2022 Fiscal Year Research-status Report
AI画像診断支援システムの構築~重篤な救急頭部疾患を診断・予測する~
Project/Area Number |
20K16737
|
Research Institution | Juntendo University |
Principal Investigator |
菊田 潤子 順天堂大学, 医学部, 助教 (70613389)
|
Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
|
Keywords | 機械学習 / 頭部画像 |
Outline of Annual Research Achievements |
2022年度はまず、頭部MRIを用いて大脳白質病変を検出する機械学習システムの構築を試みた。オープンデータベースOASIS-3から83名(平均68.94±7.77歳)のFLAIR画像2731枚を取得。Fazekas scaleを用いて大脳白質病変を視覚的評価し、手動で白質病変をラベリング後、訓練データ:テストデータ=4:1に分割した。Windows10 ProのGPU上(NVIDIA RTX A5000)でSONYのNeural network consoleを用いて、U-Netモデルを構築。機械学習モデルと手動でラベリングした病変との一致率をDice係数を用いて評価した。手動でラベリングした白質病変の体積をFreeSurfer6.0.で測定し、Spearmanの順位相関係数を用いて白質病変の体積とDice係数との相関を調べた。この結果、平均Dice係数は0.687±0.104、大脳白質病変の体積とDice係数は有意な正相関を認めた(r=0.857, p<0.001)。 次に、頭部MRIを用いて血管周囲腔を自動検出する機械学習モデルを構築した。公開データベースHuman Connectome Projectから健常者69名 (平均年齢28.87±4.06歳)のMRIを取得後、FMRIB Software Library (FSL) version6.0.上で血管周囲腔の描出を明瞭にするためT1強調像をT2強調像で除した画像を作成した。次に頭蓋骨、脳幹部、大脳基底核、大脳皮質を除去した大脳白質のみの画像を作成後、手動で血管周囲腔を抽出。教師データを訓練・検証データが4:1になるよう分割し、U-Netモデルを構築後、手動検出と自動検出された血管周囲腔との一致度を表すDice係数を用いて汎化能を評価した。この結果、大脳白質のみの画像のDice係数は平均値0.493±0.042、全脳画像のDice係数は平均値0.385±0.064で、大脳白質のみの画像のDice係数は全脳画像より有意に高かった (p=0.001) 。
|
Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
2022年度は頭部画像と機械学習モデルを用いた2つの研究を実施し、機械学習についての知識をより深めることができた。さらに、2023年2月に日本神経放射線学会での発表を行い、今後は論文作成および投稿を行っていく予定である。
|
Strategy for Future Research Activity |
引き続き機械学習モデルについての情報収集や知識を深め、2022年度に実施した研究結果の論文作成を行う。
|
Causes of Carryover |
国際学会および国内学会での研究発表と講演が控えており、経費を使用して行う予定である。
|
Research Products
(16 results)
-
-
-
-
-
[Journal Article] Effects of Arterial Stiffness on Cerebral WM Integrity in Older Adults: A Neurite Orientation Dispersion and Density Imaging and Magnetization Transfer Saturation Imaging Study.2022
Author(s)
Kikuta, J.; Kamagata, K.; Abe, M.; Andica, C.; Saito, Y.; Takabayashi, K.; Uchida, W.; Naito, H.; Tabata, H.; Wada, A.; Tamura, Y.; Kawamori, R.; Watada, H.; Aoki, S
-
Journal Title
American Journal of Neuroradiology
Volume: 43 (12)
Pages: 1706
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
-
-
[Presentation] Alterations in ALPS index and choroid plexus volume after lumboperitoneal shunt in patients with idiopathic normal pressure hydrocephalus.2022
Author(s)
Junko Kikuta, Koji Kamagata, Toshiaki Taoka, Kaito Takabayashi, Wataru Uchida, Akihiko Wada, Kaito Kawamura, Chihiro Akiba, Madoka Nakajima, Masakazu Miyajima, Shinji Naganawa, Shigeki Aoki.
Organizer
ISMRM2022. May 15-20, London, UK
Int'l Joint Research
-
[Presentation] What Do We Know About Emerging Methods for Imaging The Glymphatic System?2022
Author(s)
Yuichi Morita, Koji Kamagata, Kaito Takabayashi, Christina Andica, Junko Kikuta, Wataru Uchida, Toshiaki Akashi, Akihiko Wada, Toshiaki Taoka, Shinji Naganawa, Shigeki Aoki.
Organizer
RSNA2022. Nov. 26‐30, Chicago, USA.
Int'l Joint Research
-
[Presentation] The effect of alcohol consumption on the glymphatic system: Evaluation by diffusion tensor image analysis along the perivascular space (DTI-ALPS).2022
Author(s)
Yuichi Morita, Koji Kamagata, Kaito Takabayashi, Christina Andica, Shohei Fujita, Junko Kikuta, Samoyeau Thomas, Hiroki Tabata, Hitoshi Naito, Yuki Someya, Hideyoshi Kaga, Toshiaki Akashi, Akihiko Wada, Yoshifumi Tamura, Ryuzo Kawamori, Hirotaka Watada, Toshiaki Taoka, Shinji Naganawa, Osamu Abe, Shigeki Aoki.
Organizer
第50回日本磁気共鳴学会大会、2022年9月9日~11日、名古屋
-
[Presentation] Effects of Arterial Stiffness on Cerebral White Matter Integrity in the Elderly.2022
Author(s)
Junko Kikuta, Koji Kamagata, Masahiro Abe, Christina Andica, Yuya Saito, Kaito Takabayashi, Wataru Uchida, Hitoshi Naito, Hiroki Tabata, Yoshifumi Tamura, Akihiko Wada, Ryuzo Kawamori, Hirotaka Watada, Shigeki Aoki.
Organizer
第50回日本磁気共鳴学会大会、2022年9月9日~11日、名古屋
-
[Presentation] Glymphatic system activity may be disrupted in moyamoya disease: the diffusion.2022
Author(s)
Shoko Hara, Junko Kikuta, Kaito Takabayashi, Koji Kamagata, Motoki Inaji, Yoji Tanaka, Tadashi Nariai, Masaaki Hori, Kenji Ishii, Toshiaki Taoka, Shinji Naganawa, Shigeki Aoki, Taketoshi Maehara.
Organizer
第50回日本磁気共鳴学会大会、2022年9月9日~11日、名古屋 (学術奨励賞/ 第50回大会『臨床/疾患部門』最優秀賞受賞)
-
[Presentation] もやもや病における拡散MRIを用いたGlymphatic system機能評価2022
Author(s)
原 祥子, 菊田 潤子, 高林 海斗, 鎌形 康司, 稲次 基希, 田中 洋次, 成相 直,堀 正明, 石井 賢ニ, 田岡 俊昭, 長縄 慎二, 青木 茂樹, 前原 健寿.
Organizer
日本脳神経外科学会 第81回学術総会、2022年9月28日‐10月1日
-