2021 Fiscal Year Research-status Report
がん細胞のリボソーム構成タンパク質の発現解析と転写後調節への関与
| Project/Area Number |
20K07336
|
|---|
| Research Institution | Chiba University |
|---|
Principal Investigator |
松下 一之 千葉大学, 医学部附属病院, 准教授 (90344994)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
澤井 摂 千葉大学, 医学部附属病院, 特任准教授 (10400962)
石毛 崇之 千葉大学, 医学部附属病院, 臨床検査技師 (30757315)
木村 明佐子 国際医療福祉大学, 成田保健医療学部, 講師 (40727939)
西村 基 千葉大学, 医学部附属病院, 講師 (80400969)
星野 忠次 千葉大学, 大学院薬学研究院, 准教授 (90257220)
北村 浩一 千葉大学, 医学部附属病院, 臨床検査技師 (90842881)
小林 崇平 国際医療福祉大学, 成田保健医療学部, 講師 (90846940)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
|
| Keywords | リボソーム / がん / 希少疾患 / リボソーマルRNA / FIR / TFIIH p62 subunit |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
c-myc遺伝子転写抑制因子FIR(Far-upstream element-binding protein-interacting repressor)（別名PUF60）がc-myc遺伝子の発現増大をもたらす機序として、FIRの転写抑制部位のexon 2を欠損したスプライシング変異 (FIRΔexon2) が発現し、ドミナントネガティブ効果によりc-myc遺伝子の転写が活性化していることを見出した。本研究ではさらにFIRおよびFIRΔexon2タンパク質が相互作用するタンパク質候補を免疫沈降法で調べ多くのリボソームRNA,スプライシング因子（hnRNPs）,mRNA結合タンパク質などが同定した。すなわちFIRおよびFIRΔexon2は転写、選択的スプライシングやリボソーム形成などにも関与していることが示唆された。近年、リボソームの構成タンパク質が癌細胞や希少疾患では正常細胞と異なっていることが報告されている。本研究では、がん細胞と正常細胞におけるリボヌクレオタンパク（RNPs）やリボソーム構成タンパク質の相違をしらべ、選択的スプライシングや転写mRNAの種類（選択性）への影響を調べた。
FIRおよびFIRΔexon2は極めて多くのリボソームタンパク質の発現（rRNAやRPレベル）に影響を与えることがRNA-Seqの検討で示唆された。このことから、FIRおよびFIRΔexon2は癌におけるリボソームの不均一性に関与していると考えられる。癌や希少疾患のリポソームタンパク質の構成の発現量や組み合わせの変化、あるいは構成するリボソームタンパク質の遺伝子変異などが起こっていることが報告されているが、臨床検体における詳細は不明の点が多い。本研究ではリボソーマルタンパク質をmRNA, タンパク質レベルで検出する系を作製して検討を行った。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
共同研究者の協力により、FIRの新しい機能としてのリボソーマルRNAの発現調整を見出した。現在、論文を執筆中である。
|
| Strategy for Future Research Activity |
研究はほぼ予定通り進んでいる。現在、これまでの研究成果を論文としてまとめている。FIR(PUF60)がTFIIHのp62 subunitと相互作用することが示唆された。それによりFIRがRNA Polymeraseの働きに関与し、多くのリボソーマルRNAの発現調節に影響していると考えている。
|
| Causes of Carryover |
新型コロナウイルスの流行による研究計画の予定変更があった。研究自体は順調に進んでいる。
|
-
[Journal Article] Precision cancer genome testing needs proficiency testing involving all stakeholders2022
Author(s)
Maekawa M, Taniguchi T, Nishio K, Sakai K, Matsushita K, Nakatani K, Ishige T, Ikejiri M, Nishihara H, Sunami K, Yatabe Y, Hatanaka KC, Hatanaka Y, Yamamoto Y, Fukuyama K, Oda S, Saito K, Yokomura M, Kubo Y, Sato H, Tanaka Y, Fuchioka M, Yamasaki T, Matsuda K, Kurachi K, Funai K, Baba S, Iwaizumi M.
-
Journal Title
Sci Rep.
Volume: 12
Pages: 1598-1565
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
[Journal Article] Multiple cancer type classification by small RNA expression profiles with plasma samples from multiple facilities.2022
Author(s)
Suzuki K, Igata H, Abe M, Yamamoto Y; small RNA based cancer classification project.Kuno Suzuki, Hideyoshi Igata, Terunao Iwanaga, Hiroaki Kanzaki, Naoya Kato, Nobuko Tanaka, Kenji Kawasaki, Kazuyuki Matsushita,
-
Journal Title
Cancer Sci
Volume: -
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
[Journal Article] Anti-FIRΔexon2 autoantibody as a novel indicator for better overall survival in gastric cancer.2021
Author(s)
Kobayashi S, Hiwasa T, Ishige T, Kano M, Hoshino T, Rahmutulla B, Seimiya M, Shimada H, Nomura F, Matsubara H, Matsushita K.
-
Journal Title
Cancer Sci.
Volume: -
Pages: -
DOI
-
[Presentation] 遺伝性腫瘍に対する包括的な取り組みと問題点 当科における遺伝性腫瘍に対する取り組みと千葉県リンチ症候群・HBOC対策協議会の立ち上げ2021
Author(s)
栃木 透, 宮内 英聡, 岡田 晃一郎, 丸山 哲郎, 遠藤 悟史, 今西 俊介, 大平 学, 丸山 通広, 糸賀 栄, 石毛 崇之, 松下 一之, 松原 久裕
Organizer
日本外科学会定期学術集会
-
-
-
-
[Presentation] 遺伝性がん 日本におけるリンチ症候群の遺伝学的・臨床的特徴2021
Author(s)
赤木 究, 山口 達郎, 檜井 孝夫, 田中屋 宏爾, 永坂 岳司, 横井 左奈, 松下 一之, 宮倉 安幸, 河合 賢朗, 田邊 裕貴, 新井 吉子, 山本 剛, 野水 整, 冨田 尚裕, 青木 大輔, 石田 秀行
Organizer
日本癌学会総会
-
-
[Presentation] 遺伝的ハイリスク者を対象としたサーベイランス外来 現況と展望2021
Author(s)
中津川 智子, 藤本 浩司, 楯 真一, 三階 貴文, 坂田 治人, 高田 護, 榊原 淳太, 錦見 恭子, 寺中 亮太郎, 山本 寛人, 宇津野 恵美, 関根 瑞香, 長嶋 健, 松下 一之, 市川 智彦
Organizer
日本乳癌学会総会
-
[Presentation] Lynch症候群とHBOCに対する千葉県内の診療施設間ネットワーク形成について2021
Author(s)
松下 一之, 宮内 英聡, 石毛 崇之, 西村 基, 川崎 健治, 糸賀 栄, 関根 瑞香, 宇津野 恵美, 滝口 裕一, 稲田 麻里, 長嶋 健, 藤本 浩司, 松原 久裕, 市川 智彦
Organizer
日本遺伝カウンセリング学会
-
