Early detection of raccoons by DNA from food scars and abandoned fruit stands

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20K15641
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 41050:Environmental agriculture-related
• Research Institution: National Agriculture and Food Research Organization
• Principal Investigator: KOZAKAI Chinatsu 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 畜産研究部門, 主任研究員 (90637670)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 環境DNA / 鳥獣害 / 特定外来生物 / アライグマ / 食痕 / LAMP法 / メタバーコディング / 食性解析

Outline of Final Research Achievements

We developed a simple method to collect environmental DNA (DNA of the animal attacked left behind in feeding marks) and established a simple and rapid species identification method combined with the LAMP amplification method. In addition, we found that quantitative PCR method can detect raccoon's DNA from water used by raccoons for up to one month or longer, and that DNA of the dameged crop can only be detected in feces for a short period of about one day after foraging.

Free Research Field

鳥獣害対策

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

鳥獣害対策では加害した動物種や加害された作物種を正しく判別し、加害種に応じた効果的な対策を実施することが重要である。特にアライグマ等の特定外来生物の生息や被害を早期発見することは、生物多様性保全や人獣共通感染症リスクを下げる観点からも非常に重要である。本課題で開発に取り組んだ簡単・迅速な種判別法は分析費用が抑えられ、難しい分析技術が必要無いことから、鳥獣害や外来種の対策現場でも十分に活用できる対策手法である。