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2010 Fiscal Year Annual Research Report

マイクロRNAの発現・成熟に関わる分子の網羅的探索とその機能解析

Research Project

Project/Area Number 21310123
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

程 久美子  東京大学, 大学院・理学系研究科, 准教授 (50213327)

KeywordsmicroRNA / 遺伝子 / noncoding RNA / 発現調節 / プロセシング
Research Abstract

本研究では、マイクロRNA(microRNA)の発現・成熟を制御する機構を明らかにすることを目的としている。miRNAは、タンパク質をコードしないnoncodingRNAの一種で、メッセンジャーRNA(mRNA)の3'タンパク質非翻訳領域(3'UTR)に不完全に対合して、標的mRNAの翻訳を抑制する。これまでは、microRNAがどのような標的mRNAに対合して、その翻訳を抑制するのかという研究に焦点が当てられていたため、microRNAの発現・成熟過程についてはよくわかっていない。しかし、microRNAの発現および成熟過程の解析は、未知の多様な高次生命現象の解明には重要である。本研究では、この点に焦点を絞り、microRNAの発現・成熟に関わる機構について明らかにすることを目的とした。もともと細胞に内在的に存在するmicroRNAは、このような過程を経て細胞内のほぼすべてのRISCに取り込まれ、飽和していると考えられている。そのため、細胞外から導入した外来性microRNAは、RISC中の内在性microRNAと置換したとき、あるいは新規に合成されたRISCを内在性microRNAと奪い合って取り込まれたとき、初めてサイレンシング効果を示すと考えられる。すなわち、外来性microRNAはサイレンシングを誘導するだけでなく、内在性microRNAによるサイレンシングを抑制する作用があると考えられ、外来性microRNAの導入によるグローバルな遺伝子発現制御機構を理解するためには、外来性microRNAによるサイレンシング機構だけでなく、内在性microRNAによるサイレンシング抑制機構も明らかにする必要がある。
平成22年度の研究では、外来性miRNAによる内在性microRNAのサイレンシング効果抑制の機構についてレポーターアッセイおよびマイクロアレイによる解析を行なった。その結果、外来性miRNAの種類によって内在性microRNA活性の抑制の程度が異なると考えられる結果が得られた。さらに、このような違いが生じる原因を明らかにするために、内在性microRNA活性抑制効率の定量化を試みた。

  • Research Products

    (23 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (11 results) Book (4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Lacdinac (Galnacss1-4glcnac) Contributes to Self-Renewal of Mouse Embryonic Stem Cells by Regulating LIF/STAT3 Signaling2011

    • Author(s)
      Sasaki, N.
    • Journal Title

      Stem Cells

      Volume: 29 Pages: 641-650

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Robust and Photo-controllable DNA Capsules Using Azobenzenes2010

    • Author(s)
      Tanaka, F.
    • Journal Title

      Nano Lett.

      Volume: 10 Pages: 3560-3565

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Basic and clinical studies on functional RNA molecules for advanced medical technologies2010

    • Author(s)
      Takizawa, T.
    • Journal Title

      J.Nippon Med.Sch.

      Volume: 77 Pages: 71-79

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sunspot, a link between Wingless signaling and endoreplication in Drosophila2010

    • Author(s)
      Taniue, K.
    • Journal Title

      Development

      Volume: 137 Pages: 1755-1764

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Gene expression of Spag6 in chick central nervous system2010

    • Author(s)
      Hamada, T.
    • Journal Title

      Anat.Histol.Embryol.

      Volume: 39 Pages: 227-232

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reduced base-base interactions between the DNA seed and RNA target are the major determinants of a significant reduction in the off-target effect due to DNA-seed-containing siRNA2010

    • Author(s)
      Ui-Tei, K.
    • Journal Title

      Proceedings of the 2009 Micro-NanoMechatronics and Human Science (MHS2009)

      Pages: 298-304

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional shRNA expression system with reduced off-target effects2010

    • Author(s)
      Naito, Y.
    • Journal Title

      Proceedings of the 2009 Micro-NanoMechatronics and Human Science (MHS2009)

      Pages: 291-297

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Identification of Nuclear Export Signal and Nuclear Localization Signal in Human GW182 Family Proteins2010

