2020 Fiscal Year Research-status Report
卵巣漿液性癌におけるDNA脱メチル化産物5hmCと転移に関する研究
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20K09646
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
小野山 一郎 九州大学, 大学病院, 助教 (00444802)
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2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | DNA脱メチル化 / 5hmC / 卵巣漿液性癌 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
癌におけるエピジェネティクス研究はDNAメチル化とヒストン修飾を中心に大いに発展してきたが、DNAメチル化が精力的に研究されて来たのに対して、DNA脱メチル化に関してはまだまだ解明されていないことが多い。そこで申請者はDNA脱メチル化の過程で産生される５ヒドロキシメチルシトシン（5hmC）と癌に着目して研究を進めている。
本研究課題において申請者は、卵巣漿液性癌の転移症例で5hmCレベルが高いことを見出した。現在は卵巣漿液性癌における5hmCレベルの違いが転移の有無とどのように関わっているのかを明らかにすることを目的に解析を行っている。具体的にはゲノム上のどの領域で5hmCレベルにどのような差があるのかを臨床検体を用いて次世代シークエンサーでの解析を行っている。最終的には癌の形質（転移の有無）と5hmCレベルの差異をエピゲノムレベルで結びつけることを目標としており、5hmCと癌の進展・転移との関係およびその機構を明らかにすることは癌を全く新しい視点で捉える研究に繋がり、癌研究における新しい領域となることが期待される。
また本研究課題に密接に関連した研究として、5hmCレベルの子宮頸癌発癌過程における変化について解析し、そのメカニズムの一端を明らかにした成果を論文発表した。この論文ではまずCIN3、子宮頸癌症例において5hmCレベルが低下することを明らかにし、子宮頸癌の原因であるヒトパピローマウイルスに細胞が感染した後、どのように5hmCレベルが低下するのかを明らかにしている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本研究課題の解析の根幹となるのは卵巣癌臨床検体を用いたゲノムワイドな5hmCの解析である。具体的には卵巣癌の手術検体からDNAを抽出し、抗5hmC抗体を用いた免疫沈降を行って次世代シークエンサー用のライブラリーを作製する必要がある。非常に行程の多い実験で、数々の基礎検討が必要であるが、当該年度までに既にこの実験を行って必要なデータは取得しており、予定通り順調に進んでいると考えることができる。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は当初の予定通り、次世代シークエンサーで取得したデータを卵巣癌検体の臨床病理学的特徴に照らし合わせ、バイオインフォマティシャンと密なディスカッションを行いながら意味のあるデータを取り出す作業に取り掛かる。現時点ではどのような方向性でデータをまとめるか、まだ明らかになっていないので詳細に述べることはできない。
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| Causes of Carryover |
次世代シークエンサーを用いた解析は年々価格が安くなってきており、次年度使用額が生じた主な理由となっている。今後、解析を進めた時に更なるサンプル数の確保が必要になることも想定され、当該年度に使用しなかった予算を充てることとしている。
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