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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Establishments of Biothermology which discusses heat and temperature in molecular, cellular and evolutionary sspects

Research Project

Project/Area Number 17H06258
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionNational Institute for Basic Biology

Principal Investigator

亀井 保博  基礎生物学研究所, 生物機能解析センター, 特任准教授 (70372563)

Project Period (FY) 2017-06-30 – 2023-03-31
Keywords熱ショック応答 / HSF / 赤外レーザー / イメージング / 温度計測 / 単一細胞 / biothermology / 分子進化
Outline of Annual Research Achievements

本研究課題の目的は、生物における温度に関わる現象を理解するための理論を考えることである。30年度は、研究計画の初動として、現在までに異生物種HSF1の利用による熱ショック応答温度を変える方法のトランスジェニック動物での実証のための準備として、レシピエントであるメダカHSF1のKOを確立し、約10種の生物種のHSF1のインシリコクローニングを完了し、数種類を実際にクローニングして培養細胞に導入・発現させて、熱ショック応答温度を解析した。応答温度低下が大きすぎると飼育温度も下げる必要が生じるため、30年度には、飼育と応答温度で最良の組み合わせを検討する。また、それぞれのHSF1の3量体形成温度やHSE配列との温度依存的な結合特性解析を、組換えタンパク質で実施する。一方で、温度計測系では、共同研究先の大阪大学と共にgTEMPと名付けた蛍光タンパク質温度プローブを報告しているが、光毒性の少ない長波長域で励起が可能なverを開発し、培養細胞系への導入が完了し、赤外レーザー照射による温度変化を高速で観測できる顕微鏡の構築も完了した。赤外レーザー照射部位の温度計測プローブによる高速温度イメージングが可能となったが、組み換えタンパク質と、培養細胞発現系における温度-蛍光レシオ検量線の一致度が低く、現在その原因探索と改善を検討中である。IR-LEGO顕微鏡法の応用として国際共同研究も実施し、熱ショック応答による遺伝子発現ではなく、単一細胞アブレーションによる神経細胞再生過程の解析に加え、分子同定のための追加実験を実施した。これらの成果は近日投稿予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本課題は2つのカテゴリーを同時並行で進める計画となっており、【A】生体構成要素(オルガネラ・細胞質・生体分子など)の熱的な物理特性の解析と、【B】生体分子(タンパク質、核酸)の熱・温度に対する物性の進化過程における変化の解析を計画している。まず、【A】については、細胞レベルでの熱的物性評価系として、温度計測プローブの開発と、高速温度イメージング顕微鏡の開発の2つが前提条件となる。一昨年度は備品としてW-View Gemini(顕微鏡イメージング用分光装置)を購入し、高速ライトシート顕微鏡(基礎生物学研究所野中准教授の協力)へ導入する予定であったが、赤外レーザー導入光学系の設置が空間的に困難であるため、まずは通常の蛍光顕微鏡による高速温度計測系を構築し、実測まで達成できた。以上から、Aに関しては予定通り進捗しているといえる。【B】に関しては、HSF1をモデルに複数生物種において生息温度と、熱ショック応答温度の評価を、in vivoとin vitroで実施する予定であるが、in vivoの土台となるメダカHSF1-KO系統を樹立(投稿中)し、培養細胞系における評価を実施するまでに至った。今後はin vitro系での複数生物種の組換えタンパク質を行うが、そのベースとなる配列はクローニングを完了し、ベクター構築まで進んでいる。以上からBに関しても順調に進捗していると考えている。

Strategy for Future Research Activity

現状の進捗は予定通り進んでいるため、31年度に特段の変更は考えていない。一方で、当所計画と異なる点としては、別件外部資金が採択となり、一部の研究機器(顕微鏡関連と、分子生物学的な機器類)の購入したため、共通で使用できる装置を予定以上に揃えることができ、今後の計画での実験手技の幅が広がったので、必要に応じて新たな検証実験を加えることを考える。具体的には、高速細胞温度計測顕微鏡のリアルタイム演算のためのPCの購入ができたので当所計画では画像取得後に演算する予定であったが、リアルタイムで表示できるようにする。直接的には研究に直結しない部分であるが、これまでに、バイオサーモロジーワークショップを開催してきたが、31年度にも開催を継続する。共同研究者や、関連分野の研究者と相談して講演者をすでに決定し、開催に向けて準備を進めている。このワークショップを通じて、本研究課題遂行に必要な情報交換や、共同研究を積極的に模索する。

