的遺伝子の解明」

    • URL

      https://www.kumamoto-u.ac.jp/whatsnew/seimei-sentankenkyu/20220913

URL: 

Published: 2023-12-25  

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