• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2009 Fiscal Year Annual Research Report

ルイス式血液型合成に関与するFUT2とFUT3の多型および相関解析

Research Project

Project/Area Number 21590750
Research InstitutionKurume University

Principal Investigator

副島 美貴子  Kurume University, 医学部, 助教 (80279140)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 神田 芳郎  久留米大学, 医学部, 教授 (90231307)
Keywordsルイス式血液型 / 分泌型 / DNA多型 / 糖鎖
Research Abstract

多検体を対象とした解析を簡便・迅速化する目的でリアルタイムPCR法を用いたFUT2とFUT3の不活性型アリルのtagSNPsの判定法を確立した。この方法を用いモンゴル人集団(946サンプル)を対象としてFUT2、FUT3の遺伝子型を決定し、それぞれの多型、予想される表現型と2型糖尿病、体格指標、臨床データとの関連解析をおこなった。その結果、FUT2、FUT3の変異、分泌型、ルイス式血液型は、2型糖尿病、体格指標、臨床データいずれとも有意な相関を示さなかった。
FUT2遺伝子座には遺伝子領域のコピー数の変化を伴う3つの組換え体(コピー数多型:CNVs)の存在が報告されており、CNVsの頻度が約30%と高い集団も存在しSNPs解析のみでは多様性の評価が不十分になる。しかし一般のPCR法ではCNVsの検出は不可能であり、既知のCNVs検出用のPCRでは新規のものは検出できない。そこで本研究計画ではリアルタイムPCR法を用い、FUT2の2領域のコントロール領域であるアルブミン遺伝子に対する相対コピー数を算定することによりCNVsを同定する(比較Ct法)システムの構築を試みた。その結果、これまでに報告されている3つのCNVsをタイプの異なる2グループに分類することが可能であった。現在改良ならびにさまざまな人集団のDNAについて解析をおこなっている。
DNAメチル化は遺伝子発現制御において重要な役割を果たしており、FUT3についてはプロモーター領域のメチル化のががん細胞で報告されている。ルイス式血液型の発現を理解する為に、培養細胞を用いFUT2のプロモーター領域についてメチル化状態とFUT2の発現との相関について調べている。Preliminaryな結果であるが近位のCpGサイトは発現している細胞でメチル化の程度が低いことが示唆された。今後詳細に解析をおこなう予定である。

  • Research Products

    (13 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (6 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Development and validation of a SYBR Green I-based real-time polymerase chain reaction method for detection of haptoglobin gene deletion in clinical materials2010

    • Author(s)
      Soejima M, Tsuchiya Y, Egashira K, Kawano H, Sagawa K, Koda Y.
    • Journal Title

      Transfusion. (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Global analysis of genetic variation in human arsenic(+3 oxidation state)methyltransferase(AS3MT)2009

    • Author(s)
      Fujihara J, Soejima M, Yasuda T, Koda Y, Agusa T, Kunito T, Tongu M, Yamada T, Takeshita H.
    • Journal Title

      Toxicol Appl Pharmacol. 243

      Pages: 292-299

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Haptoglobin polymorphism in Mongolian population : comparison of the two genotyping methods2009

    • Author(s)
      Nakamura H, Soejima M, Munkhtulga L, Iwamoto S, Koda Y.
    • Journal Title

      Clin Chim Acta. 191

      Pages: 236-239

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Simple and sensitive method for identification of human DNA by allele-specific polymerase chain reaction of FOXP22009

    • Author(s)
      Hiroshige K, Soejima M, Nishioka T, Kamimura S, Koda Y.
    • Journal Title

      J Forensic Sci. 54

      Pages: 857-861

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetic variation of FUT3 in Ghanaians, Caucasians, and Mongolians2009

    • Author(s)
      Soejima M, Munkhtulga L, Iwamoto S, Koda Y.
    • Journal Title

      Transfusion 49

      Pages: 959-966

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] TaqMan法を用いたFUT2の Copy Number Variation(CNV)検査法の確立2009

    • Author(s)
      副島美貴子, 神田芳郎
    • Organizer
      日本DNA多型学会第18回学術集会
    • Place of Presentation
      久留米市
    • Year and Date
      2009-11-20
  • [Presentation] CDGの検査で遭遇したトランスフエリンの二つの変異型2009

    • Author(s)
      湯浅勲, 松尾宗明, 副島美貴子, 神田芳郎
    • Organizer
      日本DNA多型学会第18回学術集会
    • Place of Presentation
      久留米市
    • Year and Date
      2009-11-20
  • [Presentation] Genotyping Method for Common Polymorphisms of Haptoglobin and Distribution of HP^<DEL> in Asia2009

    • Author(s)
      Koda Y, Soejima M.
    • Organizer
      XXth Regional Congress of the ISBT, Asia
    • Place of Presentation
      名古屋市
    • Year and Date
      2009-11-16
  • [Presentation] ハプトグロビン多型とモンゴル人集団における生活習慣病の相関解析2009

    • Author(s)
      神田芳郎, 副島美貴子, 上村繁雄, 岩本禎彦
    • Organizer
      第59回日本法医学会九州地方会
    • Place of Presentation
      佐賀市
    • Year and Date
      2009-10-02
  • [Presentation] Real-time PCRを用いたハプトグロビン遺伝子型判定-Hp Johnson の場合-2009

    • Author(s)
      副島美貴子, 岩本禎彦, 上村繁雄, 神田芳郎
    • Organizer
      第93次日本法医学会総会
    • Place of Presentation
      大阪市
    • Year and Date
      2009-05-14
  • [Presentation] DNASE Iexon 内SNP検索:アジア人において DNase I Gln222Argのみが多型性を有する2009

    • Author(s)
      藤原純子, 高塚尚和, 竹下治男, 神田芳郎, 副島美貴子, 小湊慶彦, 田島裕, 中島たみ子, 飯田礼子, 安田年博
    • Organizer
      第93次日本法医学会総会
    • Place of Presentation
      大阪市
    • Year and Date
      2009-05-14
  • [Book] DNA多型 Vol.172009

    • Author(s)
      副島美貴子, 神田芳郎
    • Total Pages
      296
    • Publisher
      東洋書店
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.med.kurume-u.ac.jp/med/foren/

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi