X線結晶学による甲殻類急性ウイルス血症の感染機構の解明

2022 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 20K06238
• Research Institution: Osaka University
• Principal Investigator: 鈴木 守 大阪大学, 蛋白質研究所, 准教授 (40280507)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: X線結晶構造解析 / 甲殻類急性ウイルス血症

Outline of Annual Research Achievements

甲殻類急性ウイルス血症は、エビの養殖において最も甚大な被害が報告されている疾病であり、White Spot Syndrome Virus（WSSV）の感染により発生する。エビが感染すると3～10日のうちに100%死に至る。ウイルスがいったん養殖場に入り込んでしまうと、ウイルスを排除するためには、現状そこで飼育しているエビを全て廃棄するしかなく、有効な予防・防御方法が求められている。本申請では、感染に関係すると考えられるWSSVのVP37および感染関連分子群の立体構造をX線結晶構造解析により決定し、感染メカニズムを分子構造レベルで理解することを目的としている。
今年度は研究環境の大幅な変更を余儀なくされ生化学実験はほぼ不可能になっため、大幅に遅延している。今後は計算科学的手法を用いて研究を行う予定である。

Current Status of Research Progress

4: Progress in research has been delayed.

Reason

前年度に分解能2.51AでVP37のX線結晶構造解析に成功したが、今年度は研究環境の大幅な変更を余儀なくされたため研究推進が遅延している。

Strategy for Future Research Activity

得られた構造をもとに計算科学的手法を用いて機能解析を目指す。

Causes of Carryover

コロナ禍により実験の進展が予定よりも遅れたため。

Research Products

• [Int'l Joint Research] King Mongkut's University of Technology(タイ)
  • Country Name: THAILAND
  • Counterpart Institution: King Mongkut's University of Technology
• [Journal Article] Serial femtosecond X-ray crystallography of an anaerobically formed catalytic intermediate of copper amine oxidase (2022)
  • Author(s): Murakawa Takeshi、Suzuki Mamoru、Fukui Kenji、Masuda Tetsuya、Sugahara Michihiro、Tono Kensuke、Tanaka Tomoyuki、Iwata So、Nango Eriko、Yano Takato、Tanizawa Katsuyuki、Okajima Toshihide
  • Journal Title: Acta Crystallographica Section D Structural Biology Volume: 78 Pages: 1428～1438
  • DOI: 10.1107/S2059798322010385
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Structure of thaumatin under acidic conditions: Structural insight into the conformations in lysine residues responsible for maintaining the sweetness after heat-treatment (2022)
  • Author(s): Masuda Tetsuya、Okubo Kyohei、Baba Seiki、Suzuki Mamoru、Tani Fumito、Yamasaki Masayuki、Mikami Bunzo
  • Journal Title: Food Chemistry Volume: 389 Pages: 132996～132996
  • DOI: 10.1016/j.foodchem.2022.132996
  • Peer Reviewed
• [Presentation] カテコールO-メチル転移酵素の配座構造の変化 (2023)
  • Author(s): 飯島 洋、武部 克希、鈴木 守、桑田-楠瀬 隆生、髙宮 知子、鵜澤 成一
  • Organizer: 日本薬学会第143年会
• [Presentation] ヤマブシタケ由来RNase He1の至適ｐHに関与するアミノ酸残基の検討 (2023)
  • Author(s): 小林 弘子、武部 克希、元吉 尚美、板垣 正、鵜澤 成一、鈴木 守
  • Organizer: 日本薬学会第143年会
• [Presentation] Investigation of hydrogen bond network in the active center of catechol O-methyltransferase by X-ray crystallography and FMO method (2022)
  • Author(s): Katsuki Takebe, Tomoko Shirai, Yuma Handa, Kaori Fukuzawa, Mamoru Suzuki, Takao K
  • Organizer: 情報計算化学生物学会(CBI学会)
• [Presentation] Molecular movie of the catalytic reaction of bacterial copper amine oxidase conducted by mix and inject serial femtosecond X ray crystallography (2022)
  • Author(s): Takeshi Murakawa , Mamoru Suzuki, Kenji Fukui, Tetuya Masuda, Ikuko Miyahara, Takehiko Tosha, Takato Yano, So Iwata, Eriko Nango, Katsuyuki Tanizawa, Toshihide Okajima
  • Organizer: Molecular Movies International Symposium 2022
  • Int'l Joint Research