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2010 Fiscal Year Annual Research Report

一分子生理学を超えて:生体分子機械を力で優しく働かせる

Research Project

Project/Area Number 21000011
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

木下 一彦  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (30124366)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 石渡 信一  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (10130866)
Keywords1分子計測・操作 / 1分子生理・生化学 / 生体エネルギー変換 / 回転分子モーター / ATP合成酵素 / F1-ATPase / トポイソメラーゼ / 紡錘体
Research Abstract

(1)R-ATPaseの回転機構
前年度に引き続き、回転分子モーターF_1-ATPaseの3つの活性部位それぞれのATPおよびADPに対する結合・解離速度常数を回転角の関数として決定した。いずれも回転角に対して100倍以上変化し、角度依存性はなめらかであった。結合常数は4桁以上の変化を見せ、ATPとADPでは角度依存性がずれていた。また、回転子頭部を完全に削除した変異体でも回転することが分かり、回転特性を調尺べている。この酵素は、少量のSDS(界面活性剤)存在下でかえって活性化され、回転分子数も増えることが示された。
(2)ATP合成酵素
F_0F_1の親戚であるV_0V_1-ATP合成酵素のATP駆動の回転において、30度おきのサブステップが見えた。V_0部分の対称性(V_0-cサブユニット12個)を反映するもので、ATP駆動のモーター(V_1)の回転がプロトンモーター部分(V_0)での相互作用の影響を受けることが初めて示された。F_0F_1-ATP合成酵素に関しては、新しい再構成法の開発により、好熱性酵素としては初めてATP合成反応の基質依存性や温度依存性を決定できた。脂質膜に再構成したF_0F_1のATP駆動回転によるプロトンポンプも顕微鏡下で可視化されつつある。
(3)その他
II型DNAトポイソメラーゼのprocessivityは、従来の報告と異なり有限で、約10秒たつと酵素はDNAから離れてしまうことを示した。Reverse gyraseによるDNA回転は、DNA中に相補性を欠くバブル領域を導入すると速くなる。しかしバブルをたくさん入れるほど速くなるわけではなく、何が速度を決めるのか検討中である。紡錘体(染色体分裂装置)が力学的操作に対して形状を保とうとするような応答を示すのは、微少管の脱重合やモーター活性が関わっていることが分かりつつある。

  • Research Products

    (53 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (12 results) (of which Peer Reviewed: 11 results) Presentation (40 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Direct observation of the myosin Va recovery stroke that contributes to unidirectional stepping along actin2011

    • Author(s)
      Shiroguchi, K., et al
    • Journal Title

      PLoS.Biol.

      Volume: 9 Pages: e1001031

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Two-dimensional periodic texture of actin filaments formed upon drying2011

    • Author(s)
      Honda, H., et al
    • Journal Title

      BIOPHYSICS

      Volume: 7 Pages: 11-19

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Torque-Induced Slip of the Rotary Motor F_1-ATPase2010

    • Author(s)
      Palanisami, A., et al
    • Journal Title

      Nano Lett.

      Volume: 10 Pages: 4146-4149

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulatory mechanism of length-dependent activation in skinnedporcine ventricular muscle : role of thin filament cooperative acti-vation in the Frank-Starling relation2010

    • Author(s)
      Terui, T., et al
    • Journal Title

      J.Gen.Physiol.

      Volume: 136 Pages: 469-482

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Modulation of the mechano-chemical properties of myosin V by drebrin-E2010

    • Author(s)
      Kubota, H., et al
    • Journal Title

      Biochem.Biopbys.Res.Commun.

      Volume: 400 Pages: 643-648

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular motors as an auto-oscillator2010

    • Author(s)
      Ishiwata, S., et al
    • Journal Title

      HFSP J.

      Volume: 4(3) Pages: 100-104

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A potential role of actin filament polymerization/depolymerizetion in smooth muscle contraction2010

    • Author(s)
      Watanabe, M., et al
    • Journal Title

      Adapt.Med.

      Volume: 2(1) Pages: 23-28

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Insights into the mechanisms of myosin and kinesin molecular motors from the single-molecule unbinding force measurements2010

    • Author(s)
      Mikhailenko, S.V., et al
    • Journal Title

      J Royal Soc.Interface

      Volume: 7 Pages: S295-306

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Key residues on microtubule responsible for activation of kinesin ATPase2010

    • Author(s)
      Uchimura, S., et al
    • Journal Title

      EMBO J.