  • Research Products

    (21 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 6 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] National University of Taiwan/Mckey Medical Collage(その他の国・地域)

    • Country Name
      その他の国・地域
    • Counterpart Institution
      National University of Taiwan/Mckey Medical Collage
  • [Int'l Joint Research] Heidelberg University(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      Heidelberg University
  • [Journal Article] Seasonal regulation of the lncRNA LDAIR modulates self-protective behaviours during the breeding season2019

    • Author(s)
      Nakayama Tomoya、Shimmura Tsuyoshi、Shinomiya Ai、Okimura Kousuke、Takehana Yusuke、Furukawa Yuko、Shimo Takayuki、Senga Takumi、Nakatsukasa Mana、Nishimura Toshiya、Tanaka Minoru、Okubo Kataaki、Kamei Yasuhiro、Naruse Kiyoshi、Yoshimura Takashi
    • Journal Title

      Nature Ecology & Evolution

      Volume: 3 Pages: 845~852

    • DOI

      10.1038/s41559-019-0866-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Development of omnidirectional aerial display with aerial imaging by retro-reflection (AIRR) for behavioral biology experiments2019

    • Author(s)
      Abe Erina、Yasugi Masaki、Takeuchi Hideaki、Watanabe Eiji、Kamei Yasuhiro、Yamamoto Hirotsugu
    • Journal Title

      Optical Review

      Volume: 26 Pages: 221-229

    • DOI

      10.1007/s10043-019-00502-w

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evolutionary history of the medaka long-wavelength sensitive genes and effects of artificial regression by gene loss on behavioural photosensitivity2019

    • Author(s)
      Harada Yumi、Matsuo Megumi、Kamei Yasuhiro、Goto Mayuko、Fukamachi Shoji
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Pages: 2726

    • DOI

      10.1038/s41598-019-39978-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Development of the coelomic cavities in larvae of the living isocrinid sea lily Metacrinus rotundus2018

    • Author(s)
      Amemiya Shonan、Hibino Taku、Minokawa Takuya、Naruse Kiyoshi、Kamei Yasuhiro、Uemura Isao、Kiyomoto Masato、Hisanaga Shin-ichi、Kuraishi Ritsu
    • Journal Title

      Acta Zoologica

      Volume: 00 Pages: 1-17

    • DOI

      10.1111/azo.12274

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A comparative study of wavelength-dependent photoinactivation in photosystem II of drought-tolerant photosynthetic organisms in Antarctica and the potential risks of photoinhibition in the habitat2018

    • Author(s)
      Kosugi Makiko、Maruo Fumino、Inoue Takeshi、Kurosawa Norio、Kawamata Akinori、Koike Hiroyuki、Kamei Yasuhiro、Kudoh Sakae、Imura Satoshi
    • Journal Title

      Annals of Botany

      Volume: 122 Pages: 1263-1278

    • DOI

      10.1093/aob/mcy139

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A semi-automatic and quantitative method to evaluate behavioral photosensitivity in animals based on the optomotor response (OMR)2018

    • Author(s)
      Matsuo Megumi、Ando Yoriko、Kamei Yasuhiro、Fukamachi Shoji
    • Journal Title

      Biology Open

      Volume: 7 Pages: 033175

    • DOI

      10.1242/bio.033175

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Overexpression of the protein disulfide isomerase AtCYO1 in chloroplasts slows dark-induced senescence in Arabidopsis2018

    • Author(s)
      Tominaga Jun、Nakahara Yasutoshi、Horikawa Daisuke、Tanaka Ayumi、Kondo Maki、Kamei Yasuhiro、Takami Tsuneaki、Sakamoto Wataru、Unno Kazutoshi、Sakamoto Atsushi、Shimada Hiroshi
    • Journal Title