    • Author(s)
      Nishi, K.
    • Organizer
      The 19th CDB Meeting "RNA Sciences in Cell and Developmental Biology
    • Place of Presentation
      RIKEN Center for Developmental Biology(神戸)
    • Year and Date
      20100510-20100512
  • [Presentation] siDirect 2.0 : an Updated Website to Select Functional, Target-specific siRNA with Reduced Seed-dependent Off-target Effect for Mammalian Functional Genomics2010

    • Author(s)
      Yuki, N.
    • Organizer
      The 19th CDB Meeting "RNA Sciences in Cell and Developmental Biology
    • Place of Presentation
      RIKEN Center for Developmental Biology(神戸)
    • Year and Date
      20100510-20100512
  • [Presentation] ヒトGW182タンパク質の核-細胞質間輸送機構の解析2010

    • Author(s)
      西賢二、田中愛、程久美子
    • Organizer
      BMB2010
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] miRNAサイレンシング活性を決める要因の検討2010

    • Author(s)
      高橋朋子、西賢二、善野修平、程久美子
    • Organizer
      BMB2010
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] siRNA非シード部位と二本鎖RNA結合タンパク質TRBPの相互作用2010

    • Author(s)
      日比生直樹、長田喜郎、内藤雄樹、西賢二、程久美子
    • Organizer
      BMB2010
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] 小分子RNA作用マシナリーの調節機構-内在性miRNAサイレンシングの外来性miRNAによる抑制とその定量化2010

    • Author(s)
      程久美子
    • Organizer
      新学術領域非コードRNA作用マシナリー第2回領域会議
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター
    • Year and Date
      2010-10-06
  • [Presentation] 2本鎖RNA結合タンパク質TRBPとsiRNA相互作用の解析2010

    • Author(s)
      高橋朋子
    • Organizer
      新学術領域非コードRNA作用マシナリー第2回領域会議
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター
    • Year and Date
      2010-10-06
  • [Presentation] 高いゲノム多様性をもつHIV-1を標的とする至適siRNAの設計2010

    • Author(s)
      内藤雄樹、程久美子
    • Organizer
      第20回日本数理生物学会年会
    • Place of Presentation
      北海道大学学術交流会館
    • Year and Date
      2010-09-16
  • [Presentation] ヒトGW182タンパク質における核外移行シグナル及び核移行シグナルの同定2010

    • Author(s)
      西賢二
    • Organizer
      第10回東京大学生命科学シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2010-05-01
  • [Presentation] siRNAのseed配列によるオフターゲット効果を最少とし、標的mRNA特異的抑制効果を示すsiRNA設計ウェブサーバの構築2010

    • Author(s)
      内藤雄樹
    • Organizer
      第10回東京大学生命科学シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2010-05-01
  • [Presentation] Modified siRNA is a powerful tool for mammalian gene silencing with significantly reduced off-target effect2010

    • Author(s)
      Ui-Tei, K.
    • Organizer
      The 3rd Pan Pacific Symposium on Stem Cells Research 2010
    • Place of Presentation
      Evergreen Laurel Hotel(台中),台湾(招待講演)
    • Year and Date
      2010-04-17
  • [Book] Gene Silencing : Theory Techniques and Applications2010

    • Author(s)
      Narikawa, K.
    • Total Pages
      287-319
    • Publisher
      Genome-wide identification and analysis of miRNAs complementary to upstream of mRNA transcription start sites
  • [Book] RNA工学の基礎と応用(普及版)2010

    • Author(s)
      内藤雄樹
    • Total Pages
      104-113
    • Publisher
      効率的なsiRNAの設計
  • [Book] 改訂第5版新遺伝子工学ハンドブック2010

    • Author(s)
      内藤雄樹
    • Total Pages
      209-214
    • Publisher
      培養細胞での遺伝子ノックダウン法哺乳類細胞での標的遺伝子を特異的にノックダウンできるsiRNAの選択法
  • [Book] 改訂第5版新遺伝子工学ハンドブック2010

    • Author(s)
      西賢二
    • Total Pages
      215-220
    • Publisher
      培養細胞での遺伝子ノックダウン法siRNAおよびmiRNAによる遺伝子ノックダウン
  • [Remarks]

    • URL

      http://ui-tei.rnai.jp/

URL: 

Published: 2013-06-26  

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