2023 Fiscal Year Annual Research Report
1細胞RNAsequenceによる血液精巣関門の成立の解明と男性不妊治療への応用
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20K18149
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Research Institution | Nagoya City University |
Principal Investigator |
加藤 大貴 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 研究員 (00620931)
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Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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Keywords | シングルセル / 精巣 / 造精機能障害 / 停留精巣 |
Outline of Annual Research Achievements |
昨年、ラットの停留精巣をsingle cellに分散することができず、核抽出の技術を用いて停留精巣に伴う造精機能障害に関わる遺伝子制御ネットワークの解明を行う方針とした。10x Genomics社のThe Chromium Single Cell ATAC(Assay for Transposase Accessible Chromatin) Solution の手法を用いて、Cyberomix社へ受託サービスを依頼する方針とした。Webにてミーティングを行い、先方とディスカッションを行った。停留精巣における造精機能障害の原因の仮説は、思春期に減数分裂が正常どおり進まないこと、であった。しかし、ディスカッションを行った際、思春期後では精巣内の細胞の種類が増大し、解析が複雑となる。何らかの成果が得られたとしても、データ自体を解釈できない可能性がある、ことを指摘された。また、ラットを対象とした研究の経験がないこと、受託の費用が1サンプルあたり100万円を超える高額であることが判明した。さらに、データ解析の手順や伴う専門用語が多く、理解が難解であった。研究チーム内で話合いを行い、いったん受託研究は凍結し、ATAC-seqについて理解を深めてから受託研究を行う方針とした。 上記のように、本年は実験を進めるよりも、既報の報告の論文を読んで解析手法や結果の解釈について学ぶため、座学に割く時間が多くなった。受託費用を抑えるため、新たなキットを用いてシングルセル化とデブリの除去を試みたが、条件がなかなか整わず、解析までいたらなかった。
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Research Products
(10 results)
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[Journal Article] A Multicenter, Prospective, Non-randomized Study Evaluating Surgical hand Preparation between Double-Gloving and Single-Gloving for Preventing Postoperative Infection in Robotic and Laparoscopic Minimally Invasive Surgeries2023
Author(s)
Nagai Takashi, Taguchi Kazumi, Isobe Teruki, Matsuyama Nayuka, Hattori Tatsuya, Unno Rei, Kato Taiki, Etani Toshiki, Hamakawa Takashi, Fujii Yasuhiro, Ikegami Yosuke, Kamiya Hiroyuki, Hamamoto Shuzo, Nakane Akihiro, Ando Ryosuke, Maruyama Tetsuji, Okada Atsushi, Kawai Noriyasu, Yasui Takahiro
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Journal Title
Urol J
Volume: 20
Pages: 109,115
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Surgical management of prepubertal testicular tumors: A 30-year study in our institution2023
Author(s)
Nishio Hidenori, Mizuno Kentaro, Kato Taiki, Kamisawa Hideyuki, Kurokawa Satoshi, Nakane Akihiro, Maruyama Tetsuji, Kawai Noriyasu, Yasui Takahiro, Hayashi Yutaro
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Journal Title
Int J Urol
Volume: 30
Pages: 521,525
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Postoperative Bladder Neck to Pubic Symphysis Ratio Predictive for De Novo Overactive Bladder after Robot-Assisted Radical Prostatectomy2023
Author(s)
Matsuyama Nayuka, Naiki Taku, Hamamoto Shuzo, Sugiyama Yosuke, Kubota Yasue, Hamakawa Takashi, Etani Toshiki, Iwatsuki Shoichiro, Taguchi Kazumi, Ota Yuya, Gonda Masakazu, Aoki Maria, Morikawa Toshiharu, Kato Taiki, Okada Atsushi, Yasui Takahiro
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Journal Title
Diagnostics
Volume: 13
Pages: 3173
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Successful treatment with enfortumab, vedotin of metastatic signet ring cell cancer expressing nectin-4 and originating from the bladder2023
Author(s)
Aoki Maria, Naiki Taku, Naiki-Ito Aya, Morikawa Toshiharu, Matsuyama Nayuka, Torii Koei, Kato Taiki, Maruyama Tetsuji, Inaguma Shingo, Yasui Takahiro
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Journal Title
IJU Case Reports
Volume: 7
Pages: 101-104
DOI
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