2023 Fiscal Year Final Research Report

Expression analysis of ribosome constituent proteins in cancer cells and their involvement in post-transcriptional regulation

Research Project

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Project/Area Number	20K07336
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 49010:Pathological biochemistry-related
Research Institution	Chiba University
Principal Investigator	Matsushita Kazuyuki 千葉大学, 医学部附属病院, 准教授 (90344994)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	澤井摂千葉大学, 大学院医学研究院, 助教 (10400962) 石毛崇之千葉大学, 医学部附属病院, 臨床検査技師 (30757315) 木村明佐子国際医療福祉大学, 成田保健医療学部, 講師 (40727939) 西村基千葉大学, 医学部附属病院, 講師 (80400969) 星野忠次千葉大学, 大学院薬学研究院, 准教授 (90257220) 北村浩一千葉大学, 医学部附属病院, 臨床検査技師 (90842881) 小林崇平国際医療福祉大学, 成田保健医療学部, 講師 (90846940)
Project Period (FY)	2020-04-01 – 2024-03-31
Keywords	がん / mRNA / rRNA / 発現亢進 / バイオマーカー / 質量分析 / NGS
Outline of Final Research Achievements	In cancer, both the transcription of nuclear gene mRNA and the expression of ribosomal RNA (rRNA) are increased. The purpose of this study was to investigate the common pathway underlying the mechanism of increased expression of mRNA and rRNA in cancer. The idea of the research is that there are many rRNA, splicing factors (hnRNPs), and mRNA-binding proteins in the group of proteins that interact with the protein FIR (Far-upstream element-binding protein-interacting repressor) (also known as PUF60) involved in transcription and splicing. This is what I have learned from what I have reported over many years of research. We aimed to clarify that FIR and its splicing variant FIRΔexon2 (highly expressed in cancer) simultaneously regulate the expression of mRNA and rRNA.
Free Research Field	臨床検査医学、ゲノム医療、遺伝医療、がんの分子生物学
Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements	本研究の目的であるがん細胞におけるmRNAとrRNAの亢進機序の解明、特に共通経路の存在について研究はほとんど行われていない。そのため、本研究は学術的独自性と創造性が極めて高いと考えている。疾患における診断や治療標的となるバイオマーカー探索は世界中で競争が激しい。一方、リボソームタンパク質に注目したバイオマーカーはほとんど報告されていない。その理由は質量分析による詳細な検討が最近まで行われてこなかったことが一因である。さらには、臨床検体を用いたリボソームタンパク質などのRNAの転写後調節に関わるタンパク質は数百におよび解析が困難である。本研究の視点により、新しい学術領域が広がると考えられる。