Identification of functional domain of MALAT1 lncRNA in heat shock response

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20K15988
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 47030:Pharmaceutical hygiene and biochemistry-related
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: Onoguchi Rena 東京大学, アイソトープ総合センター, 特任助教 (30780697)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: 長鎖非コードRNA / 核内構造体

Outline of Final Research Achievements

MALAT1, one of the most abundant and highly conserved long noncoding RNAs, is thought to be critical regulator of cancer progression. In our recent study, we found that heat shock stress induced translocation of MALAT1 from nuclear speckle, one of nuclear bodies, to a distinct nuclear body named HiNoCo body. However, specific RNA domains dictating HiNoCo body formation in heat shock response remain unknown. In this study, we established the cell lines which express the several kinds of deletion mutants of MALAT1 and investigated their localization under heat shock condition. We identified the RNA domain of MALAT1 that is required for localization during heat shock stress.

Free Research Field

分子生物学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

機能ドメインの情報が不足している非コードRNAは、タンパク質と異なり一次配列から機能を推定することが困難である。先行研究により、一部の非コードRNAについてはドメイン解析が行われている。MALAT1に関しても核スペックル局在に必要な最小配列は同定されているが、他の領域の機能は不明であった。本研究によって同定された、熱ストレスに応答したMALAT1の局在変化に重要なドメインの情報はこれまでの概念とは異なる非コードRNAによる熱ストレス応答の分子基盤の解明につがなることが期待される。