      Volume: 29 Pages: 1167-1175

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Titin-based regulations of diastolic and systolic functions of mammalian cardiac muscle2010

    • Author(s)
      Fukuda, N., et al
    • Journal Title

      J.Mol.Cell.Cardiol.

      Volume: 48(5) Pages: 876-881

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Robust processivity of myosin-V under off-axis loads2010

    • Author(s)
      Oguchi, Y., et al
    • Journal Title

      Nature Chemical Biology

      Volume: 6(4) Pages: 300-305

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] F_1-ATPaseは回転軸がなくても回転する2010

    • Author(s)
      古池晶, 他
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 3(50) Pages: 120-121

  • [Presentation] ラット幼若心筋細胞におけるサルコメア振動の顕微解析-電気刺激及びSPOC条件下での検討2011

    • Author(s)
      新谷正嶺, 他
    • Organizer
      第88回日本生理学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20110328-20110330
  • [Presentation] In vivo心筋サルコメアイメージングの試み2011

    • Author(s)
      照井貴子, 他
    • Organizer
      第88回日本生理学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20110328-20110330
  • [Presentation] Stepping motion of myosin V : insights from the mutations in the converter2011

    • Author(s)
      Mikhailenko, S, V., et al
    • Organizer
      Biophysical Society 55^<th> Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Baltimore USA
    • Year and Date
      20110304-20110309
  • [Presentation] The force production by the depolymerization activity of MCAK2011

    • Author(s)
      Oguchi, Y., et al
    • Organizer
      Biophysical Society 55^<th> Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Baltimore, USA
    • Year and Date
      20110304-20110309
  • [Presentation] Microscopic heat pulse-induced calcium dynamics in a migratory cell2011

    • Author(s)
      Itoh, H., et al
    • Organizer
      Biophysical Society 55^<th> Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Baltimore, USA
    • Year and Date
      20110304-20110309
  • [Presentation] Microscopic analysis of sarcomenc oscillations in rat neonatal cardiomyocytes2011

    • Author(s)
      Shintani, S., et al
    • Organizer
      Biophysical Society 55^<th> Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Baltimore, USA
    • Year and Date
      20110304-20110309
  • [Presentation] Positional rearrangement of the mitotic spindle in a HeLa cell under steep temperature gradient2011

    • Author(s)
      Motoyoshi, M., et al
    • Organizer
      Biophysical Society 55^<th> Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Baltimore, USA
    • Year and Date
      20110304-20110309
  • [Presentation] F_1-ATPaseはどうやって回転するのだろう?2011

    • Author(s)
      木下一彦
    • Organizer
      生体運動研究合同班会議
    • Place of Presentation
      大阪市立大学,大阪
    • Year and Date
      20110107-20110109
  • [Presentation] F_1-ATPaseの回転軸変異体によるトルクの発生について2011

    • Author(s)
      千綿亮平, 他
    • Organizer
      生体運動研究合同班会議
    • Place of Presentation
      大阪市立大学,大阪
    • Year and Date
      20110107-20110109
  • [Presentation] 微小管脱重合因子MCAKは力を発生する2011

    • Author(s)
      小口祐伴, 他
    • Organizer
      生体運動研究合同班会議
    • Place of Presentation
      大阪市立大学,大阪
    • Year and Date
      20110107-20110109
  • [Presentation] 外部機械刺激による染色体分配の誘導2011

    • Author(s)
      板橋岳志, 他
    • Organizer
      生体運動研究合同班会議
    • Place of Presentation
      大阪市立大学,大阪
    • Year and Date
      20110107-20110109
  • [Presentation] 生体内の微小な温度変化の検出を目的とした蛍光ナノ温度計の創製2010

    • Author(s)
      高林昌生, 他
    • Organizer
      第32回日本バイオマテリアル学会大会
    • Place of Presentation
      広島
    • Year and Date
      20101129-20101130
  • [Presentation] Polymerization, strain and function of actin as a substrate for myosin motors2010

    • Author(s)
      Ishiwata, S., et al.
    • Organizer
      The 4th Mechano-Biology Workshop
    • Place of Presentation
      Singapore
    • Year and Date
      20101109-20101112
  • [Presentation] Impact of the off-axis loads on the processivity of myosin VI2010

    • Author(s)
      Mikhailenko, S, V., et al.
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Mechanobiology in muscle contraction2010

    • Author(s)
      石渡信一, 他
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台(招待)
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Temperature Dependence of Positive Supercoiling by Reverse Gyrase2010

    • Author(s)
      Ogawa T., et al
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Kinetic equivalence of ΔΨ and ΔpH in ATP synthesis by Bacillus BS3 F_0F_1-ATP synthase2010