      BMC Plant Biology

      Volume: 18 Pages: 80

    • DOI

      10.1186/s12870-018-1294-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Infrared Laser-Mediated Gene Induction at the Single-Cell Level in the Regenerating Tail of Xenopus laevis Tadpoles2018

    • Author(s)
      Hasugata Riho、Hayashi Shinichi、Kawasumi-Kita Aiko、Sakamoto Joe、Kamei Yasuhiro、Yokoyama Hitoshi
    • Journal Title

      Cold Spring Harbor Protocols

      Volume: 2018 Pages: 101014

    • DOI

      10.1101/pdb.prot101014

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Distinct interactions of Sox5 and Sox10 in fate specification of pigment cells in medaka and zebrafish2018

    • Author(s)
      Nagao Yusuke、Takada Hiroyuki、Miyadai Motohiro、Adachi Tomoko、Seki Ryoko、Kamei Yasuhiro、Hara Ikuyo、Taniguchi Yoshihito、Naruse Kiyoshi、Hibi Masahiko、Kelsh Robert N.、Hashimoto Hisashi
    • Journal Title

      PLOS Genetics

      Volume: 14 Pages: 1007260

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1007260

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 総論:メダカの行動学研究の最先端 ─メダカはなぜ豊かな色彩を持つのか?2018

    • Author(s)
      竹内秀明、深町昌司、亀井保博、成瀬清
    • Journal Title

      生物の科学 遺伝

      Volume: 72 Pages: 608-610

  • [Presentation] Analysis of Temperature Dynamics Using Fluorescent Thermo-probe2019

    • Author(s)
      Joe Sakamoto, Atsushi Taniguchi, Tatsuya Noda, Yuko Kamikawa, Masahiro Nakano, Takeharu Nagai, Yuichi Togashi, Shigenori Nonaka, and Yasuhiro Kamei
    • Organizer
      The 66th NIBB Conference / ABiS International Symposium "Cutting Edge Techniques of Bioimaging"
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Biological and Optical improvement of IR laser-mediated gene induction microscope system2018

    • Author(s)
      Yasuhiro Kamei
    • Organizer
      4th Strategic Meeting for Medaka Research
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 様々なモデル生物種に応用可能な単一細胞/局所遺伝子発現顕微鏡法の原理と応用2018

    • Author(s)
      亀井保博
    • Organizer
      再生学異分野融合研究会
    • Invited
  • [Presentation] 様々な生物種を使って生物学研究ツールを作り,生物学の新分野創成を目指す -Biothermologyはじめました-2018

    • Author(s)
      亀井保博
    • Organizer
      第12回日本ツメガエル研究集会 第4回次世代両生類研究会 合同シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Biothermological and Molecular Biological Study on Heat Schock Transcription Factor 1 using medaka and other organisms.2018

    • Author(s)
      Joe Sakamoto, Eriko Chisada, Pham Van Cuong, Hayato Yokoi Takeshi Kitano and Yasuhiro Kamei
    • Organizer
      Japanese Medaka and Zebrafish meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] HSF1 の比較生物学的解析:IR-LEGO への展開2018

    • Author(s)
      坂本丞、苣田英理子、Pham Van Cuong、横井勇人、北野健、亀井保博
    • Organizer
      日本動物学会 第89回大会
  • [Presentation] 熱ショック転写因子1の比較生物学的解析およびその局所遺伝子発現誘導法への応用2018

    • Author(s)
      坂本丞、苣田英理子、Pham Van Cuong、横井勇人、北野健、亀井保博
    • Organizer
      第41回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 温度イメージングを用いた生体物質の熱動態解析2018

    • Author(s)
      坂本丞, 谷口篤史, 野田達也, 上川優子, 中野雅裕, 永井健治, 冨樫祐一, 野中茂紀, 亀井保博
    • Organizer
      Biothermology Workshop 2018
  • [Remarks] 基礎生物学研究所光学解析室HP(施設・研究室)

    • URL

      http://www.nibb.ac.jp/lspectro/

URL: 

Published: 2019-12-27   Modified: 2020-07-30  

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