Gene expression mapping of esophageal cancer microenvironment by spatial transcriptomics

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20K09080
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 55020:Digestive surgery-related
• Research Institution: Kyushu University
• Principal Investigator: INOUE Shigetaka 九州大学, 医学研究院, 共同研究員 (00529802)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 白羽根 健吾 九州大学, 医学研究院, 共同研究員 (10529803) ; 岩本 千佳 九州大学, 医学研究院, 特任助教 (10752842) ; 大内田 研宙 九州大学, 医学研究院, 准教授 (20452708)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: 食道癌 / Visium / 空間的トランスクリプトーム / シングルセル解析 / 腫瘍微小環境

Outline of Final Research Achievements

In recent years, single-cell analysis has attracted attention for elucidating the mechanisms of cancer invasion and metastasis. we initiated this study using Visium, a new technology, to create a gene expression map consistent with conventional pathomorphology and to elucidate the tumor microenvironment. Data from esophageal cancer samples show that chemotherapy reduces the immunosuppressive capacity of regulatory T cells, cytotoxic T cells evade exhaustion, and helper T cells are induced to become more memory-intensive and prevent exhaustion. These results suggest that chemotherapy may enhance anti-tumor immunity by immune cells in esophageal cancer.

Free Research Field

医歯薬学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では、食道癌の化学療法前後での単一細胞レベルの遺伝子発現を解析することにより、術前化学療法がどのように免疫微小環境に影響を及ぼすか解明することを目的とした。食道癌の術前化学療法による腫瘍微小免疫環境の解明はこれまでほとんど報告がなかったため、本研究により化学療法反応性のバイオマーカー、微小環境中の治療標的を検討する一助となる可能性がある。