2021 Fiscal Year Research-status Report
Profiling of circulating micro RNA expression in patients with sepsis
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20K09305
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
梅村 穣 大阪大学, 医学系研究科, 招へい教員 (20743561)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
嶋津 岳士 大阪大学, 医学系研究科, 教授 (50196474) [Withdrawn]
山川 一馬 大阪医科薬科大学, 医学部, 准教授 (50597507)
小倉 裕司 大阪大学, 医学系研究科, 准教授 (70301265)
藤見 聡 地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪急性期・総合医療センター(臨床研究支援センター), 救急診療科, 主任部長 (70362720)
松本 寿健 大阪大学, 医学部附属病院, 特任助教(常勤) (70644003)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 敗血症 / 全身炎症反応 / マイクロRNA / バイオマーカー |
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| Outline of Annual Research Achievements |
Micro RNA（miRNA）は低分子non-coding RNAの一種で、相補的な配列を持つmRNAに結合して翻訳抑制による遺伝子の発現抑制を行っている。近年、末梢血中のExtracellular vesiclesに内包されたmiRNAが細胞間の情報伝達に重要な役割を果たしていることが示され、遺伝子調節療法や薬剤標的の発見、悪性腫瘍の早期診断など多くの分野での応用が期待されている。本研究は、敗血症患者における血清中のExtracellular vesiclesに内包されるmiRNAに着目し、その固有の発現パターンを解明することで、次世代の高感度バイオマーカーとして有用性を評価することを目的としている。
第一段階として、敗血症患者の末梢血中miRNA発現を、次世代シークエンサーを用いて網羅的に解析し、そのパターンを外傷患者、健常者と比較することで、その固有パターンを解明することを目指している。2020年度から2021年度にかけて敗血症患者30名、重症外傷患者10名、健常対照10名が研究に参加登録し、それぞれの被験者より血液検体を採取し、血清を保存した。現在、株式会社ビケンバイオミクスに依頼して、次世代シークエンサーを用いた血清中のmiRNAの解析を行っている。また本研究の第2段階として、先行研究で敗血症との関与が示唆された3種類のmiRNA(mir-99、mir-215、mir-328)のRT-PCR法による解析も予定しており、現在次世代シーケンサー解析と並行して、その症例登録を進めている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
研究発案時には想定していなかった新型コロナウイルス肺炎（COVID-19）の、国内における急速な感染拡大と蔓延により、当初は想定していたペースで被験者が集まらなかったが、現在は目標症例数に達しており、予定していた予定通りに解析を実行することができている。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は解析によって得られた情報と、被験者の病態、患者背景、一般採血検査結果、重症度、転帰を照らし合わせることで、敗血症特有のmiRNA発現パターン、並びに重症化や予後不良に関連するパターンを解明する予定である。また第2段階として3種類のmiRNAに関してRT-PCR法によって評価する。各miRNA発現レベルを健常対照と比較し、敗血症診断指標としての有用性を評価する。さらに各miRNA発現レベルと各重症度スコア、生命転帰の関連を解析し、重症度指標、転帰予測指標としての関連を評価するともに、経時的な各miRNA発現レベルの変化を解析し、治療効果判定指標としての有用性を評価する。
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| Causes of Carryover |
本研究の主要解析は次世代シークエンサーによるmiRNAの網羅的解析である。50症例の次世代シークエンサー解析に費やす費用は2000000円であり、2021年度までの交付額では足りなかったため、2022年度に繰り越して2022年度の交付額と合わせて支払いを行う必要が生じたため。
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