Analysis of abnormal methylation of cytokines involved in the pathogenesis of autoimmune pancreatitis and its application to pathological diagnosis

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20K07405
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 49020:Human pathology-related
• Research Institution: Shinshu University
• Principal Investigator: Uehara Takeshi 信州大学, 学術研究院医学系, 准教授 (80402121)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 松田 和之 信州大学, 学術研究院保健学系, 教授 (00647084) ; 増本 純也 愛媛大学, プロテオサイエンスセンター, 教授 (20334914)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: 自己免疫性膵炎 / サイトカイン / メチル化アレイ解析

Outline of Final Research Achievements

We performed whole-genome methylation profiling using the Infinium
MethylationEPIC Kit (Illumina, USA) to identify methylation abnormalities of cytokines and cytokine-related factors in autoimmune pancreatitis (AIP). Methylation array analysis was performed on the inflammatory area of AIP, the obstructive pancreatitis area of pancreatic cancer, and the respective lymph nodes. No systematic methylation abnormalities were found in the heat map analysis. On the other hand, during the analysis, we found methylation aberrations in cytokine-related factors that may regulate overall inflammation, factors that may regulate AIP and may lead to prevention of AIP development. We plan to continue analysis of candidate genes.

Free Research Field

人体病理

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

自己免疫性膵炎(AIP)発症メカニズムについては、いまだ不明な点が多い。AIPにおいて様々なサイトカインが病態形成に関与していることが知られている。そこでAIPで生じる線維化や高IgG4血症を生じさせるサイトカイン異常がメチル化異常によって誘発されているという仮説を立て、病理学的、分子生物学的視点から検証した。アレイ解析でそれらに系統的な特異なメチル化異常は見いだせなかった。一方で解析の中で、炎症全体を制御するサイトカイン関連因子にメチル化異常が生じていた。AIPを制御する可能性のある因子を見出したことは、AIP発症を防ぐことにつながる可能性があり、学術的意義および社会的意義がある。