    • Author(s)
      Soga N., et al
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Single-molecule analysis of the rotation of human F1-ATP2010

    • Author(s)
      Suzuki T., et al
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Microscopic measurement of periodic rigor cross-bridge formation and their unbinding force in rabbit skeletal myofibril2010

    • Author(s)
      鈴木団, 他
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Mechanical properties of MCAK, the microtubule-depolymerizing kinesin2010

    • Author(s)
      小口祐伴, 他
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Improvement of the yield of recombinant actin in the insect cell/baculovirus system to the high-density cell culture2010

    • Author(s)
      大木高志, 他
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Division of a mammalian cell is accelerated by external mechanical Impulse2010

    • Author(s)
      板橋岳志, 他
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Regulatory mechanism of the shape and size of the vertebrate meiotic spindle2010

    • Author(s)
      高木潤, 他
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] High-speed imaging of heat transfer single living cells2010

    • Author(s)
      大山廣太郎, 他
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Effect of tropomyosin and troponin on the single-molecule motility of myosin V2010

    • Author(s)
      石塚準司, 他
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Probing the mechanical properties of spindle poles at metaphase2010

    • Author(s)
      鈴木和也, 他
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Rotation of mitotic spindle in HeLa cell under steep temperature gradient2010

    • Author(s)
      元吉真広, 他
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Analysis of the motility characteristics of myosin VI constructs with mutations in the base region of the converter domain2010

    • Author(s)
      新井智実, 他
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Ca2+ response to microscopic heat pulses in a migrant cell2010

    • Author(s)
      伊藤秀城, 他
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Contribution of the microtubule dynamics to the robustness of the mitotic spindle2010

    • Author(s)
      谷田部聡, 他
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Microscopic analysis of spontaneous sarcomeric oscillations (SPOC) in neonatal cardiomyocytes2010

    • Author(s)
      新谷正嶺, 他
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Role of troponin in the contraction of striated muscle : The effect of partial exchange to cardiac troponin on SPOC in skeletal Myofibrils2010

    • Author(s)
      松原新, 他
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      20100920-20100922
  • [Presentation] Single-Molecule Studies of the Mechanics of Molecular Motors2010

    • Author(s)
      Kinosita, K., Jr.
    • Organizer
      6^<th> World Congress on Biomechanics
    • Place of Presentation
      Singapore Suntec Convention Centre, Singapore(Invited, Plenary)
    • Year and Date
      20100801-20100806
  • [Presentation] Rotations in molecular machines2010

    • Author(s)
      Kinosita, K., Jr.
    • Organizer
      1<st> Symposium on Frontiers of Biophysics
    • Place of Presentation
      Seoul National University, Korea(Invited)
    • Year and Date
      20100517-20100519
  • [Presentation] 心筋サルコメアのライブイメージングの試み2010

    • Author(s)
      福田紀男, 他
    • Organizer
      筋生理の集い
    • Place of Presentation
      東京慈恵会医科大学,東京
    • Year and Date
      2010-12-04
  • [Presentation] Rotating Protein Machines2010

    • Author(s)
      Kinosita, K., Jr.
    • Organizer
      International Soft Matter Conference 2010
    • Place of Presentation
      Universidad de Granada, Spain(Invited)
    • Year and Date
      2010-07-08
  • [Presentation] Single-Molecule Physiology2010

    • Author(s)
      Kinosita, K., Jr.
    • Organizer
      LAAS-CNRS
    • Place of Presentation
      CNRS, France
    • Year and Date
      2010-07-02
  • [Presentation] 横紋筋収縮系の自励振動(SPOC):現象と理論的枠組み2010

    • Author(s)
      石渡信一, 他
    • Organizer
      日本生理学会
    • Place of Presentation
      盛岡(招待)
    • Year and Date
      2010-05-20
  • [Presentation] 量子ドットを用いた心筋のサルコメアイメージング:心拍調節におけるSPOCの生理的意義2010

    • Author(s)
      福田紀男, 他
    • Organizer
      日本生理学会
    • Place of Presentation
      盛岡
    • Year and Date
      2010-05-20
  • [Presentation] 筋収縮自励振動現象(SPOC)の生理的意義:幼若心筋細胞を使った解析2010

    • Author(s)
      新谷正嶺, 他
    • Organizer
      ナノ学会第8回大会
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      2010-05-14
  • [Remarks] 新聞掲載:日経産業新聞(2011.03.08),日刊工業新聞(2011.03.08),京都新聞(2011.03.15)シンガポール時事速報(2010.09.16)

URL: 

Published: 2013-06-26  

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