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2010 Fiscal Year Annual Research Report

A1蛋白質-テロメア-テロメレース 3者複合体の構造解析とテロメレース阻害法の開発

Research Project

Project/Area Number 21370047
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

片平 正人  京都大学, エネルギー理工学研究所, 教授 (70211844)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 永田 崇  横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 助教 (10415250)
Keywordsテロメレース / テロメア / A1タンパク質 / NMR / 立体構造 / RNA / DNA
Research Abstract

テロメレースは、テロメアDNAに作用してこれを伸長する事で癌の原因となっている。我々はhnRNP A1タンパク質(以下A1タンパク質)が、テロメアDNA及びテロメレースRNA(テロメレースの構成成分)と相互作用する事で、テロメレースの活性の発現を引き起こしている事を見出した。今年度は前年度に引き続きA1タンパク質-テロメアDNA-テロメレースRNA3者複合体の立体構造の解析を行った。構造解析に際しては、NOEに基づいたショートレンジの距離情報(約5Å)に加えて、ロングレンジの構造情報の抽出も類縁タンパク質を用いて試みた。MTSL分子をタンパク質のシステイン残基に結合させる事で常磁性中心を導入し、常磁性緩和促進(PRE)を観測する事により、ロングレンジの距離情報(約25Å)の抽出を行った。またタンパク質を配向させて残余双極子結合(RDC)を観測する事により、各コンポーネンの相対配向に関する情報の抽出を行った。A1(及び類縁)タンパク質はBD1、BD2の2つのドメインからなるので、本系で扱う3者複合体は、実際には4つのコンポーネントからなる。この様なマルチドメイン・マルチコンポーネントの系の構造決定をNMR法によって行う事は、これまで困難であった。通常の構造解析に用いられるNOEに基づいたショートレンジの距離情報には、各コンポーネント間の相対配置を直接規定する情報が含まれないのがその原因であった。各コンポーネント間にまたがるロングレンジの構造情報を抽出する事で、この問題を克服できると考え、解析を進行させている。またタンパク質に対して高い親和性を有するおとりの核酸(デコイ核酸)を、核酸の2次構造予測プログラムを用いながらデザインした。このデコイ核酸がA1タンパク質を引きつけてしまえば、A1タンパク質がテロメレースの活性の発現を引き起こす事が妨害され、結果的にテロメレースの活性が阻害されると考えている。

  • Research Products

    (17 results)

All 2011 2010

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (12 results)

  • [Journal Article] Study of a novel glycoconjugate, thiopeptidoglycan, and a novel polysaccharide lyase, thiopeptidoglycan lyase2011

    • Author(s)
      Kondo, K
    • Journal Title

      Internat.J.of Biolog.Macromol.

      Volume: VOL.48 Pages: 256-262

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Heat shock protein 70 inhibits HIV-1 Vif-mediated ubiquitination and degradation of APOBEC3G2011

    • Author(s)
      Sugiyama, R.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem

      Volume: (印刷中 掲載確定)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural aspects for the recognition of ATP by ribonucleopeptide receptors2011

    • Author(s)
      Nakano, S.
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc.

      Volume: VOL.133 Pages: 4567-4579

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Solubilization and structural determination of a glycoconjugate which is assembled into the sheath of Leptothrix cholodnii2010

    • Author(s)
      Takeda, M.
    • Journal Title

      Int.J.Biol.Macromol

      Volume: VOL.46 Pages: 206-211

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Solution structures of the trihelix DNA-binding domains of the wild-type and a phosphomimetic mutant of Arabidopsis GT-1, implying a mechanism for an increase in DNA-binding affinity through phosphorylation2010

    • Author(s)
      Nagata, T.
    • Journal Title

      Proteins

      Volume: VOL.78 Pages: 3033-3047

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Linkage analysis of lignin for lignocellulosic biorefinery2010

    • Author(s)
      Yoshioka, K.
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      ハワイコンベンションセンター(米国)
    • Year and Date
      2010-12-17
  • [Presentation] Unique quadruplex structure and interaction of r(GGAGGAGGAGGA) with protein2010

    • Author(s)
      Mashima, T.
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      ハワイコンベンションセンター(米国)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-12-16
  • [Presentation] Structure and interaction of an RNA aptamer with potential therapeutic use2010

    • Author(s)
      Mashima, T.
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      ハワイコンベンションセンター(米国)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-12-15
  • [Presentation] The real-time monitoring of the enzymatic reaction of an anti-HIV factor APOBEC3G2010

    • Author(s)
      Furukawa, A.
    • Organizer
      Korea-Japan Bilateral NMR Symposium
    • Place of Presentation
      ソウル大学(韓国)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-11-26
  • [Presentation] A mechanism for a increase in DNA-binding affinity of the trihelix DNA-binding domain via its phosphrylation2010

    • Author(s)
      Nagata, T.
    • Organizer
      The 37^<th> International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2010
    • Place of Presentation
      はまぎんホール(横浜市)
    • Year and Date
      2010-11-11
  • [Presentation] Structural aspects of the fluorescence intensity changes of the ATP-binding ribonucleopeptide sensor2010

    • Author(s)
      Nakano, S.
    • Organizer
      The 37^<th> International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2010
    • Place of Presentation
      はまぎんホール(横浜市)
    • Year and Date
      2010-11-11
  • [Presentation] Structure and interaction of RNA aptamer against prion protein in complex with the partial binding peptide2010

    • Author(s)
      Mashima, T.
    • Organizer
      The 37^<th> International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2010
    • Place of Presentation
      はまぎんホール(横浜市)
    • Year and Date
      2010-11-10
  • [Presentation] Real-time monitoring of the enzymatic reaction of APOBEC3G possessing anti-HIV activity, and the structure and interaction of the RNA aptamer against prion protein2010

    • Author(s)
      Furukawa, A.
    • Organizer
      The 10^<th> KIAS Conference on Protein Structure and Function
    • Place of Presentation
      International Conference Hall(韓国)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-10-01
  • [Presentation] The real-time monitoring of the enzymatic reaction of an anti-HIV factor APOBEC3G2010

    • Author(s)
      Furukawa, A.
    • Organizer
      XXIV International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • Place of Presentation
      Cairns Convention Centre Cairns(オーストラリア)
    • Year and Date
      2010-08-24
  • [Presentation] Real-time monitoring of the enzymatic reaction of APOBEC3G possessing anti-HIV activity, and the structure and interaction of the RNA aptamer against prion protein2010

    • Author(s)
      Mashima, T.
    • Organizer
      XXIV International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • Place of Presentation
      Cairns Convention Centre Cairns(オーストラリア)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-08-23
  • [Presentation] The analysis of the mechanism of an enzyme reaction toward the development of new energy systems2010

    • Author(s)
      Iwaoka, R.
    • Organizer
      The 2^<nd> International Symposium of Kyoto University Global COE Program-Zero Carbon Energy Kyoto 2010
    • Place of Presentation
      京都大学おうばくプラザ(宇治市)
    • Year and Date
      2010-08-19
  • [Presentation] Real-time monitoring of the enzymatic reaction of APOBEC3G possessing anti-HIV activity, and the structure of the RNA aptamer against prion protein2010

    • Author(s)
      Furukawa, A.
    • Organizer
      International Symposium of Korean Society of Biochemistry and Molecular Biology-Structural Biology and Drug Discovery-
    • Place of Presentation
      ソウル大学(韓国)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-05-18

URL: 

Published: 2012-07-19  

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