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2020 Fiscal Year Research-status Report

DNA損傷時のユビキチンリガーゼRNF126による転写制御メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 20K12157
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

石田 典子  東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 助教 (10361073)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中川 直  山陽小野田市立山口東京理科大学, 薬学部, 講師 (30707013)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywordsユビキチンリガーゼ / タンパク分解 / ユビキチン化 / 転写制御
Outline of Annual Research Achievements

DNA損傷時にDNA損傷修復と転写制御がユビキチン依存性タンパク質分解を介して協調的に制御されていることを示すことが本研究の目標であり、代表者らがDNA修復因子Ku80のユビキチンリガーゼとして発見した、RNF126によるヒストンシャペロンNAP1L1のタンパク分解を介した、DNA損傷におけるクロマチン構造変換と転写制御メカニズムを明らかにしたい。
代表者らはこれまでにNAP1のカウンターパートであるNAP1L1がユビキチンリガーゼRNF126と結合し、ユビキチン化されてタンパク質分解を受けることを発見した。細胞株を用い、野生型やユビキチン化活性を欠損した変異体RNF126の過剰発現やsiRNAによるRNF126のノックダウン細胞を解析した結果、RNF126は細胞周期のG2初期にNAP1L1の分解を促すことで、増殖に重要な転写因子E2F-1のクロマチンへの結合量と転写活性を負に制御しているのではないかと考えられた。E2F-1はNAP1, NAP2と結合し、コアクチベーターp300/CBPと転写複合体を形成して働くことがこれまでに報告されており、RNF126はNAP1L1のタンパク質分解を介してクロマチン構造を変化させ、転写複合体アセンブリーを制御しているという仮設が考えられた。この仮説を検証するために、NAP1L1のタンパク質発現量を調べて細胞周期を通じて一定であること、またS期のみ核局在を示す結果を得た。しかし、ガンマ線照射時にはNAP1L1の発現量低下が確認された。DNA損傷時には、S期でもNAP1L1が分解を受けて機能を停止すると考えられ、生化学的手法を用いて解析を進めている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

4: Progress in research has been delayed.

Reason

代表者が所属する東北メディカル・メガバンク機構バイオバンク部門は、コホート研究等における検体の受入・処理・保管管理等が主な業務であり、新型コロナ禍の影響による業務の大幅な変更が生じて対応にも追われ、今年度の予定が遅れている状況である。期間延長した、別課題の基盤Cをまとめるためにそちらに注力したことも本課題研究の遅れの一因である。

Strategy for Future Research Activity

新型コロナ禍の影響による対応も落ち着き、別課題の基盤Cの論文準備も進んでいるため、半年以上の遅れはあるものの、今後の研究の遂行に大きな問題はないと考える。

Causes of Carryover

新型コロナ禍の影響による代表者所属機関業務の対応、別課題(基盤C)に注力したことにより、本課題研究に遅れが生じた。新型コロナ禍の影響による対応も落ち着き、別課題の論文化準備も進んでいるため、半年程度の遅れはあるものの、予定通りに研究を進めて予算を使用する予定である。

  • Research Products

    (9 results)

All 2020

All Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 2 results) Presentation (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Landscape of electrophilic and inflammatory stress-mediated gene regulation in human lymphoblastoid cell lines2020

    • Author(s)
      Ishida Noriko、Aoki Yuichi、Katsuoka Fumiki、Nishijima Ichiko、Nobukuni Takahiro、Anzawa Hayato、Bin Li、Tsuda Miyuki、Kumada Kazuki、Kudo Hisaaki、Terakawa Takahiro、Otsuki Akihito、Kinoshita Kengo、Yamashita Riu、Minegishi Naoko、Yamamoto Masayuki
    • Journal Title

      Free Radical Biology and Medicine

      Volume: 161 Pages: 71~83

    • DOI

      10.1016/j.freeradbiomed.2020.09.023

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The Autism-Related Protein SETD5 Controls Neural Cell Proliferation through Epigenetic Regulation of rDNA Expression2020

    • Author(s)
      Nakagawa Tadashi、Hattori Satoko、Nobuta Risa、Kimura Ryuichi、Nakagawa Makiko、Matsumoto Masaki、Nagasawa Yuko、Funayama Ryo、Miyakawa Tsuyoshi、Inada Toshifumi、Osumi Noriko、Nakayama Keiichi I.、Nakayama Keiko
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 23 Pages: 101030~101030

    • DOI

      10.1016/j.isci.2020.101030

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Knockout Mouse Models Provide Insight into the Biological Functions of CRL1 Components2020

    • Author(s)
      Nakagawa Tadashi、Nakayama Keiko、Nakayama Keiichi I.
    • Journal Title

      Advances in experimental medicine and biology

      Volume: 1217 Pages: 147~171

    • DOI

      10.1007/978-981-15-1025-0_10

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of Dominant Transcripts in Oxidative Stress Response by a Full-Length Transcriptome Analysis2020

    • Author(s)
      Otsuki Akihito、Okamura Yasunobu、Aoki Yuichi、Ishida Noriko、Kumada Kazuki、Minegishi Naoko、Katsuoka Fumiki、Kinoshita Kengo、Yamamoto Masayuki
    • Journal Title

      Molecular and Cellular Biology

      Volume: 41 Pages: 1-18

    • DOI

      10.1128/mcb.00472-20

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A multi-ethnic meta-analysis identifies novel genes, including ACSL5, associated with amyotrophic lateral sclerosis2020

    • Author(s)
      Nakamura Ryoichi、Misawa Kazuharu、Tohnai Genki、et al.
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 3 Pages: 1-9

    • DOI

      10.1038/s42003-020-01251-2

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] USP15 suppresses tumor immunity via deubiquitylation and inactivation of TET22020

    • Author(s)
      Chen Lei-lei、Smith Matthew D.、Lv Lei、Nakagawa Tadashi、Li Zhijun、Sun Shao-Cong、Brown Nicholas G.、Xiong Yue、Xu Yan-ping
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 6 Pages: 1-13

    • DOI

      10.1126/sciadv.abc9730

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] An Amyotrophic Lateral Sclerosis-Associated Mutant of C21ORF2 Is Stabilized by NEK1-Mediated Hyperphosphorylation and the Inability to Bind FBXO32020

    • Author(s)
      Watanabe Yasuaki、Nakagawa Tadashi、Akiyama Tetsuya、Nakagawa Makiko、Suzuki Naoki、Warita Hitoshi、Aoki Masashi、Nakayama Keiko
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 23 Pages: 101491~101491

    • DOI

      10.1016/j.isci.2020.101491

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Longitudinal plasma amino acid profiling with maternal genomic background throughout human pregnancy2020

    • Author(s)
      M Shirota, D Saigusa, R Yamashita, Y Kato, M Matsumoto, J Yamagishi, N Ishida, K Kumada, Y Oe, H Kudo, J Yokozawa, Y Kuroki, I Motoike, F Katsuoka, M Nagasaki, S Koshiba, K Nakayama, O Tanabe, J Yasuda, S Kure, K Kinoshita, H Metoki, S Kuriyama, N Yaegashi, M Yamamoto, J Sugawara
    • Journal Title

      Medical Mass Spectrometry

      Volume: 4 Pages: 36-49

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 自閉症関連タンパク質SETD5によるrDNAのエピジェネティック制御を介した神経細胞の増殖促進2020

    • Author(s)
      中川 直、中山 啓子
    • Organizer
      第10回武田科学振興財団 薬科学シンポジウム(国際学会)
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2021-12-27  

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