The analysis of microbiota for intestinal colonization of ESBL-producing bacteria

2020 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 20K08843
• Research Institution: Nagasaki University
• Principal Investigator: 柳原 克紀 長崎大学, 医歯薬学総合研究科(医学系), 教授 (40315239)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: ESBL産生菌

Outline of Annual Research Achievements

大腸菌や肺炎桿菌に代表されるグラム陰性腸内細菌科細菌は、病原性が強く、重篤な感染症を引き起こす。近年、薬剤耐性菌は増加傾向であり、特に、基質特異性拡張型β-ラクタマーゼ（extended-spectrum β- lactamase：ESBL）産生菌は大きな問題となっている。ESBL産生腸内細菌は、2000年以降急速に増加し、様々な感染対策を講じても効果が認められないため、従来とは異なる新しい感染制御法が必要と考えられる。本菌の制御が難しい理由として、腸内細菌は常在細菌の一種であるため、腸管内に定着するとその排除は困難であることが指摘されている。薬剤耐性菌の定着や排除において腸内細菌叢(マイクロバイオーム)は大きな役割を果たすが、ESBL産生菌との関連性はわかっていない。

本研究では、【1】　ESBL産生腸内細菌が定着した患者から採取した糞便のマイクロバイオームを解析する、【2】同じ菌をマウスモデルに定着させ、検証実験を行う、【3】腸内環境を変化させることで定着を抑止できるかを明らかにする、を目的とする。

2020年度は、2015年ー2018年で分離された基ESBL産生菌のMLST(multi-locus sequence typing)解析を行ったところ、ST131が多かった。これらはキノロン耐性も有しており、QRDRの変異も複数有していた。

Current Status of Research Progress

4: Progress in research has been delayed.

Reason

対象となる菌の遺伝子解析が終了したものの、マウスの実験には着手できていないため

Strategy for Future Research Activity

ESBL産生菌をマウスに定着させ、糞便の菌叢解析を実施して、定着しやすさを検討する。

Causes of Carryover

今年度は動物実験をあまり実施しなかったが、来年度は多数のマウスを用いるため、令和3年度に使用する。