2012 Fiscal Year Annual Research Report
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21247010
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| Research Institution | University of Tsukuba |
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Principal Investigator |
井上 勲 筑波大学, 生命環境系, 教授 (70168433)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
菊地 淳 独立行政法人理化学研究所, 植物科学研究センター, チームリーダー (00321753)
守屋 繁春 独立行政法人理化学研究所, 基幹研究所, 専任研究員 (00321828)
渡邉 信 筑波大学, 生命環境系, 教授 (10132870)
石田 健一郎 筑波大学, 生命環境系, 教授 (30282198)
中山 剛 筑波大学, 生命環境系, 講師 (40302369)
橋本 哲男 筑波大学, 生命環境系, 教授 (50208451)
稲垣 祐司 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (50387958)
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| Project Period (FY) |
2009-04-01 – 2013-03-31
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| Keywords | 環境 / 進化 / 分類学 / 生態学 / 原生生物 |
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| Research Abstract |
本研究は、藻類とプロティストで構成される未知の微生物複合系と，それらを取り巻く物質環境の多様性とその相互作用を，複合オミクスデータで網羅的に解明する研究基盤を構築することを目的としている。本年度は，平成22年度および平成23年度の東京湾沿岸サンプルを用いて，１）抽出方法を改良した核磁気共鳴法でのメタボローム解析，２）次世代シーケンサーを使用した環境メタゲノム解析，３）クロロフィル代謝物質（特に分解代謝物質）の色素分析，４）新規生物の系統分類学的解析を実施した。
環境メタボロームデータと，同海域から単離培養した藻類培養株のメタボロームデータと比較することで，環境水中から確認できた環境物質が，同時に存在していた優占生物に由来することを示すデータが得られ，核磁気共鳴法が多様な生物・成分で構成される環境水の変動解析に有効な手段である可能性を示した。一方，環境メタゲノム解析については，平成２２年４月から翌年3月までの１２ヶ月分（合計24サンプル）と，平成23年6月から8月の連続する数日間（合計24サンプル）について実施し，それぞれ真核微生物相の周年変動と夏期の赤潮発生期の短期変動を調査した。この結果，顕微鏡観察では把握できなかった多数のプロティストの季節変動が明らかとなり，これらと周囲の物理・化学的環境との相関についても把握した。さらに，これまで発生過程が不明瞭だったシクロフェオフォルバイドaエノール（cPPB-aE）というクロロフィル代謝物が，プロティストが藻類を捕食する際に産生されることを，確立したプロティストの2員培養株を用いた色素分析で明らかにした。そこで，これまでの環境試料についてクロロフィル色素分析を実施し，クロロフィル代謝分解物と環境メタゲノムデータとの相関解析を行い，cPPB-aEが藻類捕食性従属栄養生物の捕食活性を測る指標となる可能性を検証した。
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| Current Status of Research Progress |
Reason
24年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
24年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Multigene phylogenies of diverse Carpediemonas-like organisms identify the closest relatives of 'amitochndriate' diplomonads and retortamonads2012
Author(s)
Takishita K, Kolisko M, Komatsuzaki H, Yabuki A, Inagaki Y, Cepicka I, Smejkalova P, Silberman JD, Hashimoto T, Roger AJ, Simpson AGB.
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Journal Title
Protist
Volume: 163
Pages: 344-355
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] The phylogenetic position and mitochondrial genome sequence of the enigmatic discobid Tsukubamonas globosa.2012
Author(s)
Kamikawa R, Nishimura Y, Yabuki A, Kolisko M, Simpson A GB, Roger A J, Ken-ichiro Ishida, Hashimoto T, Inagaki Y.
Organizer
Protist2012
Place of Presentation
University of Oslo, Oslo, Norway
Year and Date
20120729-20120803
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[Book] 藻類ハンドブック2012
Author(s)
中山剛
Total Pages
14-17, 23-27, 46-55,89-92,97-103,325-326
Publisher
NTS
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[Book] 藻類ハンドブック2012
Author(s)
渡辺信
Total Pages
316-319,341-353,386-387,490-501,520-522,
Publisher
NTS
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