2022 Fiscal Year Annual Research Report
To improve quality of cancer gene panel tests by strategic implementation of external quality assessment scheme
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20K07823
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| Research Institution | Hamamatsu University School of Medicine |
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Principal Investigator |
前川 真人 浜松医科大学, 医学部, 教授 (20190291)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
西尾 和人 近畿大学, 医学部, 教授 (10208134)
坂井 和子 近畿大学, 医学部, 講師 (20580559)
岩泉 守哉 浜松医科大学, 医学部, 助教 (60444361)
谷 重喜 浜松医科大学, 医学部, 教授 (80217116)
中谷 中 三重大学, 医学部附属病院, 教授 (80237304)
松下 一之 千葉大学, 医学部附属病院, 准教授 (90344994)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | がん遺伝子パネル検査 / 外部精度評価 / 検査の質保証 / 次世代シークエンサー / バイオインフォマティクス / 循環血中腫瘍由来DNA / 技能試験 / ISO 17043 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本邦の次世代シークエンサー（NGS）を用いたがん遺伝子パネル検査の結果の妥当性評価が不十分で、世界的に見ても立ち後れているため、その実態を調べるために外部精度評価 (EQA)／技能試験をがん患者の試料（がん組織と血球細胞）を用いて施行し、結果を参加者で共有した。そして、英文論文を2022年に公表（Sci Rep）できたので、最終年度のまとめとして各種学会（日本臨床検査医学会、日本遺伝子診療学会ほか）のシンポジウムなどで報告し内容の周知に努め、関係のステークホルダーにEQAの重要性について啓発した。また、昨年度の報告書に記載した最終年度に計画したこととして３つ掲げていたので、それらの進捗状況を報告する。
１）民間企業（EQAを実施できるISO 17043取得企業）との連携でEQAを行うことを企画し検討したが、実施対象機関数と経費（EQA実施にかかる経費と受検する検査機関が出せる予算）に大きな課題があるため、検討段階で止まっている状況である。国内でゲノム検査を普及するためにはEQAは必須であるが、予算建てとシステム化を進める必要がある。
２）NGSから得られるFASTQファイルを配布して、バイオインフォマティクス解析（dry process）のEQAを実施する件については、計画のみに留まった。
３）循環血中腫瘍由来DNA（circulating tumor DNA; ctDNA）検査のEQAの実態について文献調査し、実施するための基本的考え方を策定し、2023年3月に日本臨床検査振興協議会のホームページに掲載した。
本研究成果を活かしてEQAの対象を増やしていくこと、定期的にEQAを行えるシステム化を推進することが、本邦のゲノム検査の発展には不可欠であることを再認識した。
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[Journal Article] Falsely elevated thyroid hormonh levels associated with fibrin interference in patients receiving oral anticoagulant therapy.2023
Author(s)
Tokumaru M, Ohba K, Kashiwabara Y, Takase H, Tayashi C, Iwaki T, Suzuki Y, Matsushita A, Sasaki S, Suda T, Maekawa M
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Journal Title
Annals of Clinical Biochemistry
Volume: －
Pages: －
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Effects of long-acting muscarinic on promoting ciliary function in airway epithelium.2022
Author(s)
Katsumata M, Fujisawa T, Kamiya Y, Tanaka Y, Kamiya C, Inoue Y, Hozumi H, Karayama M, Suzuki Y, Furuhashi K, Enomoto N, Nakamura Y, Inui N, Maekawa M, Setou M, Watanabe H, Ikegami K, Suda T
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Journal Title
BMC Pulm Med.
Volume: 22(1)
Pages: 186
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Precision cancer genome testing needs proficiency testing involving all stakeholders.2022
Author(s)
Maekawa M, Taniguchi T, Nishio K, Sasaki K, Matsushita K, Nakatani K, Ishige T, Ikejiri M, Nishihara H, Sunami K, Yatabe Y, Hatanaka KC, Hatanaka Y, Yamamoto Y, Fukuyama K, Oda S, Saito K, Yokomura M, Kubo Y, Tanaka Y, Fuchioka M, Yamasaki T, Matsuda K, Kurachi K, Funai K, Baba S, Iwaizumi M
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Journal Title
Sci Rep.
Volume: 12(1):1494.
Pages: －
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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